Protein–RNA interactions for Protein: Q13310

PABPC4, Polyadenylate-binding protein 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC4Q13310 PHB2-209ENST00000544134 652 ntTSL 323.38■■□□□ 1.338e-12■□□□□ 9.3
PABPC4Q13310 PHB2-214ENST00000546217 628 ntTSL 222.74■■□□□ 1.238e-12■□□□□ 9.3
PABPC4Q13310 RPS19BP1-204ENST00000472291 869 ntTSL 221.37■■□□□ 1.012e-6■□□□□ 9.3
PABPC4Q13310 PHB2-211ENST00000545167 908 ntTSL 521.26■□□□□ 0.998e-12■□□□□ 9.3
PABPC4Q13310 PHB2-204ENST00000536316 739 ntTSL 519.52■□□□□ 0.728e-12■□□□□ 9.3
PABPC4Q13310 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.588e-12■□□□□ 9.3
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PABPC4Q13310 TBRG4-212ENST00000483615 822 ntTSL 316.98■□□□□ 0.318e-12■□□□□ 9.3
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PABPC4Q13310 TNRC6A-203ENST00000450465 3700 ntTSL 29.3□□□□□ -0.928e-12■□□□□ 9.3
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PABPC4Q13310 CHMP5-202ENST00000419016 1957 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.12e-6■□□□□ 9.2
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PABPC4Q13310 NDUFS1-204ENST00000440274 2394 ntTSL 2 BASIC8.62□□□□□ -1.037e-8■□□□□ 9.2
PABPC4Q13310 NDUFS1-201ENST00000233190 11819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.147e-8■□□□□ 9.2
PABPC4Q13310 NDUFS1-207ENST00000455934 3361 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.377e-8■□□□□ 9.2
PABPC4Q13310 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.114e-19■□□□□ 9.2
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PABPC4Q13310 NCOA4-207ENST00000585132 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.721e-11■□□□□ 9.2
PABPC4Q13310 NCOA4-204ENST00000581486 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.021e-11■□□□□ 9.2
PABPC4Q13310 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.392e-10■□□□□ 9.2
PABPC4Q13310 RXRA-201ENST00000356384 5770 ntTSL 517.42■□□□□ 0.382e-10■□□□□ 9.2
PABPC4Q13310 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.372e-10■□□□□ 9.2
PABPC4Q13310 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.322e-10■□□□□ 9.2
PABPC4Q13310 TXNDC17-204ENST00000571957 392 ntTSL 216.17■□□□□ 0.182e-10■□□□□ 9.2
PABPC4Q13310 PMP22-203ENST00000395938 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 02e-10■□□□□ 9.2
PABPC4Q13310 AGL-203ENST00000361915 7368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.042e-10■□□□□ 9.2
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PABPC4Q13310 DLAT-201ENST00000280346 4458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.372e-10■□□□□ 9.2
PABPC4Q13310 AGL-201ENST00000294724 7446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.022e-10■□□□□ 9.2
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PABPC4Q13310 AGL-205ENST00000370163 7166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.772e-10■□□□□ 9.2
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PABPC4Q13310 AGL-208ENST00000637337 7179 ntTSL 1 (best)3.13□□□□□ -1.912e-10■□□□□ 9.2
PABPC4Q13310 AGL-204ENST00000370161 6923 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.932e-10■□□□□ 9.2
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PABPC4Q13310 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.032e-9■□□□□ 9.2
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PABPC4Q13310 CTCFL-201ENST00000243914 3567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.442e-9■□□□□ 9.2
PABPC4Q13310 CTCFL-207ENST00000429804 3864 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.52e-9■□□□□ 9.2
PABPC4Q13310 CTCFL-216ENST00000608263 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.582e-9■□□□□ 9.2
PABPC4Q13310 CTCFL-222ENST00000609232 3668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.652e-9■□□□□ 9.2
PABPC4Q13310 TOP1MT-206ENST00000518951 1461 ntTSL 524.52■■□□□ 1.521e-8■□□□□ 9.2
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PABPC4Q13310 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.385e-7■□□□□ 9.2
PABPC4Q13310 RAD23B-205ENST00000457811 811 ntTSL 37.66□□□□□ -1.185e-7■□□□□ 9.2
PABPC4Q13310 RAD23B-202ENST00000416373 3835 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.215e-7■□□□□ 9.2
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PABPC4Q13310 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.145e-9■□□□□ 9.2
PABPC4Q13310 COPS7A-218ENST00000543939 1728 ntTSL 322.11■■□□□ 1.135e-9■□□□□ 9.2
PABPC4Q13310 CIRBP-227ENST00000590188 361 ntTSL 321.65■■□□□ 1.065e-9■□□□□ 9.2
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PABPC4Q13310 CIRBP-203ENST00000444172 584 ntTSL 321.03■□□□□ 0.965e-9■□□□□ 9.2
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PABPC4Q13310 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.885e-9■□□□□ 9.2
PABPC4Q13310 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.855e-9■□□□□ 9.2
PABPC4Q13310 MRPL49-208ENST00000533943 688 ntTSL 319.4■□□□□ 0.75e-9■□□□□ 9.2
PABPC4Q13310 MRPL49-205ENST00000528529 752 ntTSL 319.14■□□□□ 0.655e-9■□□□□ 9.2
PABPC4Q13310 ETFB-203ENST00000593992 603 ntTSL 218.75■□□□□ 0.595e-9■□□□□ 9.2
PABPC4Q13310 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.493e-6■□□□□ 9.2
PABPC4Q13310 C1orf159-210ENST00000464905 650 ntTSL 317.84■□□□□ 0.455e-9■□□□□ 9.2
PABPC4Q13310 BUB1B-PAK6-202ENST00000453867 2490 ntTSL 217.39■□□□□ 0.375e-9■□□□□ 9.2
PABPC4Q13310 BUB1B-PAK6-204ENST00000559435 608 ntTSL 517.12■□□□□ 0.335e-9■□□□□ 9.2
PABPC4Q13310 PPIA-210ENST00000620047 827 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.235e-9■□□□□ 9.2
PABPC4Q13310 PPIA-201ENST00000355968 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.235e-9■□□□□ 9.2
PABPC4Q13310 PPIA-208ENST00000489459 907 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.235e-9■□□□□ 9.2
PABPC4Q13310 ZNRD1-203ENST00000376782 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.223e-6■□□□□ 9.2
PABPC4Q13310 MRPL49-209ENST00000534078 518 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.215e-9■□□□□ 9.2
PABPC4Q13310 RRAGA-201ENST00000380527 1589 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.195e-9■□□□□ 9.2
PABPC4Q13310 BUB1B-PAK6-203ENST00000558658 2620 ntTSL 215.05■□□□□ -05e-9■□□□□ 9.2
PABPC4Q13310 TNXB-202ENST00000442721 372 ntTSL 1 (best)14.69□□□□□ -0.065e-9■□□□□ 9.2
PABPC4Q13310 BUB1B-PAK6-201ENST00000441369 2767 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.065e-9■□□□□ 9.2
PABPC4Q13310 ZNRD1-204ENST00000376785 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.063e-6■□□□□ 9.2
PABPC4Q13310 COPS7A-201ENST00000229251 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.095e-9■□□□□ 9.2
PABPC4Q13310 ZNRD1-202ENST00000359374 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.23e-6■□□□□ 9.2
PABPC4Q13310 COPS7A-203ENST00000534877 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.265e-9■□□□□ 9.2
PABPC4Q13310 PKN2-203ENST00000370521 6121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.375e-9■□□□□ 9.2
PABPC4Q13310 PPIA-209ENST00000494484 2149 ntTSL 212.26□□□□□ -0.455e-9■□□□□ 9.2
PABPC4Q13310 ZNRD1-205ENST00000463141 571 ntTSL 212.16□□□□□ -0.463e-6■□□□□ 9.2
PABPC4Q13310 PPIA-202ENST00000415933 863 ntTSL 211.62□□□□□ -0.555e-9■□□□□ 9.2
PABPC4Q13310 ZNRD1-206ENST00000471008 3672 ntTSL 1 (best)11.4□□□□□ -0.583e-6■□□□□ 9.2
PABPC4Q13310 SMIM12-201ENST00000417239 684 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.655e-9■□□□□ 9.2
PABPC4Q13310 LDHAP3-201ENST00000448312 1008 ntBASIC10.67□□□□□ -0.75e-9■□□□□ 9.2
PABPC4Q13310 BUB1B-202ENST00000412359 3628 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.855e-9■□□□□ 9.2
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