RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000464905.1

C1orf159-210, Transcript of chromosome 1 open reading frame 159, humanhuman

TSL 3

Gene C1orf159, Length 650 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf159-210ENST00000464905 NISCHQ9Y2I1 1504 aa36.29■■■■□ 3.4
C1orf159-210ENST00000464905 ABCC9O60706 1549 aa33.36■■■□□ 2.93
C1orf159-210ENST00000464905 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa32.69■■■□□ 2.82
C1orf159-210ENST00000464905 DNAJC5BQ9UF47 199 aa31.74■■■□□ 2.67
C1orf159-210ENST00000464905 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa31.47■■■□□ 2.63
C1orf159-210ENST00000464905 NACADO15069 1562 aa31.13■■■□□ 2.57
C1orf159-210ENST00000464905 DCAF8L2P0C7V8 631 aa31.05■■■□□ 2.56
C1orf159-210ENST00000464905 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP31.04■■■□□ 2.56
C1orf159-210ENST00000464905 UNC13AQ9UPW8 1703 aa30.52■■■□□ 2.48
C1orf159-210ENST00000464905 MYO15BQ96JP2 1530 aa30.52■■■□□ 2.48
C1orf159-210ENST00000464905 BICRAQ9NZM4 1560 aa30.49■■■□□ 2.47
C1orf159-210ENST00000464905 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa30.13■■■□□ 2.41
C1orf159-210ENST00000464905 CECR2Q9BXF3 1484 aa30.12■■■□□ 2.41
C1orf159-210ENST00000464905 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa30.03■■■□□ 2.4
C1orf159-210ENST00000464905 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP29.95■■■□□ 2.39
C1orf159-210ENST00000464905 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa29.91■■■□□ 2.38
C1orf159-210ENST00000464905 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP29.86■■■□□ 2.37
C1orf159-210ENST00000464905 SCRIBQ14160 1630 aa29.84■■■□□ 2.37
C1orf159-210ENST00000464905 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa29.59■■■□□ 2.33
C1orf159-210ENST00000464905 CUX2O14529 1486 aa28.97■■■□□ 2.23
C1orf159-210ENST00000464905 ERCC6Q03468 1493 aa28.91■■■□□ 2.22
C1orf159-210ENST00000464905 NCAPD3P42695 1498 aa28.77■■■□□ 2.2
C1orf159-210ENST00000464905 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa28.6■■■□□ 2.17
C1orf159-210ENST00000464905 SMARCA2P51531 1590 aa28.5■■■□□ 2.15
C1orf159-210ENST00000464905 HMGXB3Q12766 1538 aa28.47■■■□□ 2.15
C1orf159-210ENST00000464905 NESP48681 1621 aa28.46■■■□□ 2.15
C1orf159-210ENST00000464905 SMARCA4P51532 1647 aa28.38■■■□□ 2.13
C1orf159-210ENST00000464905 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP28.34■■■□□ 2.13
C1orf159-210ENST00000464905 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP28.22■■■□□ 2.11
C1orf159-210ENST00000464905 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP28.21■■■□□ 2.11
C1orf159-210ENST00000464905 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa28.17■■■□□ 2.1
C1orf159-210ENST00000464905 TRIM41Q8WV44 630 aa28.15■■■□□ 2.1
C1orf159-210ENST00000464905 PDS5BQ9NTI5 1447 aa28.13■■■□□ 2.09
C1orf159-210ENST00000464905 PEG3Q9GZU2 1588 aa28.09■■■□□ 2.09
C1orf159-210ENST00000464905 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa27.96■■■□□ 2.07
C1orf159-210ENST00000464905 MROH2BQ7Z745 1585 aa27.94■■■□□ 2.06
C1orf159-210ENST00000464905 CADPSQ9ULU8 1353 aa27.92■■■□□ 2.06
C1orf159-210ENST00000464905 MRC2Q9UBG0 1479 aa27.87■■■□□ 2.05
C1orf159-210ENST00000464905 WDR62O43379 1518 aa27.77■■■□□ 2.04
C1orf159-210ENST00000464905 CEP164Q9UPV0 1460 aa27.66■■■□□ 2.02
C1orf159-210ENST00000464905 OSCARQ8IYS5 282 aa27.65■■■□□ 2.02
C1orf159-210ENST00000464905 FANCD2Q9BXW9 1451 aa27.58■■■□□ 2.01
C1orf159-210ENST00000464905 WIZO95785 1651 aa27.52■■■□□ 2
C1orf159-210ENST00000464905 CFTRP13569 1480 aa27.44■■□□□ 1.98
C1orf159-210ENST00000464905 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP27.34■■□□□ 1.97
C1orf159-210ENST00000464905 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP27.22■■□□□ 1.95
C1orf159-210ENST00000464905 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP27.21■■□□□ 1.95
C1orf159-210ENST00000464905 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa27.17■■□□□ 1.94
C1orf159-210ENST00000464905 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa27.17■■□□□ 1.94
C1orf159-210ENST00000464905 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa27.17■■□□□ 1.94
C1orf159-210ENST00000464905 IFT140Q96RY7 1462 aa27.13■■□□□ 1.93
C1orf159-210ENST00000464905 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP27.11■■□□□ 1.93
C1orf159-210ENST00000464905 ARHGEF11O15085 1522 aa27.1■■□□□ 1.93
C1orf159-210ENST00000464905 CYB5RLQ6IPT4 315 aa27.03■■□□□ 1.92
C1orf159-210ENST00000464905 TOPBP1Q92547 1522 aa26.96■■□□□ 1.91
C1orf159-210ENST00000464905 TRHP20396 242 aaPredicted RBP26.96■■□□□ 1.91
C1orf159-210ENST00000464905 CCDC88BA6NC98 1476 aa26.93■■□□□ 1.9
C1orf159-210ENST00000464905 ABCC8Q09428 1581 aa26.91■■□□□ 1.9
C1orf159-210ENST00000464905 PRDM2Q13029 1718 aa26.9■■□□□ 1.9
C1orf159-210ENST00000464905 FBLN2P98095 1184 aa26.88■■□□□ 1.89
C1orf159-210ENST00000464905 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP26.88■■□□□ 1.89
C1orf159-210ENST00000464905 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP26.83■■□□□ 1.895e-9■■■■■ 40.2
C1orf159-210ENST00000464905 DNMBPQ6XZF7 1577 aa26.8■■□□□ 1.88
C1orf159-210ENST00000464905 ARAP1Q96P48 1450 aa26.78■■□□□ 1.88
C1orf159-210ENST00000464905 CHD1O14646 1710 aa26.7■■□□□ 1.86
C1orf159-210ENST00000464905 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP26.68■■□□□ 1.86
C1orf159-210ENST00000464905 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP26.66■■□□□ 1.86
C1orf159-210ENST00000464905 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP26.61■■□□□ 1.85
C1orf159-210ENST00000464905 SOGA1O94964 1423 aa26.59■■□□□ 1.85
C1orf159-210ENST00000464905 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP26.59■■□□□ 1.85
C1orf159-210ENST00000464905 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa26.59■■□□□ 1.85
C1orf159-210ENST00000464905 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP26.58■■□□□ 1.85
C1orf159-210ENST00000464905 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa26.54■■□□□ 1.84
C1orf159-210ENST00000464905 CLASP1Q7Z460 1538 aa26.46■■□□□ 1.83
C1orf159-210ENST00000464905 SYNJ1O43426 1573 aa26.46■■□□□ 1.83
C1orf159-210ENST00000464905 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP26.44■■□□□ 1.82
C1orf159-210ENST00000464905 FGD5Q6ZNL6 1462 aa26.43■■□□□ 1.82
C1orf159-210ENST00000464905 WDR97A6NE52 1622 aa26.43■■□□□ 1.82
C1orf159-210ENST00000464905 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP26.42■■□□□ 1.82
C1orf159-210ENST00000464905 GRIN2BQ13224 1484 aa26.41■■□□□ 1.82
C1orf159-210ENST00000464905 SYNJ2O15056 1496 aa26.36■■□□□ 1.81
C1orf159-210ENST00000464905 GAPVD1Q14C86 1478 aa26.3■■□□□ 1.8
C1orf159-210ENST00000464905 CUX1P39880 1505 aa26.29■■□□□ 1.8
C1orf159-210ENST00000464905 PBRM1Q86U86 1689 aa26.09■■□□□ 1.77
C1orf159-210ENST00000464905 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa26.09■■□□□ 1.77
C1orf159-210ENST00000464905 GRIN2AQ12879 1464 aa26.04■■□□□ 1.76
C1orf159-210ENST00000464905 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa26.03■■□□□ 1.76
C1orf159-210ENST00000464905 ERCC6L2Q5T890 1561 aa26■■□□□ 1.75
C1orf159-210ENST00000464905 NUP160Q12769 1436 aa25.97■■□□□ 1.75
C1orf159-210ENST00000464905 CEP170Q5SW79 1584 aa25.95■■□□□ 1.75
C1orf159-210ENST00000464905 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP25.95■■□□□ 1.74
C1orf159-210ENST00000464905 ADAMTS12P58397 1594 aa25.9■■□□□ 1.74
C1orf159-210ENST00000464905 FHAD1B1AJZ9 1412 aa25.9■■□□□ 1.74
C1orf159-210ENST00000464905 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP25.81■■□□□ 1.72
C1orf159-210ENST00000464905 SHROOM2Q13796 1616 aa25.81■■□□□ 1.72
C1orf159-210ENST00000464905 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP25.78■■□□□ 1.72
C1orf159-210ENST00000464905 FAM69CQ0P6D2 419 aa25.77■■□□□ 1.72
C1orf159-210ENST00000464905 JPH4Q96JJ6 628 aa25.77■■□□□ 1.72
C1orf159-210ENST00000464905 ERICH3Q5RHP9 1530 aa25.75■■□□□ 1.71
C1orf159-210ENST00000464905 TOP2BQ02880 1626 aa25.7■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.9 ms