RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561711.1

RHOT2-202, Transcript of ras homolog family member T2, humanhuman

TSL 3

Gene RHOT2, Length 644 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOT2-202ENST00000561711 NISCHQ9Y2I1 1504 aa54.92■■■■■ 6.38
RHOT2-202ENST00000561711 ABCC9O60706 1549 aa49.33■■■■■ 5.49
RHOT2-202ENST00000561711 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa49.3■■■■■ 5.48
RHOT2-202ENST00000561711 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa46.96■■■■■ 5.11
RHOT2-202ENST00000561711 NACADO15069 1562 aa46.6■■■■■ 5.05
RHOT2-202ENST00000561711 DCAF8L2P0C7V8 631 aa46.51■■■■■ 5.04
RHOT2-202ENST00000561711 DNAJC5BQ9UF47 199 aa46.16■■■■■ 4.98
RHOT2-202ENST00000561711 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP45.93■■■■■ 4.947e-8■■■■□ 22
RHOT2-202ENST00000561711 MYO15BQ96JP2 1530 aa45.92■■■■■ 4.94
RHOT2-202ENST00000561711 UNC13AQ9UPW8 1703 aa45.85■■■■■ 4.93
RHOT2-202ENST00000561711 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP45.51■■■■■ 4.88
RHOT2-202ENST00000561711 BICRAQ9NZM4 1560 aa45.5■■■■■ 4.87
RHOT2-202ENST00000561711 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa45.34■■■■■ 4.85
RHOT2-202ENST00000561711 SCRIBQ14160 1630 aa44.97■■■■■ 4.79
RHOT2-202ENST00000561711 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa44.94■■■■■ 4.78
RHOT2-202ENST00000561711 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa44.53■■■■■ 4.72
RHOT2-202ENST00000561711 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP44.43■■■■■ 4.7
RHOT2-202ENST00000561711 CECR2Q9BXF3 1484 aa44.43■■■■■ 4.7
RHOT2-202ENST00000561711 NCAPD3P42695 1498 aa42.99■■■■■ 4.47
RHOT2-202ENST00000561711 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa42.87■■■■■ 4.45
RHOT2-202ENST00000561711 SMARCA4P51532 1647 aa42.86■■■■■ 4.45
RHOT2-202ENST00000561711 SMARCA2P51531 1590 aa42.81■■■■■ 4.44
RHOT2-202ENST00000561711 HMGXB3Q12766 1538 aa42.7■■■■■ 4.43
RHOT2-202ENST00000561711 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP42.67■■■■■ 4.42
RHOT2-202ENST00000561711 ERCC6Q03468 1493 aa42.65■■■■■ 4.42
RHOT2-202ENST00000561711 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP42.53■■■■■ 4.4
RHOT2-202ENST00000561711 CUX2O14529 1486 aa42.49■■■■■ 4.39
RHOT2-202ENST00000561711 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa42.43■■■■■ 4.38
RHOT2-202ENST00000561711 PEG3Q9GZU2 1588 aa42.39■■■■■ 4.38
RHOT2-202ENST00000561711 NESP48681 1621 aa42.35■■■■■ 4.37
RHOT2-202ENST00000561711 MROH2BQ7Z745 1585 aa42.31■■■■■ 4.36
RHOT2-202ENST00000561711 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa42.07■■■■■ 4.33
RHOT2-202ENST00000561711 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP41.9■■■■■ 4.3
RHOT2-202ENST00000561711 PDS5BQ9NTI5 1447 aa41.86■■■■■ 4.29
RHOT2-202ENST00000561711 WIZO95785 1651 aa41.84■■■■■ 4.29
RHOT2-202ENST00000561711 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa41.83■■■■■ 4.29
RHOT2-202ENST00000561711 CADPSQ9ULU8 1353 aa41.72■■■■■ 4.27
RHOT2-202ENST00000561711 MRC2Q9UBG0 1479 aa41.47■■■■■ 4.23
RHOT2-202ENST00000561711 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP41.44■■■■■ 4.23
RHOT2-202ENST00000561711 CEP164Q9UPV0 1460 aa41.34■■■■■ 4.21
RHOT2-202ENST00000561711 WDR62O43379 1518 aa41.34■■■■■ 4.21
RHOT2-202ENST00000561711 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP41.31■■■■■ 4.2
RHOT2-202ENST00000561711 FANCD2Q9BXW9 1451 aa41.28■■■■■ 4.2
RHOT2-202ENST00000561711 CFTRP13569 1480 aa41.22■■■■■ 4.19
RHOT2-202ENST00000561711 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP40.89■■■■■ 4.14
RHOT2-202ENST00000561711 PRDM2Q13029 1718 aa40.87■■■■■ 4.13
RHOT2-202ENST00000561711 CCDC88BA6NC98 1476 aa40.83■■■■■ 4.13
RHOT2-202ENST00000561711 TRIM41Q8WV44 630 aa40.69■■■■■ 4.1
RHOT2-202ENST00000561711 OSCARQ8IYS5 282 aa40.59■■■■■ 4.09
RHOT2-202ENST00000561711 IFT140Q96RY7 1462 aa40.49■■■■■ 4.07
RHOT2-202ENST00000561711 TOPBP1Q92547 1522 aa40.47■■■■■ 4.07
RHOT2-202ENST00000561711 ABCC8Q09428 1581 aa40.42■■■■■ 4.06
RHOT2-202ENST00000561711 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP40.4■■■■■ 4.06
RHOT2-202ENST00000561711 DNMBPQ6XZF7 1577 aa40.34■■■■■ 4.05
RHOT2-202ENST00000561711 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP40.2■■■■■ 4.03
RHOT2-202ENST00000561711 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP40.09■■■■■ 4.01
RHOT2-202ENST00000561711 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP40.06■■■■■ 4
RHOT2-202ENST00000561711 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP40.06■■■■■ 4
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RHOT2-202ENST00000561711 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa40.03■■■■■ 4
RHOT2-202ENST00000561711 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa40.03■■■■■ 4
RHOT2-202ENST00000561711 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa39.92■■■■□ 3.98
RHOT2-202ENST00000561711 CHD1O14646 1710 aa39.91■■■■□ 3.98
RHOT2-202ENST00000561711 ARHGEF11O15085 1522 aa39.91■■■■□ 3.98
RHOT2-202ENST00000561711 SOGA1O94964 1423 aa39.91■■■■□ 3.98
RHOT2-202ENST00000561711 FBLN2P98095 1184 aa39.9■■■■□ 3.98
RHOT2-202ENST00000561711 FGD5Q6ZNL6 1462 aa39.83■■■■□ 3.97
RHOT2-202ENST00000561711 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP39.83■■■■□ 3.97
RHOT2-202ENST00000561711 CUX1P39880 1505 aa39.76■■■■□ 3.96
RHOT2-202ENST00000561711 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP39.75■■■■□ 3.95
RHOT2-202ENST00000561711 WDR97A6NE52 1622 aa39.71■■■■□ 3.95
RHOT2-202ENST00000561711 CYB5RLQ6IPT4 315 aa39.66■■■■□ 3.94
RHOT2-202ENST00000561711 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa39.66■■■■□ 3.94
RHOT2-202ENST00000561711 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP39.57■■■■□ 3.93
RHOT2-202ENST00000561711 GRIN2BQ13224 1484 aa39.56■■■■□ 3.92
RHOT2-202ENST00000561711 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP39.55■■■■□ 3.92
RHOT2-202ENST00000561711 ARAP1Q96P48 1450 aa39.49■■■■□ 3.91
RHOT2-202ENST00000561711 SYNJ1O43426 1573 aa39.46■■■■□ 3.91
RHOT2-202ENST00000561711 GAPVD1Q14C86 1478 aa39.43■■■■□ 3.9
RHOT2-202ENST00000561711 SYNJ2O15056 1496 aa39.42■■■■□ 3.9
RHOT2-202ENST00000561711 PBRM1Q86U86 1689 aa39.41■■■■□ 3.9
RHOT2-202ENST00000561711 CLASP1Q7Z460 1538 aa39.4■■■■□ 3.9
RHOT2-202ENST00000561711 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa39.35■■■■□ 3.89
RHOT2-202ENST00000561711 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa39.29■■■■□ 3.88
RHOT2-202ENST00000561711 TRHP20396 242 aaPredicted RBP39.28■■■■□ 3.88
RHOT2-202ENST00000561711 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP39.24■■■■□ 3.87
RHOT2-202ENST00000561711 TOP2BQ02880 1626 aa39.15■■■■□ 3.86
RHOT2-202ENST00000561711 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa39.14■■■■□ 3.86
RHOT2-202ENST00000561711 GRIN2AQ12879 1464 aa39.04■■■■□ 3.84
RHOT2-202ENST00000561711 ADAMTS12P58397 1594 aa39.02■■■■□ 3.84
RHOT2-202ENST00000561711 FHAD1B1AJZ9 1412 aa38.92■■■■□ 3.82
RHOT2-202ENST00000561711 CEP170Q5SW79 1584 aa38.88■■■■□ 3.81
RHOT2-202ENST00000561711 ERICH3Q5RHP9 1530 aa38.88■■■■□ 3.81
RHOT2-202ENST00000561711 NUP160Q12769 1436 aa38.87■■■■□ 3.81
RHOT2-202ENST00000561711 ERCC6L2Q5T890 1561 aa38.79■■■■□ 3.8
RHOT2-202ENST00000561711 SHROOM2Q13796 1616 aa38.7■■■■□ 3.79
RHOT2-202ENST00000561711 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP38.55■■■■□ 3.76
RHOT2-202ENST00000561711 JPH4Q96JJ6 628 aa38.52■■■■□ 3.76
RHOT2-202ENST00000561711 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa38.46■■■■□ 3.75
RHOT2-202ENST00000561711 KIF27Q86VH2 1401 aa38.43■■■■□ 3.74
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