RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000332435.9

ZNRD1-201, Transcript of zinc ribbon domain containing 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ZNRD1, Length 864 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRD1-201ENST00000332435 NISCHQ9Y2I1 1504 aa36.42■■■■□ 3.42
ZNRD1-201ENST00000332435 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa32.29■■■□□ 2.76
ZNRD1-201ENST00000332435 ABCC9O60706 1549 aa31.49■■■□□ 2.63
ZNRD1-201ENST00000332435 DCAF8L2P0C7V8 631 aa30.5■■■□□ 2.47
ZNRD1-201ENST00000332435 NACADO15069 1562 aa30.42■■■□□ 2.46
ZNRD1-201ENST00000332435 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa30.41■■■□□ 2.46
ZNRD1-201ENST00000332435 MYO15BQ96JP2 1530 aa30.33■■■□□ 2.45
ZNRD1-201ENST00000332435 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP30.32■■■□□ 2.44
ZNRD1-201ENST00000332435 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa30.21■■■□□ 2.43
ZNRD1-201ENST00000332435 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP29.5■■■□□ 2.31
ZNRD1-201ENST00000332435 UNC13AQ9UPW8 1703 aa29.48■■■□□ 2.31
ZNRD1-201ENST00000332435 SCRIBQ14160 1630 aa29.38■■■□□ 2.29
ZNRD1-201ENST00000332435 BICRAQ9NZM4 1560 aa29.36■■■□□ 2.29
ZNRD1-201ENST00000332435 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa29.26■■■□□ 2.27
ZNRD1-201ENST00000332435 DNAJC5BQ9UF47 199 aa28.82■■■□□ 2.2
ZNRD1-201ENST00000332435 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP28.63■■■□□ 2.17
ZNRD1-201ENST00000332435 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa28.47■■■□□ 2.15
ZNRD1-201ENST00000332435 CECR2Q9BXF3 1484 aa28.34■■■□□ 2.13
ZNRD1-201ENST00000332435 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP28.24■■■□□ 2.11
ZNRD1-201ENST00000332435 SMARCA4P51532 1647 aa28.17■■■□□ 2.1
ZNRD1-201ENST00000332435 NCAPD3P42695 1498 aa28.1■■■□□ 2.09
ZNRD1-201ENST00000332435 SMARCA2P51531 1590 aa28.07■■■□□ 2.08
ZNRD1-201ENST00000332435 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa28.07■■■□□ 2.08
ZNRD1-201ENST00000332435 MROH2BQ7Z745 1585 aa28.01■■■□□ 2.07
ZNRD1-201ENST00000332435 PEG3Q9GZU2 1588 aa27.96■■■□□ 2.07
ZNRD1-201ENST00000332435 HMGXB3Q12766 1538 aa27.9■■■□□ 2.06
ZNRD1-201ENST00000332435 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP27.85■■■□□ 2.05
ZNRD1-201ENST00000332435 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP27.8■■■□□ 2.04
ZNRD1-201ENST00000332435 WIZO95785 1651 aa27.66■■■□□ 2.02
ZNRD1-201ENST00000332435 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP27.46■■□□□ 1.99
ZNRD1-201ENST00000332435 CADPSQ9ULU8 1353 aa27.3■■□□□ 1.96
ZNRD1-201ENST00000332435 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa27.3■■□□□ 1.96
ZNRD1-201ENST00000332435 NESP48681 1621 aa27.23■■□□□ 1.95
ZNRD1-201ENST00000332435 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP27.22■■□□□ 1.95
ZNRD1-201ENST00000332435 ERCC6Q03468 1493 aa27.21■■□□□ 1.95
ZNRD1-201ENST00000332435 PDS5BQ9NTI5 1447 aa27.2■■□□□ 1.94
ZNRD1-201ENST00000332435 CCDC88BA6NC98 1476 aa27.16■■□□□ 1.94
ZNRD1-201ENST00000332435 CFTRP13569 1480 aa27.12■■□□□ 1.93
ZNRD1-201ENST00000332435 FANCD2Q9BXW9 1451 aa26.92■■□□□ 1.9
ZNRD1-201ENST00000332435 CUX2O14529 1486 aa26.91■■□□□ 1.9
ZNRD1-201ENST00000332435 CEP164Q9UPV0 1460 aa26.87■■□□□ 1.89
ZNRD1-201ENST00000332435 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa26.85■■□□□ 1.89
ZNRD1-201ENST00000332435 MRC2Q9UBG0 1479 aa26.81■■□□□ 1.88
ZNRD1-201ENST00000332435 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP26.77■■□□□ 1.88
ZNRD1-201ENST00000332435 PRDM2Q13029 1718 aa26.74■■□□□ 1.87
ZNRD1-201ENST00000332435 WDR62O43379 1518 aa26.68■■□□□ 1.86
ZNRD1-201ENST00000332435 ABCC8Q09428 1581 aa26.63■■□□□ 1.85
ZNRD1-201ENST00000332435 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP26.58■■□□□ 1.85
ZNRD1-201ENST00000332435 TOPBP1Q92547 1522 aa26.47■■□□□ 1.83
ZNRD1-201ENST00000332435 DNMBPQ6XZF7 1577 aa26.44■■□□□ 1.82
ZNRD1-201ENST00000332435 IFT140Q96RY7 1462 aa26.35■■□□□ 1.81
ZNRD1-201ENST00000332435 CUX1P39880 1505 aa26.26■■□□□ 1.79
ZNRD1-201ENST00000332435 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP26.25■■□□□ 1.79
ZNRD1-201ENST00000332435 SOGA1O94964 1423 aa26.24■■□□□ 1.79
ZNRD1-201ENST00000332435 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP26.24■■□□□ 1.79
ZNRD1-201ENST00000332435 FGD5Q6ZNL6 1462 aa26.19■■□□□ 1.78
ZNRD1-201ENST00000332435 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP26.12■■□□□ 1.77
ZNRD1-201ENST00000332435 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa26.11■■□□□ 1.77
ZNRD1-201ENST00000332435 TOP2BQ02880 1626 aa26.1■■□□□ 1.77
ZNRD1-201ENST00000332435 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP26.1■■□□□ 1.77
ZNRD1-201ENST00000332435 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa26.06■■□□□ 1.76
ZNRD1-201ENST00000332435 WDR97A6NE52 1622 aa26.04■■□□□ 1.76
ZNRD1-201ENST00000332435 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP26.03■■□□□ 1.76
ZNRD1-201ENST00000332435 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP26.03■■□□□ 1.765e-6■■□□□ 14.3
ZNRD1-201ENST00000332435 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa26.02■■□□□ 1.76
ZNRD1-201ENST00000332435 SYNJ1O43426 1573 aa26.02■■□□□ 1.76
ZNRD1-201ENST00000332435 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa25.99■■□□□ 1.75
ZNRD1-201ENST00000332435 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP25.97■■□□□ 1.75
ZNRD1-201ENST00000332435 OSCARQ8IYS5 282 aa25.93■■□□□ 1.74
ZNRD1-201ENST00000332435 GRIN2BQ13224 1484 aa25.9■■□□□ 1.74
ZNRD1-201ENST00000332435 GAPVD1Q14C86 1478 aa25.9■■□□□ 1.74
ZNRD1-201ENST00000332435 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP25.82■■□□□ 1.72
ZNRD1-201ENST00000332435 FBLN2P98095 1184 aa25.79■■□□□ 1.72
ZNRD1-201ENST00000332435 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP25.79■■□□□ 1.72
ZNRD1-201ENST00000332435 TRIM41Q8WV44 630 aa25.79■■□□□ 1.72
ZNRD1-201ENST00000332435 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa25.77■■□□□ 1.72
ZNRD1-201ENST00000332435 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa25.76■■□□□ 1.71
ZNRD1-201ENST00000332435 KIF27Q86VH2 1401 aa25.73■■□□□ 1.71
ZNRD1-201ENST00000332435 SYNJ2O15056 1496 aa25.71■■□□□ 1.71
ZNRD1-201ENST00000332435 ERICH3Q5RHP9 1530 aa25.7■■□□□ 1.7
ZNRD1-201ENST00000332435 PBRM1Q86U86 1689 aa25.68■■□□□ 1.7
ZNRD1-201ENST00000332435 FHAD1B1AJZ9 1412 aa25.64■■□□□ 1.7
ZNRD1-201ENST00000332435 IGF1RP08069 1367 aa25.6■■□□□ 1.69
ZNRD1-201ENST00000332435 CHD1O14646 1710 aa25.57■■□□□ 1.68
ZNRD1-201ENST00000332435 GRIN2AQ12879 1464 aa25.52■■□□□ 1.68
ZNRD1-201ENST00000332435 ADAMTS12P58397 1594 aa25.52■■□□□ 1.68
ZNRD1-201ENST00000332435 CHIC1Q5VXU3 224 aa25.48■■□□□ 1.67
ZNRD1-201ENST00000332435 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa25.46■■□□□ 1.67
ZNRD1-201ENST00000332435 CUL7Q14999 1698 aa25.44■■□□□ 1.66
ZNRD1-201ENST00000332435 NUP160Q12769 1436 aa25.41■■□□□ 1.66
ZNRD1-201ENST00000332435 CLASP1Q7Z460 1538 aa25.39■■□□□ 1.66
ZNRD1-201ENST00000332435 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa25.36■■□□□ 1.65
ZNRD1-201ENST00000332435 EEA1Q15075 1411 aa25.36■■□□□ 1.65
ZNRD1-201ENST00000332435 CSRNP3Q8WYN3 585 aa25.32■■□□□ 1.64
ZNRD1-201ENST00000332435 ARHGEF11O15085 1522 aa25.31■■□□□ 1.64
ZNRD1-201ENST00000332435 CEP170Q5SW79 1584 aa25.31■■□□□ 1.64
ZNRD1-201ENST00000332435 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa25.29■■□□□ 1.64
ZNRD1-201ENST00000332435 JPH4Q96JJ6 628 aa25.28■■□□□ 1.64
ZNRD1-201ENST00000332435 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa25.26■■□□□ 1.63
ZNRD1-201ENST00000332435 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.9 ms