Protein–RNA interactions for Protein: Q16629

SRSF7, Serine/arginine-rich splicing factor 7, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF7Q16629 TARDBP-221ENST00000619555 682 ntTSL 58.63□□□□□ -1.032e-10■■■□□ 18.4
SRSF7Q16629 SMAP2-201ENST00000372708 2473 ntTSL 1 (best)8.45□□□□□ -1.066e-8■■■□□ 18.4
SRSF7Q16629 AL109811.4-201ENST00000614757 1793 ntTSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.152e-10■■■□□ 18.4
SRSF7Q16629 TARDBP-218ENST00000617172 980 ntTSL 57.52□□□□□ -1.212e-10■■■□□ 18.4
SRSF7Q16629 TARDBP-211ENST00000610369 563 ntTSL 57.52□□□□□ -1.212e-10■■■□□ 18.4
SRSF7Q16629 TARDBP-210ENST00000496840 692 ntTSL 37.27□□□□□ -1.252e-10■■■□□ 18.4
SRSF7Q16629 TARDBP-222ENST00000620505 657 ntTSL 56.78□□□□□ -1.322e-10■■■□□ 18.4
SRSF7Q16629 TARDBP-213ENST00000611963 739 ntTSL 56.73□□□□□ -1.332e-10■■■□□ 18.4
SRSF7Q16629 TARDBP-219ENST00000617757 434 ntTSL 36.7□□□□□ -1.342e-10■■■□□ 18.4
SRSF7Q16629 TARDBP-224ENST00000621573 992 ntTSL 36.5□□□□□ -1.372e-10■■■□□ 18.4
SRSF7Q16629 TARDBP-216ENST00000614494 515 ntTSL 55.58□□□□□ -1.522e-10■■■□□ 18.4
SRSF7Q16629 TARDBP-214ENST00000613177 379 ntTSL 35.15□□□□□ -1.592e-10■■■□□ 18.4
SRSF7Q16629 TARDBP-212ENST00000611008 929 ntTSL 54.98□□□□□ -1.612e-10■■■□□ 18.4
SRSF7Q16629 AL109811.4-203ENST00000612542 554 ntAPPRIS P1 TSL 53.73□□□□□ -1.812e-10■■■□□ 18.4
SRSF7Q16629 TARDBP-208ENST00000477447 409 ntTSL 53.73□□□□□ -1.812e-10■■■□□ 18.4
SRSF7Q16629 AL109811.4-204ENST00000622108 645 ntTSL 53.48□□□□□ -1.852e-10■■■□□ 18.4
SRSF7Q16629 AL109811.4-202ENST00000611136 700 ntTSL 53.37□□□□□ -1.872e-10■■■□□ 18.4
SRSF7Q16629 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.362e-6■■■□□ 18.4
SRSF7Q16629 NRSN2-204ENST00000492242 846 ntTSL 217.06■□□□□ 0.324e-10■■■□□ 18.3
SRSF7Q16629 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.014e-10■■■□□ 18.3
SRSF7Q16629 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.474e-10■■■□□ 18.3
SRSF7Q16629 NRSN2-208ENST00000609179 578 ntTSL 311.97□□□□□ -0.494e-10■■■□□ 18.3
SRSF7Q16629 NRSN2-209ENST00000609504 582 ntTSL 310.98□□□□□ -0.654e-10■■■□□ 18.3
SRSF7Q16629 NRSN2-205ENST00000608467 504 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.654e-10■■■□□ 18.3
SRSF7Q16629 NRSN2-203ENST00000470439 697 ntTSL 210.59□□□□□ -0.714e-10■■■□□ 18.3
SRSF7Q16629 SNRPG-207ENST00000480370 487 ntTSL 28.7□□□□□ -1.024e-8■■■□□ 18.1
SRSF7Q16629 SNRPG-208ENST00000482975 1093 ntTSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.084e-8■■■□□ 18.1
SRSF7Q16629 SNRPG-204ENST00000438261 515 ntTSL 2 BASIC7.72□□□□□ -1.174e-8■■■□□ 18.1
SRSF7Q16629 SNRPG-203ENST00000429728 566 ntTSL 27.04□□□□□ -1.284e-8■■■□□ 18.1
SRSF7Q16629 SNRPG-201ENST00000272348 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.424e-8■■■□□ 18.1
SRSF7Q16629 SNRPG-209ENST00000488400 393 ntTSL 25.86□□□□□ -1.474e-8■■■□□ 18.1
SRSF7Q16629 SNRPG-206ENST00000454893 527 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.674e-8■■■□□ 18.1
SRSF7Q16629 SNRPG-205ENST00000449935 428 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.954e-8■■■□□ 18.1
SRSF7Q16629 SNRPG-202ENST00000413456 398 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.954e-8■■■□□ 18.1
SRSF7Q16629 WDR27-202ENST00000441385 683 ntTSL 39.61□□□□□ -0.874e-10■■■□□ 18.1
SRSF7Q16629 WDR27-205ENST00000467418 947 ntTSL 58.36□□□□□ -1.074e-10■■■□□ 18.1
SRSF7Q16629 FKBP10-205ENST00000487489 578 ntTSL 214.04□□□□□ -0.161e-17■■■□□ 18.1
SRSF7Q16629 SH3PXD2A-203ENST00000369774 11468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.672e-7■■■□□ 18.1
SRSF7Q16629 SH3PXD2A-202ENST00000355946 11245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.262e-7■■■□□ 18.1
SRSF7Q16629 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.289e-15■■■□□ 18
SRSF7Q16629 XPO1-206ENST00000428210 6776 ntTSL 211.13□□□□□ -0.639e-15■■■□□ 18
SRSF7Q16629 XPO1-203ENST00000406957 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.289e-15■■■□□ 18
SRSF7Q16629 XPO1-209ENST00000443240 565 ntTSL 44.88□□□□□ -1.639e-15■■■□□ 18
SRSF7Q16629 XPO1-207ENST00000436018 318 ntTSL 43.32□□□□□ -1.889e-15■■■□□ 18
SRSF7Q16629 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.415e-9■■■□□ 18
SRSF7Q16629 WDR27-203ENST00000448612 3178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.745e-9■■■□□ 18
SRSF7Q16629 WDR27-211ENST00000546525 3511 ntTSL 1 (best)10.43□□□□□ -0.745e-9■■■□□ 18
SRSF7Q16629 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.258e-6■■■□□ 18
SRSF7Q16629 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.138e-6■■■□□ 18
SRSF7Q16629 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.018e-6■■■□□ 18
SRSF7Q16629 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.038e-6■■■□□ 18
SRSF7Q16629 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.068e-6■■■□□ 18
SRSF7Q16629 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.18e-6■■■□□ 18
SRSF7Q16629 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.168e-6■■■□□ 18
SRSF7Q16629 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.588e-6■■■□□ 18
SRSF7Q16629 EWSR1-212ENST00000444626 560 ntTSL 511.13□□□□□ -0.638e-6■■■□□ 18
SRSF7Q16629 EWSR1-213ENST00000447973 582 ntTSL 410.51□□□□□ -0.738e-6■■■□□ 18
SRSF7Q16629 EWSR1-210ENST00000436425 553 ntTSL 410.34□□□□□ -0.758e-6■■■□□ 18
SRSF7Q16629 EWSR1-217ENST00000483415 3231 ntTSL 1 (best)9□□□□□ -0.978e-6■■■□□ 18
SRSF7Q16629 EWSR1-211ENST00000437155 933 ntTSL 57.55□□□□□ -1.28e-6■■■□□ 18
SRSF7Q16629 EWSR1-214ENST00000455726 710 ntTSL 35.8□□□□□ -1.488e-6■■■□□ 18
SRSF7Q16629 EWSR1-219ENST00000485037 479 ntTSL 54.67□□□□□ -1.668e-6■■■□□ 18
SRSF7Q16629 EWSR1-209ENST00000415761 587 ntTSL 32.5□□□□□ -2.018e-6■■■□□ 18
SRSF7Q16629 SHANK3-202ENST00000414786 7394 ntTSL 516■□□□□ 0.153e-8■■■□□ 18
SRSF7Q16629 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.073e-8■■■□□ 18
SRSF7Q16629 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.23e-8■■■□□ 18
SRSF7Q16629 EIF3M-210ENST00000531921 1697 ntTSL 214.61□□□□□ -0.073e-6■■■□□ 17.9
SRSF7Q16629 EIF3M-211ENST00000532054 532 ntTSL 214.31□□□□□ -0.123e-6■■■□□ 17.9
SRSF7Q16629 EIF3M-212ENST00000532444 633 ntTSL 512.91□□□□□ -0.343e-6■■■□□ 17.9
SRSF7Q16629 EIF3M-201ENST00000323213 889 ntTSL 512.17□□□□□ -0.463e-6■■■□□ 17.9
SRSF7Q16629 EIF3M-213ENST00000533439 749 ntTSL 511.45□□□□□ -0.583e-6■■■□□ 17.9
SRSF7Q16629 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.643e-6■■■□□ 17.9
SRSF7Q16629 EIF3M-209ENST00000531186 565 ntTSL 210.57□□□□□ -0.723e-6■■■□□ 17.9
SRSF7Q16629 EIF3M-205ENST00000525782 2236 ntTSL 29.69□□□□□ -0.863e-6■■■□□ 17.9
SRSF7Q16629 EIF3M-202ENST00000524711 1645 ntTSL 28.05□□□□□ -1.123e-6■■■□□ 17.9
SRSF7Q16629 EIF3M-207ENST00000530026 769 ntTSL 26.1□□□□□ -1.433e-6■■■□□ 17.9
SRSF7Q16629 EIF3M-208ENST00000531120 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.683e-6■■■□□ 17.9
SRSF7Q16629 SRSF11-209ENST00000463877 617 ntTSL 222.42■■□□□ 1.183e-12■■■□□ 17.8
SRSF7Q16629 SRSF11-204ENST00000395136 1408 ntTSL 1 (best)20.97■□□□□ 0.953e-12■■■□□ 17.8
SRSF7Q16629 SRSF11-211ENST00000473950 796 ntTSL 519.03■□□□□ 0.643e-12■■■□□ 17.8
SRSF7Q16629 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.583e-12■■■□□ 17.8
SRSF7Q16629 SRSF11-212ENST00000475204 760 ntTSL 518.13■□□□□ 0.493e-12■■■□□ 17.8
SRSF7Q16629 SRSF11-210ENST00000469170 668 ntTSL 216.03■□□□□ 0.163e-12■■■□□ 17.8
SRSF7Q16629 WDR27-210ENST00000496752 1562 ntTSL 515.6■□□□□ 0.092e-8■■■□□ 17.8
SRSF7Q16629 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.412e-8■■■□□ 17.8
SRSF7Q16629 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.422e-8■■■□□ 17.8
SRSF7Q16629 HNRNPH3-207ENST00000480987 752 ntTSL 49.72□□□□□ -0.852e-8■■■□□ 17.8
SRSF7Q16629 WDR27-209ENST00000486490 492 ntTSL 59.28□□□□□ -0.922e-8■■■□□ 17.8
SRSF7Q16629 SRSF11-215ENST00000486667 662 ntTSL 58.72□□□□□ -1.013e-12■■■□□ 17.8
SRSF7Q16629 HNRNPH3-205ENST00000469172 3356 ntTSL 28.64□□□□□ -1.032e-8■■■□□ 17.8
SRSF7Q16629 SRSF11-202ENST00000370950 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.323e-12■■■□□ 17.8
SRSF7Q16629 HNRNPH3-204ENST00000467249 566 ntTSL 26.6□□□□□ -1.352e-8■■■□□ 17.8
SRSF7Q16629 HNRNPH3-203ENST00000461310 648 ntTSL 56.56□□□□□ -1.362e-8■■■□□ 17.8
SRSF7Q16629 HNRNPH3-209ENST00000486854 635 ntTSL 24.87□□□□□ -1.632e-8■■■□□ 17.8
SRSF7Q16629 EVA1A-209ENST00000486489 524 ntTSL 215.21■□□□□ 0.036e-6■■■□□ 17.8
SRSF7Q16629 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.16e-6■■■□□ 17.8
SRSF7Q16629 EVA1A-211ENST00000490746 589 ntTSL 513.74□□□□□ -0.216e-6■■■□□ 17.8
SRSF7Q16629 EVA1A-206ENST00000432649 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 313.08□□□□□ -0.326e-6■■■□□ 17.8
SRSF7Q16629 EVA1A-208ENST00000485891 479 ntTSL 512.64□□□□□ -0.396e-6■■■□□ 17.8
SRSF7Q16629 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.476e-6■■■□□ 17.8
Retrieved 100 of 5,030 protein–RNA pairs in 85.8 ms