Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ATP6AP1Q15904 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ATP6AP1Q15904 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ATP6AP1Q15904 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ATP6AP1Q15904 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ATP6AP1Q15904 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ATP6AP1Q15904 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ATP6AP1Q15904 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ATP6AP1Q15904 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ATP6AP1Q15904 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ATP6AP1Q15904 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ATP6AP1Q15904 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ATP6AP1Q15904 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ATP6AP1Q15904 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ATP6AP1Q15904 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ATP6AP1Q15904 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
ATP6AP1Q15904 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ATP6AP1Q15904 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ATP6AP1Q15904 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ATP6AP1Q15904 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ATP6AP1Q15904 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ATP6AP1Q15904 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ATP6AP1Q15904 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ATP6AP1Q15904 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ATP6AP1Q15904 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ATP6AP1Q15904 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ATP6AP1Q15904 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ATP6AP1Q15904 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ATP6AP1Q15904 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ATP6AP1Q15904 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ATP6AP1Q15904 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ATP6AP1Q15904 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ATP6AP1Q15904 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
ATP6AP1Q15904 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ATP6AP1Q15904 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ATP6AP1Q15904 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ATP6AP1Q15904 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ATP6AP1Q15904 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ATP6AP1Q15904 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ATP6AP1Q15904 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ATP6AP1Q15904 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ATP6AP1Q15904 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ATP6AP1Q15904 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ATP6AP1Q15904 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ATP6AP1Q15904 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ATP6AP1Q15904 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
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