RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000441749.1

CATIP-AS1-202, CATIP antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CATIP-AS1, Length 480 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CATIP-AS1-202ENST00000441749 NISCHQ9Y2I1 1504 aa45.87■■■■■ 4.93
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CATIP-AS1-202ENST00000441749 MYO15BQ96JP2 1530 aa38.31■■■■□ 3.72
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CATIP-AS1-202ENST00000441749 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa37.02■■■■□ 3.52
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CATIP-AS1-202ENST00000441749 SMARCA2P51531 1590 aa35.61■■■■□ 3.29
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CATIP-AS1-202ENST00000441749 MROH2BQ7Z745 1585 aa35.38■■■■□ 3.25
CATIP-AS1-202ENST00000441749 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP35.37■■■■□ 3.25
CATIP-AS1-202ENST00000441749 ERCC6Q03468 1493 aa35.28■■■■□ 3.24
CATIP-AS1-202ENST00000441749 NESP48681 1621 aa35.26■■■■□ 3.24
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CATIP-AS1-202ENST00000441749 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa34.96■■■■□ 3.19
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CATIP-AS1-202ENST00000441749 PDS5BQ9NTI5 1447 aa34.73■■■■□ 3.15
CATIP-AS1-202ENST00000441749 CADPSQ9ULU8 1353 aa34.73■■■■□ 3.15
CATIP-AS1-202ENST00000441749 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP34.69■■■■□ 3.14
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CATIP-AS1-202ENST00000441749 WDR62O43379 1518 aa34.4■■■■□ 3.1
CATIP-AS1-202ENST00000441749 CFTRP13569 1480 aa34.39■■■■□ 3.1
CATIP-AS1-202ENST00000441749 FANCD2Q9BXW9 1451 aa34.34■■■■□ 3.09
CATIP-AS1-202ENST00000441749 CEP164Q9UPV0 1460 aa34.33■■■■□ 3.09
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CATIP-AS1-202ENST00000441749 TOPBP1Q92547 1522 aa33.73■■■□□ 2.99
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CATIP-AS1-202ENST00000441749 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa33.2■■■□□ 2.91
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CATIP-AS1-202ENST00000441749 CHD1O14646 1710 aa33.19■■■□□ 2.9
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CATIP-AS1-202ENST00000441749 GRIN2BQ13224 1484 aa32.89■■■□□ 2.86
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CATIP-AS1-202ENST00000441749 SYNJ2O15056 1496 aa32.79■■■□□ 2.84
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CATIP-AS1-202ENST00000441749 CEP170Q5SW79 1584 aa32.41■■■□□ 2.78
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CATIP-AS1-202ENST00000441749 ERICH3Q5RHP9 1530 aa32.4■■■□□ 2.78
CATIP-AS1-202ENST00000441749 FHAD1B1AJZ9 1412 aa32.39■■■□□ 2.78
CATIP-AS1-202ENST00000441749 TRHP20396 242 aaPredicted RBP32.35■■■□□ 2.77
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CATIP-AS1-202ENST00000441749 SHROOM2Q13796 1616 aa32.26■■■□□ 2.75
CATIP-AS1-202ENST00000441749 IGF1RP08069 1367 aa32.06■■■□□ 2.72
CATIP-AS1-202ENST00000441749 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa32.05■■■□□ 2.72
CATIP-AS1-202ENST00000441749 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP32.05■■■□□ 2.72
CATIP-AS1-202ENST00000441749 JPH4Q96JJ6 628 aa32.03■■■□□ 2.72
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