RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000433628.2

CNNM2-203, Transcript of cyclin and CBS domain divalent metal cation transport mediator 2, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 2 BASIC

Gene CNNM2, Length 3,857 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNNM2-203ENST00000433628 NISCHQ9Y2I1 1504 aa28.87■■■□□ 2.21
CNNM2-203ENST00000433628 DCAF8L2P0C7V8 631 aa26.29■■□□□ 1.8
CNNM2-203ENST00000433628 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa26.13■■□□□ 1.77
CNNM2-203ENST00000433628 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP25.72■■□□□ 1.71
CNNM2-203ENST00000433628 HRCP23327 699 aa25.02■■□□□ 1.6
CNNM2-203ENST00000433628 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP24.79■■□□□ 1.56
CNNM2-203ENST00000433628 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP24.65■■□□□ 1.54
CNNM2-203ENST00000433628 PCGF6Q9BYE7 350 aa24.64■■□□□ 1.53
CNNM2-203ENST00000433628 EHMT2Q96KQ7 1210 aa24.39■■□□□ 1.5
CNNM2-203ENST00000433628 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP24.19■■□□□ 1.46
CNNM2-203ENST00000433628 MYO15BQ96JP2 1530 aa24.14■■□□□ 1.46
CNNM2-203ENST00000433628 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP24.05■■□□□ 1.44
CNNM2-203ENST00000433628 CHIC1Q5VXU3 224 aa24.04■■□□□ 1.44
CNNM2-203ENST00000433628 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa23.95■■□□□ 1.42
CNNM2-203ENST00000433628 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP23.92■■□□□ 1.42
CNNM2-203ENST00000433628 ABCC9O60706 1549 aa23.91■■□□□ 1.42
CNNM2-203ENST00000433628 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa23.86■■□□□ 1.41
CNNM2-203ENST00000433628 MYT1Q01538 1121 aa23.78■■□□□ 1.4
CNNM2-203ENST00000433628 TRIM41Q8WV44 630 aa23.63■■□□□ 1.37
CNNM2-203ENST00000433628 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP23.53■■□□□ 1.36
CNNM2-203ENST00000433628 SCRIBQ14160 1630 aa23.52■■□□□ 1.36
CNNM2-203ENST00000433628 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.35
CNNM2-203ENST00000433628 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa23.44■■□□□ 1.34
CNNM2-203ENST00000433628 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP23.33■■□□□ 1.32
CNNM2-203ENST00000433628 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP23.31■■□□□ 1.32
CNNM2-203ENST00000433628 NEUROD1Q13562 356 aa23.21■■□□□ 1.31
CNNM2-203ENST00000433628 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP23.18■■□□□ 1.3
CNNM2-203ENST00000433628 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa23.17■■□□□ 1.3
CNNM2-203ENST00000433628 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP23.11■■□□□ 1.29
CNNM2-203ENST00000433628 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP23.04■■□□□ 1.28
CNNM2-203ENST00000433628 CECR2Q9BXF3 1484 aa22.94■■□□□ 1.26
CNNM2-203ENST00000433628 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
CNNM2-203ENST00000433628 UBTFP17480 764 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
CNNM2-203ENST00000433628 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
CNNM2-203ENST00000433628 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa22.73■■□□□ 1.23
CNNM2-203ENST00000433628 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
CNNM2-203ENST00000433628 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
CNNM2-203ENST00000433628 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
CNNM2-203ENST00000433628 MROH2BQ7Z745 1585 aa22.65■■□□□ 1.22
CNNM2-203ENST00000433628 NACADO15069 1562 aa22.62■■□□□ 1.21
CNNM2-203ENST00000433628 BCL11AQ9H165 835 aa22.48■■□□□ 1.19
CNNM2-203ENST00000433628 WIZO95785 1651 aa22.46■■□□□ 1.19
CNNM2-203ENST00000433628 APLP2Q06481 763 aa22.41■■□□□ 1.18
CNNM2-203ENST00000433628 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
CNNM2-203ENST00000433628 CSRNP3Q8WYN3 585 aa22.25■■□□□ 1.15
CNNM2-203ENST00000433628 ABCC8Q09428 1581 aa22.24■■□□□ 1.15
CNNM2-203ENST00000433628 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
CNNM2-203ENST00000433628 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
CNNM2-203ENST00000433628 MIER1Q8N108 512 aa22.16■■□□□ 1.14
CNNM2-203ENST00000433628 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
CNNM2-203ENST00000433628 CCDC88BA6NC98 1476 aa22.14■■□□□ 1.14
CNNM2-203ENST00000433628 SOGA1O94964 1423 aa22.12■■□□□ 1.13
CNNM2-203ENST00000433628 ITGAEP38570 1179 aa22.1■■□□□ 1.13
CNNM2-203ENST00000433628 ANP32EQ9BTT0 268 aa22.08■■□□□ 1.13
CNNM2-203ENST00000433628 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa21.94■■□□□ 1.1
CNNM2-203ENST00000433628 SMARCA4P51532 1647 aa21.93■■□□□ 1.1
CNNM2-203ENST00000433628 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP21.91■■□□□ 1.1
CNNM2-203ENST00000433628 CEP162Q5TB80 1403 aa21.91■■□□□ 1.1
CNNM2-203ENST00000433628 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP21.89■■□□□ 1.1
CNNM2-203ENST00000433628 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
CNNM2-203ENST00000433628 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
CNNM2-203ENST00000433628 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
CNNM2-203ENST00000433628 P3H3Q8IVL6 736 aa21.84■■□□□ 1.09
CNNM2-203ENST00000433628 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa21.84■■□□□ 1.09
CNNM2-203ENST00000433628 SMARCA2P51531 1590 aa21.77■■□□□ 1.08
CNNM2-203ENST00000433628 BCANQ96GW7 911 aa21.68■■□□□ 1.06
CNNM2-203ENST00000433628 CLIP1P30622 1438 aa21.68■■□□□ 1.06
CNNM2-203ENST00000433628 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa21.68■■□□□ 1.06
CNNM2-203ENST00000433628 TNIKQ9UKE5 1360 aa21.66■■□□□ 1.06
CNNM2-203ENST00000433628 GOLGA3Q08378 1498 aa21.65■■□□□ 1.06
CNNM2-203ENST00000433628 UNC13AQ9UPW8 1703 aa21.59■■□□□ 1.05
CNNM2-203ENST00000433628 BICRAQ9NZM4 1560 aa21.58■■□□□ 1.04
CNNM2-203ENST00000433628 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
CNNM2-203ENST00000433628 ARID3CA6NKF2 412 aa21.55■■□□□ 1.04
CNNM2-203ENST00000433628 EEA1Q15075 1411 aa21.52■■□□□ 1.04
CNNM2-203ENST00000433628 CEP164Q9UPV0 1460 aa21.48■■□□□ 1.03
CNNM2-203ENST00000433628 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa21.48■■□□□ 1.03
CNNM2-203ENST00000433628 CLSPNQ9HAW4 1339 aa21.48■■□□□ 1.03
CNNM2-203ENST00000433628 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
CNNM2-203ENST00000433628 SYNJ1O43426 1573 aa21.4■■□□□ 1.02
CNNM2-203ENST00000433628 FKBP8Q14318 412 aa21.35■■□□□ 1.01
CNNM2-203ENST00000433628 ERICH6Q7L0X2 663 aa21.34■■□□□ 1.01
CNNM2-203ENST00000433628 KCNH8Q96L42 1107 aa21.34■■□□□ 1.01
CNNM2-203ENST00000433628 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP21.32■■□□□ 1
CNNM2-203ENST00000433628 KIF27Q86VH2 1401 aa21.31■■□□□ 1
CNNM2-203ENST00000433628 CUX2O14529 1486 aa21.28■■□□□ 1
CNNM2-203ENST00000433628 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP21.25■□□□□ 0.99
CNNM2-203ENST00000433628 VPS8Q8N3P4 1428 aa21.25■□□□□ 0.99
CNNM2-203ENST00000433628 FBLN2P98095 1184 aa21.21■□□□□ 0.99
CNNM2-203ENST00000433628 MSH5O43196 834 aa21.16■□□□□ 0.98
CNNM2-203ENST00000433628 DNAJC5BQ9UF47 199 aa21.16■□□□□ 0.98
CNNM2-203ENST00000433628 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP21.16■□□□□ 0.98
CNNM2-203ENST00000433628 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP21.15■□□□□ 0.98
CNNM2-203ENST00000433628 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP21.14■□□□□ 0.97
CNNM2-203ENST00000433628 NEFLP07196 543 aa21.13■□□□□ 0.97
CNNM2-203ENST00000433628 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa21.13■□□□□ 0.97
CNNM2-203ENST00000433628 CADPSQ9ULU8 1353 aa21.1■□□□□ 0.97
CNNM2-203ENST00000433628 NCAPD3P42695 1498 aa21.08■□□□□ 0.96
CNNM2-203ENST00000433628 CHIC2Q9UKJ5 165 aa21.06■□□□□ 0.96
CNNM2-203ENST00000433628 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP21.06■□□□□ 0.96
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