RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000457234.2

LIPE-AS1-201, LIPE antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LIPE-AS1, Length 1,501 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIPE-AS1-201ENST00000457234 NISCHQ9Y2I1 1504 aa39.17■■■■□ 3.86
LIPE-AS1-201ENST00000457234 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa34.74■■■■□ 3.15
LIPE-AS1-201ENST00000457234 ABCC9O60706 1549 aa33.71■■■□□ 2.99
LIPE-AS1-201ENST00000457234 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP32.69■■■□□ 2.82
LIPE-AS1-201ENST00000457234 DCAF8L2P0C7V8 631 aa32.65■■■□□ 2.82
LIPE-AS1-201ENST00000457234 NACADO15069 1562 aa32.57■■■□□ 2.8
LIPE-AS1-201ENST00000457234 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa32.55■■■□□ 2.8
LIPE-AS1-201ENST00000457234 MYO15BQ96JP2 1530 aa32.44■■■□□ 2.78
LIPE-AS1-201ENST00000457234 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa32.41■■■□□ 2.78
LIPE-AS1-201ENST00000457234 UNC13AQ9UPW8 1703 aa31.87■■■□□ 2.69
LIPE-AS1-201ENST00000457234 SCRIBQ14160 1630 aa31.72■■■□□ 2.67
LIPE-AS1-201ENST00000457234 BICRAQ9NZM4 1560 aa31.55■■■□□ 2.64
LIPE-AS1-201ENST00000457234 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP31.54■■■□□ 2.64
LIPE-AS1-201ENST00000457234 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa31.22■■■□□ 2.59
LIPE-AS1-201ENST00000457234 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP30.7■■■□□ 2.51
LIPE-AS1-201ENST00000457234 DNAJC5BQ9UF47 199 aa30.66■■■□□ 2.5
LIPE-AS1-201ENST00000457234 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa30.52■■■□□ 2.48
LIPE-AS1-201ENST00000457234 CECR2Q9BXF3 1484 aa30.48■■■□□ 2.47
LIPE-AS1-201ENST00000457234 SMARCA4P51532 1647 aa30.36■■■□□ 2.45
LIPE-AS1-201ENST00000457234 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP30.36■■■□□ 2.45
LIPE-AS1-201ENST00000457234 MROH2BQ7Z745 1585 aa30.2■■■□□ 2.42
LIPE-AS1-201ENST00000457234 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa30.09■■■□□ 2.41
LIPE-AS1-201ENST00000457234 SMARCA2P51531 1590 aa30.09■■■□□ 2.41
LIPE-AS1-201ENST00000457234 PEG3Q9GZU2 1588 aa30.04■■■□□ 2.4
LIPE-AS1-201ENST00000457234 NCAPD3P42695 1498 aa30.03■■■□□ 2.4
LIPE-AS1-201ENST00000457234 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP29.94■■■□□ 2.38
LIPE-AS1-201ENST00000457234 HMGXB3Q12766 1538 aa29.92■■■□□ 2.38
LIPE-AS1-201ENST00000457234 WIZO95785 1651 aa29.92■■■□□ 2.38
LIPE-AS1-201ENST00000457234 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP29.88■■■□□ 2.37
LIPE-AS1-201ENST00000457234 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP29.6■■■□□ 2.33
LIPE-AS1-201ENST00000457234 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP29.42■■■□□ 2.3
LIPE-AS1-201ENST00000457234 NESP48681 1621 aa29.25■■■□□ 2.27
LIPE-AS1-201ENST00000457234 CCDC88BA6NC98 1476 aa29.23■■■□□ 2.27
LIPE-AS1-201ENST00000457234 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa29.23■■■□□ 2.27
LIPE-AS1-201ENST00000457234 CADPSQ9ULU8 1353 aa29.17■■■□□ 2.26
LIPE-AS1-201ENST00000457234 CFTRP13569 1480 aa29.06■■■□□ 2.24
LIPE-AS1-201ENST00000457234 ERCC6Q03468 1493 aa29.05■■■□□ 2.24
LIPE-AS1-201ENST00000457234 PDS5BQ9NTI5 1447 aa29■■■□□ 2.23
LIPE-AS1-201ENST00000457234 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa28.96■■■□□ 2.23
LIPE-AS1-201ENST00000457234 PRDM2Q13029 1718 aa28.95■■■□□ 2.22
LIPE-AS1-201ENST00000457234 FANCD2Q9BXW9 1451 aa28.86■■■□□ 2.21
LIPE-AS1-201ENST00000457234 CEP164Q9UPV0 1460 aa28.8■■■□□ 2.2
LIPE-AS1-201ENST00000457234 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP28.76■■■□□ 2.19
LIPE-AS1-201ENST00000457234 MRC2Q9UBG0 1479 aa28.69■■■□□ 2.18
LIPE-AS1-201ENST00000457234 CUX2O14529 1486 aa28.61■■■□□ 2.17
LIPE-AS1-201ENST00000457234 WDR62O43379 1518 aa28.59■■■□□ 2.17
LIPE-AS1-201ENST00000457234 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP28.55■■■□□ 2.16
LIPE-AS1-201ENST00000457234 ABCC8Q09428 1581 aa28.44■■■□□ 2.14
LIPE-AS1-201ENST00000457234 TOPBP1Q92547 1522 aa28.43■■■□□ 2.14
LIPE-AS1-201ENST00000457234 DNMBPQ6XZF7 1577 aa28.43■■■□□ 2.14
LIPE-AS1-201ENST00000457234 CUX1P39880 1505 aa28.31■■■□□ 2.12
LIPE-AS1-201ENST00000457234 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP28.24■■■□□ 2.11
LIPE-AS1-201ENST00000457234 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP28.2■■■□□ 2.1
LIPE-AS1-201ENST00000457234 FGD5Q6ZNL6 1462 aa28.19■■■□□ 2.1
LIPE-AS1-201ENST00000457234 IFT140Q96RY7 1462 aa28.17■■■□□ 2.1
LIPE-AS1-201ENST00000457234 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa28.17■■■□□ 2.1
LIPE-AS1-201ENST00000457234 SYNJ1O43426 1573 aa28.16■■■□□ 2.1
LIPE-AS1-201ENST00000457234 TOP2BQ02880 1626 aa28.16■■■□□ 2.1
LIPE-AS1-201ENST00000457234 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP28.1■■■□□ 2.09
LIPE-AS1-201ENST00000457234 SOGA1O94964 1423 aa28.09■■■□□ 2.09
LIPE-AS1-201ENST00000457234 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa28.08■■■□□ 2.09
LIPE-AS1-201ENST00000457234 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP28.02■■■□□ 2.08
LIPE-AS1-201ENST00000457234 WDR97A6NE52 1622 aa27.96■■■□□ 2.07
LIPE-AS1-201ENST00000457234 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP27.96■■■□□ 2.07
LIPE-AS1-201ENST00000457234 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa27.91■■■□□ 2.06
LIPE-AS1-201ENST00000457234 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP27.9■■■□□ 2.06
LIPE-AS1-201ENST00000457234 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP27.89■■■□□ 2.06
LIPE-AS1-201ENST00000457234 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa27.79■■■□□ 2.04
LIPE-AS1-201ENST00000457234 GAPVD1Q14C86 1478 aa27.77■■■□□ 2.04
LIPE-AS1-201ENST00000457234 TRIM41Q8WV44 630 aa27.77■■■□□ 2.04
LIPE-AS1-201ENST00000457234 PBRM1Q86U86 1689 aa27.75■■■□□ 2.03
LIPE-AS1-201ENST00000457234 GRIN2BQ13224 1484 aa27.73■■■□□ 2.03
LIPE-AS1-201ENST00000457234 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa27.67■■■□□ 2.02
LIPE-AS1-201ENST00000457234 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP27.63■■■□□ 2.01
LIPE-AS1-201ENST00000457234 KIF27Q86VH2 1401 aa27.63■■■□□ 2.01
LIPE-AS1-201ENST00000457234 CHIC1Q5VXU3 224 aa27.59■■■□□ 2.01
LIPE-AS1-201ENST00000457234 ERICH3Q5RHP9 1530 aa27.59■■■□□ 2.01
LIPE-AS1-201ENST00000457234 CHD1O14646 1710 aa27.58■■■□□ 2.01
LIPE-AS1-201ENST00000457234 FBLN2P98095 1184 aa27.54■■■□□ 2
LIPE-AS1-201ENST00000457234 SYNJ2O15056 1496 aa27.52■■■□□ 2
LIPE-AS1-201ENST00000457234 ADAMTS12P58397 1594 aa27.51■■□□□ 1.99
LIPE-AS1-201ENST00000457234 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP27.49■■□□□ 1.99
LIPE-AS1-201ENST00000457234 OSCARQ8IYS5 282 aa27.48■■□□□ 1.99
LIPE-AS1-201ENST00000457234 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa27.46■■□□□ 1.99
LIPE-AS1-201ENST00000457234 FHAD1B1AJZ9 1412 aa27.45■■□□□ 1.99
LIPE-AS1-201ENST00000457234 IGF1RP08069 1367 aa27.45■■□□□ 1.99
LIPE-AS1-201ENST00000457234 CUL7Q14999 1698 aa27.42■■□□□ 1.98
LIPE-AS1-201ENST00000457234 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa27.4■■□□□ 1.98
LIPE-AS1-201ENST00000457234 GRIN2AQ12879 1464 aa27.38■■□□□ 1.97
LIPE-AS1-201ENST00000457234 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa27.31■■□□□ 1.96
LIPE-AS1-201ENST00000457234 EEA1Q15075 1411 aa27.27■■□□□ 1.96
LIPE-AS1-201ENST00000457234 CEP170Q5SW79 1584 aa27.24■■□□□ 1.95
LIPE-AS1-201ENST00000457234 CLASP1Q7Z460 1538 aa27.23■■□□□ 1.95
LIPE-AS1-201ENST00000457234 NUP160Q12769 1436 aa27.22■■□□□ 1.95
LIPE-AS1-201ENST00000457234 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP27.2■■□□□ 1.94
LIPE-AS1-201ENST00000457234 CSRNP3Q8WYN3 585 aa27.2■■□□□ 1.94
LIPE-AS1-201ENST00000457234 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa27.2■■□□□ 1.94
LIPE-AS1-201ENST00000457234 PRXQ9BXM0 1461 aa27.14■■□□□ 1.94
LIPE-AS1-201ENST00000457234 ARHGEF11O15085 1522 aa27.05■■□□□ 1.92
LIPE-AS1-201ENST00000457234 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa27.05■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 155.9 ms