RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000295688.7

CCT3-201, Transcript of chaperonin containing TCP1 subunit 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCT3, Length 2,150 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT3-201ENST00000295688 NISCHQ9Y2I1 1504 aa30.18■■■□□ 2.42
CCT3-201ENST00000295688 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa25.68■■□□□ 1.7
CCT3-201ENST00000295688 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa25.62■■□□□ 1.69
CCT3-201ENST00000295688 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP25.57■■□□□ 1.68
CCT3-201ENST00000295688 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP25.29■■□□□ 1.64
CCT3-201ENST00000295688 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa24.89■■□□□ 1.58
CCT3-201ENST00000295688 CHIC1Q5VXU3 224 aa24.8■■□□□ 1.56
CCT3-201ENST00000295688 DCAF8L2P0C7V8 631 aa24.74■■□□□ 1.55
CCT3-201ENST00000295688 MYO15BQ96JP2 1530 aa24.64■■□□□ 1.54
CCT3-201ENST00000295688 HRCP23327 699 aa24.46■■□□□ 1.51
CCT3-201ENST00000295688 PCGF6Q9BYE7 350 aa24.18■■□□□ 1.46
CCT3-201ENST00000295688 ABCC9O60706 1549 aa24.17■■□□□ 1.46
CCT3-201ENST00000295688 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa23.95■■□□□ 1.42
CCT3-201ENST00000295688 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP23.91■■□□□ 1.42
CCT3-201ENST00000295688 SCRIBQ14160 1630 aa23.89■■□□□ 1.42
CCT3-201ENST00000295688 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP23.83■■□□□ 1.41
CCT3-201ENST00000295688 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa23.77■■□□□ 1.4
CCT3-201ENST00000295688 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP23.67■■□□□ 1.38
CCT3-201ENST00000295688 NACADO15069 1562 aa23.67■■□□□ 1.38
CCT3-201ENST00000295688 TRIM41Q8WV44 630 aa23.66■■□□□ 1.38
CCT3-201ENST00000295688 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP23.55■■□□□ 1.36
CCT3-201ENST00000295688 CECR2Q9BXF3 1484 aa23.39■■□□□ 1.33
CCT3-201ENST00000295688 MROH2BQ7Z745 1585 aa23.39■■□□□ 1.33
CCT3-201ENST00000295688 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP23.31■■□□□ 1.32
CCT3-201ENST00000295688 WIZO95785 1651 aa23.28■■□□□ 1.32
CCT3-201ENST00000295688 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP23.26■■□□□ 1.31
CCT3-201ENST00000295688 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP23.12■■□□□ 1.29
CCT3-201ENST00000295688 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP23.02■■□□□ 1.27
CCT3-201ENST00000295688 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
CCT3-201ENST00000295688 EHMT2Q96KQ7 1210 aa22.98■■□□□ 1.27
CCT3-201ENST00000295688 SMARCA4P51532 1647 aa22.94■■□□□ 1.26
CCT3-201ENST00000295688 CCDC88BA6NC98 1476 aa22.85■■□□□ 1.25
CCT3-201ENST00000295688 SMARCA2P51531 1590 aa22.85■■□□□ 1.25
CCT3-201ENST00000295688 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP22.84■■□□□ 1.25
CCT3-201ENST00000295688 EEA1Q15075 1411 aa22.79■■□□□ 1.24
CCT3-201ENST00000295688 UNC13AQ9UPW8 1703 aa22.79■■□□□ 1.24
CCT3-201ENST00000295688 ABCC8Q09428 1581 aa22.78■■□□□ 1.24
CCT3-201ENST00000295688 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP22.72■■□□□ 1.23
CCT3-201ENST00000295688 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
CCT3-201ENST00000295688 TNIKQ9UKE5 1360 aa22.72■■□□□ 1.23
CCT3-201ENST00000295688 CEP162Q5TB80 1403 aa22.7■■□□□ 1.22
CCT3-201ENST00000295688 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
CCT3-201ENST00000295688 CSRNP3Q8WYN3 585 aa22.62■■□□□ 1.21
CCT3-201ENST00000295688 SOGA1O94964 1423 aa22.61■■□□□ 1.21
CCT3-201ENST00000295688 PEG3Q9GZU2 1588 aa22.56■■□□□ 1.2
CCT3-201ENST00000295688 GOLGA3Q08378 1498 aa22.55■■□□□ 1.2
CCT3-201ENST00000295688 UBTFP17480 764 aaKnown RBP22.49■■□□□ 1.19
CCT3-201ENST00000295688 BICRAQ9NZM4 1560 aa22.47■■□□□ 1.19
CCT3-201ENST00000295688 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa22.46■■□□□ 1.19
CCT3-201ENST00000295688 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
CCT3-201ENST00000295688 CEP164Q9UPV0 1460 aa22.41■■□□□ 1.18
CCT3-201ENST00000295688 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
CCT3-201ENST00000295688 KIF21BO75037 1637 aa22.41■■□□□ 1.18
CCT3-201ENST00000295688 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.17
CCT3-201ENST00000295688 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.17
CCT3-201ENST00000295688 SYNJ1O43426 1573 aa22.31■■□□□ 1.16
CCT3-201ENST00000295688 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP22.31■■□□□ 1.16
CCT3-201ENST00000295688 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
CCT3-201ENST00000295688 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa22.27■■□□□ 1.16
CCT3-201ENST00000295688 NEUROD1Q13562 356 aa22.26■■□□□ 1.15
CCT3-201ENST00000295688 CLIP1P30622 1438 aa22.25■■□□□ 1.15
CCT3-201ENST00000295688 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
CCT3-201ENST00000295688 VPS8Q8N3P4 1428 aa22.21■■□□□ 1.15
CCT3-201ENST00000295688 APLP2Q06481 763 aa22.15■■□□□ 1.14
CCT3-201ENST00000295688 TOP2BQ02880 1626 aa22.12■■□□□ 1.13
CCT3-201ENST00000295688 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa22.09■■□□□ 1.13
CCT3-201ENST00000295688 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa22.06■■□□□ 1.12
CCT3-201ENST00000295688 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa22.06■■□□□ 1.12
CCT3-201ENST00000295688 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
CCT3-201ENST00000295688 ERICH3Q5RHP9 1530 aa22.03■■□□□ 1.12
CCT3-201ENST00000295688 MYT1Q01538 1121 aa22.02■■□□□ 1.12
CCT3-201ENST00000295688 CLSPNQ9HAW4 1339 aa21.96■■□□□ 1.11
CCT3-201ENST00000295688 PRXQ9BXM0 1461 aa21.93■■□□□ 1.1
CCT3-201ENST00000295688 HMGXB3Q12766 1538 aa21.9■■□□□ 1.1
CCT3-201ENST00000295688 NCAPD3P42695 1498 aa21.85■■□□□ 1.09
CCT3-201ENST00000295688 ARAP1Q96P48 1450 aa21.84■■□□□ 1.09
CCT3-201ENST00000295688 MIER1Q8N108 512 aa21.83■■□□□ 1.09
CCT3-201ENST00000295688 KIF27Q86VH2 1401 aa21.81■■□□□ 1.08
CCT3-201ENST00000295688 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
CCT3-201ENST00000295688 CUX1P39880 1505 aa21.78■■□□□ 1.08
CCT3-201ENST00000295688 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP21.75■■□□□ 1.07
CCT3-201ENST00000295688 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP21.75■■□□□ 1.07
CCT3-201ENST00000295688 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP21.74■■□□□ 1.07
CCT3-201ENST00000295688 CFTRP13569 1480 aa21.72■■□□□ 1.07
CCT3-201ENST00000295688 CUX2O14529 1486 aa21.68■■□□□ 1.06
CCT3-201ENST00000295688 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP21.67■■□□□ 1.06
CCT3-201ENST00000295688 PRDM2Q13029 1718 aa21.66■■□□□ 1.06
CCT3-201ENST00000295688 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa21.62■■□□□ 1.05
CCT3-201ENST00000295688 CCNB3Q8WWL7 1395 aa21.61■■□□□ 1.05
CCT3-201ENST00000295688 MAP3K1Q13233 1512 aa21.58■■□□□ 1.05
CCT3-201ENST00000295688 IGF1RP08069 1367 aa21.49■■□□□ 1.03
CCT3-201ENST00000295688 TIAM1Q13009 1591 aa21.48■■□□□ 1.03
CCT3-201ENST00000295688 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa21.42■■□□□ 1.02
CCT3-201ENST00000295688 CADPSQ9ULU8 1353 aa21.42■■□□□ 1.02
CCT3-201ENST00000295688 FHAD1B1AJZ9 1412 aa21.4■■□□□ 1.02
CCT3-201ENST00000295688 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa21.4■■□□□ 1.02
CCT3-201ENST00000295688 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa21.38■■□□□ 1.01
CCT3-201ENST00000295688 SETD5Q9C0A6 1442 aa21.37■■□□□ 1.01
CCT3-201ENST00000295688 FGD5Q6ZNL6 1462 aa21.36■■□□□ 1.01
CCT3-201ENST00000295688 ITGAEP38570 1179 aa21.34■■□□□ 1.01
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