RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000394564.5

AKAP9-205, Transcript of A-kinase anchoring protein 9, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene AKAP9, Length 1,356 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AKAP9-205ENST00000394564 NISCHQ9Y2I1 1504 aa36.78■■■■□ 3.48
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AKAP9-205ENST00000394564 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa30.48■■■□□ 2.47
AKAP9-205ENST00000394564 DCAF8L2P0C7V8 631 aa30.36■■■□□ 2.45
AKAP9-205ENST00000394564 MYO15BQ96JP2 1530 aa30.24■■■□□ 2.43
AKAP9-205ENST00000394564 NACADO15069 1562 aa30.08■■■□□ 2.41
AKAP9-205ENST00000394564 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa29.85■■■□□ 2.37
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AKAP9-205ENST00000394564 SCRIBQ14160 1630 aa29.49■■■□□ 2.31
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AKAP9-205ENST00000394564 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP28.42■■■□□ 2.14
AKAP9-205ENST00000394564 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP28.42■■■□□ 2.14
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AKAP9-205ENST00000394564 SMARCA4P51532 1647 aa28.31■■■□□ 2.12
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AKAP9-205ENST00000394564 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP28.08■■■□□ 2.09
AKAP9-205ENST00000394564 PEG3Q9GZU2 1588 aa28.02■■■□□ 2.08
AKAP9-205ENST00000394564 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa27.93■■■□□ 2.06
AKAP9-205ENST00000394564 SMARCA2P51531 1590 aa27.92■■■□□ 2.06
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AKAP9-205ENST00000394564 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa27.73■■■□□ 2.03
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AKAP9-205ENST00000394564 CADPSQ9ULU8 1353 aa27.02■■□□□ 1.92
AKAP9-205ENST00000394564 PRDM2Q13029 1718 aa26.87■■□□□ 1.89
AKAP9-205ENST00000394564 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa26.84■■□□□ 1.89
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AKAP9-205ENST00000394564 ABCC8Q09428 1581 aa26.83■■□□□ 1.89
AKAP9-205ENST00000394564 NESP48681 1621 aa26.79■■□□□ 1.88
AKAP9-205ENST00000394564 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP26.75■■□□□ 1.87
AKAP9-205ENST00000394564 FANCD2Q9BXW9 1451 aa26.68■■□□□ 1.86
AKAP9-205ENST00000394564 PDS5BQ9NTI5 1447 aa26.65■■□□□ 1.86
AKAP9-205ENST00000394564 SYNJ1O43426 1573 aa26.62■■□□□ 1.85
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AKAP9-205ENST00000394564 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa26.55■■□□□ 1.84
AKAP9-205ENST00000394564 CUX1P39880 1505 aa26.54■■□□□ 1.84
AKAP9-205ENST00000394564 CEP164Q9UPV0 1460 aa26.54■■□□□ 1.84
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AKAP9-205ENST00000394564 MRC2Q9UBG0 1479 aa26.3■■□□□ 1.8
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AKAP9-205ENST00000394564 EEA1Q15075 1411 aa26.28■■□□□ 1.8
AKAP9-205ENST00000394564 ERCC6Q03468 1493 aa26.28■■□□□ 1.8
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AKAP9-205ENST00000394564 KIF27Q86VH2 1401 aa26.11■■□□□ 1.77
AKAP9-205ENST00000394564 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa26.11■■□□□ 1.77
AKAP9-205ENST00000394564 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa26.1■■□□□ 1.77
AKAP9-205ENST00000394564 CUX2O14529 1486 aa26.07■■□□□ 1.76
AKAP9-205ENST00000394564 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa26.07■■□□□ 1.76
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AKAP9-205ENST00000394564 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP26■■□□□ 1.75
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AKAP9-205ENST00000394564 EHMT2Q96KQ7 1210 aa25.83■■□□□ 1.73
AKAP9-205ENST00000394564 ERICH3Q5RHP9 1530 aa25.8■■□□□ 1.72
AKAP9-205ENST00000394564 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa25.78■■□□□ 1.72
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AKAP9-205ENST00000394564 GRIN2BQ13224 1484 aa25.7■■□□□ 1.7
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AKAP9-205ENST00000394564 ADAMTS12P58397 1594 aa25.56■■□□□ 1.68
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AKAP9-205ENST00000394564 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa25.52■■□□□ 1.68
AKAP9-205ENST00000394564 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP25.52■■□□□ 1.68
AKAP9-205ENST00000394564 SYNJ2O15056 1496 aa25.42■■□□□ 1.66
AKAP9-205ENST00000394564 CLIP1P30622 1438 aa25.41■■□□□ 1.66
AKAP9-205ENST00000394564 GRIN2AQ12879 1464 aa25.37■■□□□ 1.65
AKAP9-205ENST00000394564 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa25.37■■□□□ 1.65
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