Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY61

AATF, Protein AATF, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 560 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AATFQ9NY61 LRRC75A-AS1-217ENST00000497774 1662 ntTSL 515.86■□□□□ 0.134e-15■■■■■ 28.8
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AATFQ9NY61 LRRC75A-AS1-206ENST00000477249 891 ntTSL 515.78■□□□□ 0.124e-15■■■■■ 28.8
AATFQ9NY61 LRRC75A-AS1-208ENST00000480811 968 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.054e-15■■■■■ 28.8
AATFQ9NY61 LRRC75A-AS1-207ENST00000478103 712 ntTSL 312.74□□□□□ -0.374e-15■■■■■ 28.8
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AATFQ9NY61 LRRC75A-AS1-222ENST00000580770 572 ntTSL 412.14□□□□□ -0.474e-15■■■■■ 28.8
AATFQ9NY61 LRRC75A-AS1-201ENST00000460249 773 ntTSL 312.14□□□□□ -0.474e-15■■■■■ 28.8
AATFQ9NY61 LRRC75A-AS1-227ENST00000583400 712 ntTSL 412.08□□□□□ -0.484e-15■■■■■ 28.8
AATFQ9NY61 LRRC75A-AS1-223ENST00000581361 843 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.484e-15■■■■■ 28.8
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AATFQ9NY61 LRRC75A-AS1-210ENST00000481898 993 ntTSL 1 (best)9.03□□□□□ -0.964e-15■■■■■ 28.8
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AATFQ9NY61 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.481e-7■■■■■ 28.7
AATFQ9NY61 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.451e-7■■■■■ 28.7
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AATFQ9NY61 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.311e-7■■■■■ 28.7
AATFQ9NY61 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.281e-7■■■■■ 28.7
AATFQ9NY61 NPHP4-208ENST00000478423 4467 ntTSL 216.22■□□□□ 0.191e-7■■■■■ 28.7
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AATFQ9NY61 NPHP4-207ENST00000470763 3156 ntTSL 215.4■□□□□ 0.061e-7■■■■■ 28.7
AATFQ9NY61 NPHP4-203ENST00000378169 4213 ntTSL 1 (best)15.12■□□□□ 0.011e-7■■■■■ 28.7
AATFQ9NY61 NCOR2-201ENST00000356219 7226 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -01e-7■■■■■ 28.7
AATFQ9NY61 MAX-209ENST00000554709 327 ntTSL 414.83□□□□□ -0.041e-7■■■■■ 28.7
AATFQ9NY61 NCOR2-202ENST00000404121 7175 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.051e-7■■■■■ 28.7
AATFQ9NY61 MAX-216ENST00000556979 615 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.11e-7■■■■■ 28.7
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AATFQ9NY61 MAX-202ENST00000284165 3155 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.331e-7■■■■■ 28.7
AATFQ9NY61 MAX-213ENST00000556443 585 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.381e-7■■■■■ 28.7
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AATFQ9NY61 MBNL2-204ENST00000397601 4487 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.381e-7■■■■■ 28.7
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AATFQ9NY61 snoR1.1-201ENST00000628177 80 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.571e-323■■■■■ 28.4
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AATFQ9NY61 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.631e-10■■■■■ 27.8
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AATFQ9NY61 VPS8-204ENST00000424463 2359 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.881e-10■■■■■ 27.8
AATFQ9NY61 VPS8-210ENST00000446204 4721 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.971e-10■■■■■ 27.8
AATFQ9NY61 VPS8-201ENST00000287546 5047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.151e-10■■■■■ 27.8
AATFQ9NY61 VPS8-219ENST00000469479 583 ntTSL 45.6□□□□□ -1.511e-10■■■■■ 27.8
AATFQ9NY61 VPS8-212ENST00000452666 578 ntTSL 33.53□□□□□ -1.841e-10■■■■■ 27.8
AATFQ9NY61 CCNG2-203ENST00000497512 2051 ntTSL 1 (best)30.94■■■□□ 2.542e-7■■■■■ 27.8
AATFQ9NY61 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.82e-7■■■■■ 27.8
AATFQ9NY61 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.652e-7■■■■■ 27.8
AATFQ9NY61 CUX1-210ENST00000497815 947 ntTSL 214.38□□□□□ -0.111e-6■■■■■ 27.8
AATFQ9NY61 CUX1-202ENST00000292538 2930 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.261e-6■■■■■ 27.8
AATFQ9NY61 CUX1-212ENST00000547394 2878 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.331e-6■■■■■ 27.8
AATFQ9NY61 CUX1-204ENST00000393824 2331 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.391e-6■■■■■ 27.8
AATFQ9NY61 CUX1-221ENST00000622516 2990 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.431e-6■■■■■ 27.8
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AATFQ9NY61 CUX1-206ENST00000437600 3031 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.651e-6■■■■■ 27.8
AATFQ9NY61 CUX1-203ENST00000360264 13762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71e-6■■■■■ 27.8
AATFQ9NY61 CUX1-220ENST00000607092 559 ntTSL 37.68□□□□□ -1.181e-6■■■■■ 27.8
AATFQ9NY61 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.921e-7■■■■■ 27.7
AATFQ9NY61 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.851e-7■■■■■ 27.7
AATFQ9NY61 TNPO2-204ENST00000585886 2362 ntTSL 1 (best)18.64■□□□□ 0.581e-7■■■■■ 27.7
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