RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000266679.8

CPSF6-201, Transcript of cleavage and polyadenylation specific factor 6, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CPSF6, Length 2,229 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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CPSF6-201ENST00000266679 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa23.27■■□□□ 1.32
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CPSF6-201ENST00000266679 SMARCA2P51531 1590 aa21.28■■□□□ 1
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CPSF6-201ENST00000266679 CEP162Q5TB80 1403 aa20.17■□□□□ 0.82
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CPSF6-201ENST00000266679 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa19.87■□□□□ 0.77
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CPSF6-201ENST00000266679 FBLN2P98095 1184 aa19.76■□□□□ 0.75
CPSF6-201ENST00000266679 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP19.76■□□□□ 0.75
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