Protein–RNA interactions for Protein: O43251

RBFOX2, RNA binding protein fox-1 homolog 2, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 390 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBFOX2O43251 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.154e-10■■■■■ 35.5
RBFOX2O43251 CDK4-207ENST00000550419 919 ntTSL 313.77□□□□□ -0.214e-10■■■■■ 35.5
RBFOX2O43251 CDK4-210ENST00000551888 636 ntTSL 213.76□□□□□ -0.214e-10■■■■■ 35.5
RBFOX2O43251 CDK4-208ENST00000551706 984 ntTSL 1 (best)13.61□□□□□ -0.234e-10■■■■■ 35.5
RBFOX2O43251 CDK4-209ENST00000551800 773 ntTSL 512.81□□□□□ -0.364e-10■■■■■ 35.5
RBFOX2O43251 CDK4-204ENST00000547281 825 ntTSL 312.39□□□□□ -0.434e-10■■■■■ 35.5
RBFOX2O43251 CDK4-215ENST00000553237 952 ntTSL 212.08□□□□□ -0.484e-10■■■■■ 35.5
RBFOX2O43251 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.514e-10■■■■■ 35.5
RBFOX2O43251 CDK4-203ENST00000546489 776 ntTSL 510.37□□□□□ -0.754e-10■■■■■ 35.5
RBFOX2O43251 CDK4-212ENST00000552388 694 ntTSL 310.37□□□□□ -0.754e-10■■■■■ 35.5
RBFOX2O43251 CDK4-214ENST00000552862 447 ntTSL 39.48□□□□□ -0.894e-10■■■■■ 35.5
RBFOX2O43251 ARID1B-209ENST00000494260 696 ntTSL 38.64□□□□□ -1.034e-10■■■■■ 35.5
RBFOX2O43251 MAPK15-205ENST00000475376 351 ntTSL 37.39□□□□□ -1.239e-8■■■■■ 35.5
RBFOX2O43251 CDK4-211ENST00000552254 769 ntTSL 27.17□□□□□ -1.264e-10■■■■■ 35.5
RBFOX2O43251 ARID1B-217ENST00000636607 406 ntTSL 35.16□□□□□ -1.584e-10■■■■■ 35.5
RBFOX2O43251 ARID1B-233ENST00000637910 576 ntTSL 25.1□□□□□ -1.594e-10■■■■■ 35.5
RBFOX2O43251 CNOT2-227ENST00000551043 2288 ntTSL 215.69■□□□□ 0.15e-9■■■■■ 35.5
RBFOX2O43251 CNOT2-209ENST00000548159 2549 ntTSL 1 (best)13.22□□□□□ -0.295e-9■■■■■ 35.5
RBFOX2O43251 CNOT2-202ENST00000418359 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.845e-9■■■■■ 35.5
RBFOX2O43251 CNOT2-223ENST00000550160 993 ntTSL 59.42□□□□□ -0.95e-9■■■■■ 35.5
RBFOX2O43251 IL6ST-206ENST00000381298 9057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.962e-6■■■■■ 35.5
RBFOX2O43251 CNOT2-201ENST00000229195 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.995e-9■■■■■ 35.5
RBFOX2O43251 CNOT2-240ENST00000552599 2360 ntTSL 25.87□□□□□ -1.475e-9■■■■■ 35.5
RBFOX2O43251 CNOT2-231ENST00000551483 4753 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.865e-9■■■■■ 35.5
RBFOX2O43251 CNOT2-203ENST00000546673 726 ntTSL 32.64□□□□□ -1.995e-9■■■■■ 35.5
RBFOX2O43251 IL6ST-201ENST00000336909 8776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.07□□□□□ -2.082e-6■■■■■ 35.5
RBFOX2O43251 CNOT2-211ENST00000548338 355 ntTSL 51.73□□□□□ -2.135e-9■■■■■ 35.5
RBFOX2O43251 CNOT2-216ENST00000548939 552 ntTSL 21.57□□□□□ -2.165e-9■■■■■ 35.5
RBFOX2O43251 IL6ST-203ENST00000381287 8667 ntTSL 5 BASIC0.97□□□□□ -2.252e-6■■■■■ 35.5
RBFOX2O43251 LRCH4-210ENST00000498539 819 ntTSL 311.71□□□□□ -0.538e-17■■■■■ 35.5
RBFOX2O43251 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.091e-7■■■■■ 35.5
RBFOX2O43251 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.311e-7■■■■■ 35.5
RBFOX2O43251 ATP9B-211ENST00000587878 344 ntTSL 33.67□□□□□ -1.824e-10■■■■■ 35.5
RBFOX2O43251 ATP9B-205ENST00000585674 526 ntTSL 43.21□□□□□ -1.94e-10■■■■■ 35.5
RBFOX2O43251 BMP4-205ENST00000558984 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.73e-11■■■■■ 35.5
RBFOX2O43251 BMP4-204ENST00000558961 495 ntTSL 38.66□□□□□ -1.023e-11■■■■■ 35.5
RBFOX2O43251 BMP4-207ENST00000559501 1112 ntTSL 28.66□□□□□ -1.023e-11■■■■■ 35.5
RBFOX2O43251 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.133e-8■■■■■ 35.4
RBFOX2O43251 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.433e-8■■■■■ 35.4
RBFOX2O43251 GGA2-209ENST00000567201 576 ntTSL 44.55□□□□□ -1.682e-9■■■■■ 35.4
RBFOX2O43251 MAGI1-207ENST00000470990 2138 ntTSL 1 (best)6.53□□□□□ -1.363e-8■■■■■ 35.4
RBFOX2O43251 MSLN-203ENST00000561896 1195 ntTSL 519.51■□□□□ 0.714e-9■■■■■ 35.4
RBFOX2O43251 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.244e-9■■■■■ 35.4
RBFOX2O43251 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.194e-9■■■■■ 35.4
RBFOX2O43251 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.094e-9■■■■■ 35.4
RBFOX2O43251 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.054e-9■■■■■ 35.4
RBFOX2O43251 MSLN-206ENST00000566269 1068 ntTSL 313.69□□□□□ -0.224e-9■■■■■ 35.4
RBFOX2O43251 ARHGAP17-215ENST00000575283 2213 ntTSL 210.96□□□□□ -0.657e-8■■■■■ 35.3
RBFOX2O43251 ARHGAP17-210ENST00000572314 4966 ntTSL 27.84□□□□□ -1.157e-8■■■■■ 35.3
RBFOX2O43251 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.162e-20■■■■■ 35.3
RBFOX2O43251 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.192e-20■■■■■ 35.3
RBFOX2O43251 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.252e-20■■■■■ 35.3
RBFOX2O43251 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.282e-20■■■■■ 35.3
RBFOX2O43251 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.292e-20■■■■■ 35.3
RBFOX2O43251 SURF4-201ENST00000371982 553 ntTSL 310.95□□□□□ -0.662e-20■■■■■ 35.3
RBFOX2O43251 SURF4-203ENST00000371991 715 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.782e-20■■■■■ 35.3
RBFOX2O43251 SURF4-205ENST00000467910 693 ntTSL 510.01□□□□□ -0.812e-20■■■■■ 35.3
RBFOX2O43251 GALNS-203ENST00000562593 5682 ntTSL 1 (best)13.82□□□□□ -0.25e-7■■■■■ 35.3
RBFOX2O43251 PLXNB1-213ENST00000473996 1034 ntTSL 211.8□□□□□ -0.526e-10■■■■■ 35.3
RBFOX2O43251 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.429e-7■■■■■ 35.2
RBFOX2O43251 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.063e-10■■■■■ 35.1
RBFOX2O43251 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.143e-10■■■■■ 35.1
RBFOX2O43251 SLK-203ENST00000474260 622 ntTSL 21.45□□□□□ -2.183e-10■■■■■ 35.1
RBFOX2O43251 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.034e-7■■■■■ 35.1
RBFOX2O43251 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.754e-7■■■■■ 35.1
RBFOX2O43251 ZMYND8-215ENST00000468376 4064 ntTSL 1 (best)7.75□□□□□ -1.175e-10■■■■■ 35.1
RBFOX2O43251 BABAM2-204ENST00000379624 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.815e-7■■■■■ 35
RBFOX2O43251 BABAM2-202ENST00000344773 1852 ntTSL 2 BASIC8.08□□□□□ -1.125e-7■■■■■ 35
RBFOX2O43251 BABAM2-201ENST00000342045 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.485e-7■■■■■ 35
RBFOX2O43251 BABAM2-203ENST00000361704 1686 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.485e-7■■■■■ 35
RBFOX2O43251 BABAM2-206ENST00000379632 1752 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.565e-7■■■■■ 35
RBFOX2O43251 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.383e-10■■■■■ 35
RBFOX2O43251 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.423e-10■■■■■ 35
RBFOX2O43251 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.473e-10■■■■■ 35
RBFOX2O43251 HMGCS1-201ENST00000325110 3506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.75e-28■■■■■ 35
RBFOX2O43251 HMGCS1-202ENST00000433297 3466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.845e-28■■■■■ 35
RBFOX2O43251 GSAP-202ENST00000334003 2277 ntTSL 26.06□□□□□ -1.445e-7■■■■■ 35
RBFOX2O43251 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.131e-10■■■■■ 34.9
RBFOX2O43251 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.081e-10■■■■■ 34.9
RBFOX2O43251 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.121e-10■■■■■ 34.9
RBFOX2O43251 NDUFA10-201ENST00000252711 4915 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.621e-10■■■■■ 34.9
RBFOX2O43251 NDUFA10-212ENST00000485344 4509 ntTSL 210.12□□□□□ -0.791e-10■■■■■ 34.9
RBFOX2O43251 NDUFA10-206ENST00000419408 662 ntTSL 58.71□□□□□ -1.021e-10■■■■■ 34.9
RBFOX2O43251 NDUFA10-207ENST00000443626 776 ntTSL 58.61□□□□□ -1.031e-10■■■■■ 34.9
RBFOX2O43251 NDUFA10-211ENST00000476216 817 ntTSL 27.01□□□□□ -1.291e-10■■■■■ 34.9
RBFOX2O43251 NDUFA10-208ENST00000444548 621 ntTSL 36.62□□□□□ -1.351e-10■■■■■ 34.9
RBFOX2O43251 NDUFA10-209ENST00000448880 434 ntTSL 51.69□□□□□ -2.141e-10■■■■■ 34.9
RBFOX2O43251 GIPR-205ENST00000590918 3289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.558e-7■■■■■ 34.9
RBFOX2O43251 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.14e-10■■■■■ 34.9
RBFOX2O43251 FLYWCH1-213ENST00000575604 382 ntTSL 315.45■□□□□ 0.064e-10■■■■■ 34.9
RBFOX2O43251 SAMD1-203ENST00000541938 143 ntTSL 314.93□□□□□ -0.024e-10■■■■■ 34.9
RBFOX2O43251 FLYWCH1-212ENST00000574985 2318 ntTSL 214.74□□□□□ -0.054e-10■■■■■ 34.9
RBFOX2O43251 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.134e-10■■■■■ 34.9
RBFOX2O43251 FLYWCH1-211ENST00000573564 1470 ntTSL 1 (best)14.12□□□□□ -0.154e-10■■■■■ 34.9
RBFOX2O43251 FLYWCH1-202ENST00000344592 2565 ntTSL 1 (best)14.11□□□□□ -0.154e-10■■■■■ 34.9
RBFOX2O43251 FLYWCH1-208ENST00000571580 594 ntTSL 310.67□□□□□ -0.74e-10■■■■■ 34.9
RBFOX2O43251 FLYWCH1-205ENST00000570752 3721 ntTSL 29.03□□□□□ -0.964e-10■■■■■ 34.9
RBFOX2O43251 ULK1-205ENST00000541761 1262 ntTSL 212.36□□□□□ -0.432e-7■■■■■ 34.9
RBFOX2O43251 FAM155A-201ENST00000375915 8503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.666e-7■■■■■ 34.8
RBFOX2O43251 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.021e-6■■■■■ 34.8
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