RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561896.1

MSLN-203, Transcript of mesothelin, humanhuman

TSL 5

Gene MSLN, Length 1,195 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSLN-203ENST00000561896 NISCHQ9Y2I1 1504 aa62.87■■■■■ 7.66
MSLN-203ENST00000561896 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa56.23■■■■■ 6.59
MSLN-203ENST00000561896 ABCC9O60706 1549 aa55.41■■■■■ 6.46
MSLN-203ENST00000561896 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa53.17■■■■■ 6.1
MSLN-203ENST00000561896 NACADO15069 1562 aa52.99■■■■■ 6.07
MSLN-203ENST00000561896 DCAF8L2P0C7V8 631 aa52.61■■■■■ 6.01
MSLN-203ENST00000561896 MYO15BQ96JP2 1530 aa52.56■■■■■ 6.01
MSLN-203ENST00000561896 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP52.24■■■■■ 5.95
MSLN-203ENST00000561896 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa52.09■■■■■ 5.93
MSLN-203ENST00000561896 UNC13AQ9UPW8 1703 aa51.94■■■■■ 5.91
MSLN-203ENST00000561896 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP51.65■■■■■ 5.86
MSLN-203ENST00000561896 BICRAQ9NZM4 1560 aa51.55■■■■■ 5.84
MSLN-203ENST00000561896 DNAJC5BQ9UF47 199 aa51.4■■■■■ 5.82
MSLN-203ENST00000561896 SCRIBQ14160 1630 aa51.1■■■■■ 5.77
MSLN-203ENST00000561896 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa51.09■■■■■ 5.77
MSLN-203ENST00000561896 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP50.24■■■■■ 5.63
MSLN-203ENST00000561896 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa50.17■■■■■ 5.62
MSLN-203ENST00000561896 CECR2Q9BXF3 1484 aa49.91■■■■■ 5.58
MSLN-203ENST00000561896 SMARCA4P51532 1647 aa48.91■■■■■ 5.42
MSLN-203ENST00000561896 NCAPD3P42695 1498 aa48.9■■■■■ 5.42
MSLN-203ENST00000561896 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP48.79■■■■■ 5.4
MSLN-203ENST00000561896 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa48.79■■■■■ 5.4
MSLN-203ENST00000561896 SMARCA2P51531 1590 aa48.74■■■■■ 5.39
MSLN-203ENST00000561896 HMGXB3Q12766 1538 aa48.6■■■■■ 5.37
MSLN-203ENST00000561896 PEG3Q9GZU2 1588 aa48.51■■■■■ 5.36
MSLN-203ENST00000561896 MROH2BQ7Z745 1585 aa48.39■■■■■ 5.34
MSLN-203ENST00000561896 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP48.34■■■■■ 5.33
MSLN-203ENST00000561896 ERCC6Q03468 1493 aa47.84■■■■■ 5.25
MSLN-203ENST00000561896 WIZO95785 1651 aa47.83■■■■■ 5.25
MSLN-203ENST00000561896 NESP48681 1621 aa47.78■■■■■ 5.24
MSLN-203ENST00000561896 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa47.7■■■■■ 5.23
MSLN-203ENST00000561896 CUX2O14529 1486 aa47.65■■■■■ 5.22
MSLN-203ENST00000561896 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP47.64■■■■■ 5.22
MSLN-203ENST00000561896 CADPSQ9ULU8 1353 aa47.41■■■■■ 5.18
MSLN-203ENST00000561896 PDS5BQ9NTI5 1447 aa47.39■■■■■ 5.18
MSLN-203ENST00000561896 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP47.34■■■■■ 5.17
MSLN-203ENST00000561896 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP47.26■■■■■ 5.16
MSLN-203ENST00000561896 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa47.25■■■■■ 5.15
MSLN-203ENST00000561896 CFTRP13569 1480 aa47.02■■■■■ 5.12
MSLN-203ENST00000561896 MRC2Q9UBG0 1479 aa46.9■■■■■ 5.1
MSLN-203ENST00000561896 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa46.84■■■■■ 5.09
MSLN-203ENST00000561896 FANCD2Q9BXW9 1451 aa46.83■■■■■ 5.09
MSLN-203ENST00000561896 CEP164Q9UPV0 1460 aa46.83■■■■■ 5.09
MSLN-203ENST00000561896 WDR62O43379 1518 aa46.79■■■■■ 5.08
MSLN-203ENST00000561896 CCDC88BA6NC98 1476 aa46.76■■■■■ 5.08
MSLN-203ENST00000561896 PRDM2Q13029 1718 aa46.65■■■■■ 5.06
MSLN-203ENST00000561896 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP46.38■■■■■ 5.02
MSLN-203ENST00000561896 ABCC8Q09428 1581 aa46.08■■■■■ 4.97
MSLN-203ENST00000561896 TOPBP1Q92547 1522 aa46.03■■■■■ 4.96
MSLN-203ENST00000561896 DNMBPQ6XZF7 1577 aa45.94■■■■■ 4.94
MSLN-203ENST00000561896 IFT140Q96RY7 1462 aa45.91■■■■■ 4.94
MSLN-203ENST00000561896 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP45.86■■■■■ 4.93
MSLN-203ENST00000561896 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP45.67■■■■■ 4.9
MSLN-203ENST00000561896 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP45.59■■■■■ 4.89
MSLN-203ENST00000561896 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP45.59■■■■■ 4.89
MSLN-203ENST00000561896 OSCARQ8IYS5 282 aa45.53■■■■■ 4.88
MSLN-203ENST00000561896 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP45.5■■■■■ 4.87
MSLN-203ENST00000561896 CUX1P39880 1505 aa45.44■■■■■ 4.86
MSLN-203ENST00000561896 SOGA1O94964 1423 aa45.39■■■■■ 4.86
MSLN-203ENST00000561896 FGD5Q6ZNL6 1462 aa45.37■■■■■ 4.85
MSLN-203ENST00000561896 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP45.35■■■■■ 4.85
MSLN-203ENST00000561896 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa45.35■■■■■ 4.85
MSLN-203ENST00000561896 WDR97A6NE52 1622 aa45.3■■■■■ 4.84
MSLN-203ENST00000561896 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP45.16■■■■■ 4.82
MSLN-203ENST00000561896 CHD1O14646 1710 aa45.05■■■■■ 4.8
MSLN-203ENST00000561896 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa44.96■■■■■ 4.79
MSLN-203ENST00000561896 GRIN2BQ13224 1484 aa44.96■■■■■ 4.79
MSLN-203ENST00000561896 TOP2BQ02880 1626 aa44.94■■■■■ 4.79
MSLN-203ENST00000561896 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa44.94■■■■■ 4.79
MSLN-203ENST00000561896 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP44.94■■■■■ 4.79
MSLN-203ENST00000561896 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP44.93■■■■■ 4.78
MSLN-203ENST00000561896 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa44.92■■■■■ 4.78
MSLN-203ENST00000561896 TRIM41Q8WV44 630 aa44.89■■■■■ 4.78
MSLN-203ENST00000561896 GAPVD1Q14C86 1478 aa44.87■■■■■ 4.77
MSLN-203ENST00000561896 FBLN2P98095 1184 aa44.87■■■■■ 4.77
MSLN-203ENST00000561896 SYNJ1O43426 1573 aa44.84■■■■■ 4.77
MSLN-203ENST00000561896 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa44.83■■■■■ 4.77
MSLN-203ENST00000561896 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa44.83■■■■■ 4.77
MSLN-203ENST00000561896 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa44.83■■■■■ 4.77
MSLN-203ENST00000561896 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa44.83■■■■■ 4.77
MSLN-203ENST00000561896 PBRM1Q86U86 1689 aa44.81■■■■■ 4.76
MSLN-203ENST00000561896 ARHGEF11O15085 1522 aa44.77■■■■■ 4.76
MSLN-203ENST00000561896 SYNJ2O15056 1496 aa44.74■■■■■ 4.75
MSLN-203ENST00000561896 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP44.73■■■■■ 4.75
MSLN-203ENST00000561896 CLASP1Q7Z460 1538 aa44.58■■■■■ 4.73
MSLN-203ENST00000561896 ERICH3Q5RHP9 1530 aa44.43■■■■■ 4.7
MSLN-203ENST00000561896 ADAMTS12P58397 1594 aa44.42■■■■■ 4.7
MSLN-203ENST00000561896 GRIN2AQ12879 1464 aa44.36■■■■■ 4.69
MSLN-203ENST00000561896 ARAP1Q96P48 1450 aa44.35■■■■■ 4.69
MSLN-203ENST00000561896 FHAD1B1AJZ9 1412 aa44.34■■■■■ 4.69
MSLN-203ENST00000561896 CYB5RLQ6IPT4 315 aa44.33■■■■■ 4.69
MSLN-203ENST00000561896 NUP160Q12769 1436 aa44.22■■■■■ 4.67
MSLN-203ENST00000561896 CEP170Q5SW79 1584 aa44.14■■■■■ 4.66
MSLN-203ENST00000561896 KIF27Q86VH2 1401 aa44.07■■■■■ 4.65
MSLN-203ENST00000561896 SHROOM2Q13796 1616 aa43.97■■■■■ 4.63
MSLN-203ENST00000561896 IGF1RP08069 1367 aa43.95■■■■■ 4.63
MSLN-203ENST00000561896 CUL7Q14999 1698 aa43.91■■■■■ 4.62
MSLN-203ENST00000561896 ERCC6L2Q5T890 1561 aa43.84■■■■■ 4.61
MSLN-203ENST00000561896 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa43.78■■■■■ 4.6
MSLN-203ENST00000561896 JPH4Q96JJ6 628 aa43.73■■■■■ 4.59
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