RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000309027.4

GOLIM4-201, Transcript of golgi integral membrane protein 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene GOLIM4, Length 2,100 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLIM4-201ENST00000309027 NISCHQ9Y2I1 1504 aa37.36■■■■□ 3.57
GOLIM4-201ENST00000309027 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa33■■■□□ 2.87
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GOLIM4-201ENST00000309027 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP31.18■■■□□ 2.58
GOLIM4-201ENST00000309027 DCAF8L2P0C7V8 631 aa31.1■■■□□ 2.57
GOLIM4-201ENST00000309027 NACADO15069 1562 aa31.02■■■□□ 2.56
GOLIM4-201ENST00000309027 MYO15BQ96JP2 1530 aa30.98■■■□□ 2.55
GOLIM4-201ENST00000309027 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa30.95■■■□□ 2.55
GOLIM4-201ENST00000309027 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa30.95■■■□□ 2.55
GOLIM4-201ENST00000309027 SCRIBQ14160 1630 aa30.12■■■□□ 2.41
GOLIM4-201ENST00000309027 UNC13AQ9UPW8 1703 aa30.11■■■□□ 2.41
GOLIM4-201ENST00000309027 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP30.02■■■□□ 2.4
GOLIM4-201ENST00000309027 BICRAQ9NZM4 1560 aa29.98■■■□□ 2.39
GOLIM4-201ENST00000309027 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa29.77■■■□□ 2.36
GOLIM4-201ENST00000309027 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP29.18■■■□□ 2.26
GOLIM4-201ENST00000309027 DNAJC5BQ9UF47 199 aa29.15■■■□□ 2.26
GOLIM4-201ENST00000309027 CECR2Q9BXF3 1484 aa29.05■■■□□ 2.24
GOLIM4-201ENST00000309027 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa28.96■■■□□ 2.23
GOLIM4-201ENST00000309027 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP28.92■■■□□ 2.22
GOLIM4-201ENST00000309027 SMARCA4P51532 1647 aa28.87■■■□□ 2.21
GOLIM4-201ENST00000309027 MROH2BQ7Z745 1585 aa28.78■■■□□ 2.2
GOLIM4-201ENST00000309027 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa28.7■■■□□ 2.18
GOLIM4-201ENST00000309027 SMARCA2P51531 1590 aa28.66■■■□□ 2.18
GOLIM4-201ENST00000309027 NCAPD3P42695 1498 aa28.66■■■□□ 2.18
GOLIM4-201ENST00000309027 PEG3Q9GZU2 1588 aa28.62■■■□□ 2.17
GOLIM4-201ENST00000309027 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP28.61■■■□□ 2.17
GOLIM4-201ENST00000309027 HMGXB3Q12766 1538 aa28.49■■■□□ 2.15
GOLIM4-201ENST00000309027 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP28.45■■■□□ 2.15
GOLIM4-201ENST00000309027 WIZO95785 1651 aa28.43■■■□□ 2.14
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GOLIM4-201ENST00000309027 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP28.12■■■□□ 2.09
GOLIM4-201ENST00000309027 CCDC88BA6NC98 1476 aa27.89■■■□□ 2.06
GOLIM4-201ENST00000309027 CADPSQ9ULU8 1353 aa27.85■■■□□ 2.05
GOLIM4-201ENST00000309027 NESP48681 1621 aa27.8■■■□□ 2.04
GOLIM4-201ENST00000309027 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa27.79■■■□□ 2.04
GOLIM4-201ENST00000309027 CFTRP13569 1480 aa27.73■■■□□ 2.03
GOLIM4-201ENST00000309027 PDS5BQ9NTI5 1447 aa27.65■■■□□ 2.02
GOLIM4-201ENST00000309027 ERCC6Q03468 1493 aa27.59■■■□□ 2.01
GOLIM4-201ENST00000309027 FANCD2Q9BXW9 1451 aa27.48■■□□□ 1.99
GOLIM4-201ENST00000309027 CEP164Q9UPV0 1460 aa27.41■■□□□ 1.98
GOLIM4-201ENST00000309027 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa27.4■■□□□ 1.98
GOLIM4-201ENST00000309027 PRDM2Q13029 1718 aa27.38■■□□□ 1.97
GOLIM4-201ENST00000309027 MRC2Q9UBG0 1479 aa27.31■■□□□ 1.96
GOLIM4-201ENST00000309027 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP27.28■■□□□ 1.96
GOLIM4-201ENST00000309027 CUX2O14529 1486 aa27.21■■□□□ 1.95
GOLIM4-201ENST00000309027 WDR62O43379 1518 aa27.19■■□□□ 1.94
GOLIM4-201ENST00000309027 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP27.17■■□□□ 1.94
GOLIM4-201ENST00000309027 ABCC8Q09428 1581 aa27.13■■□□□ 1.93
GOLIM4-201ENST00000309027 TOPBP1Q92547 1522 aa27.07■■□□□ 1.92
GOLIM4-201ENST00000309027 DNMBPQ6XZF7 1577 aa27.05■■□□□ 1.92
GOLIM4-201ENST00000309027 CUX1P39880 1505 aa26.97■■□□□ 1.91
GOLIM4-201ENST00000309027 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP26.95■■□□□ 1.91
GOLIM4-201ENST00000309027 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP26.87■■□□□ 1.89
GOLIM4-201ENST00000309027 IFT140Q96RY7 1462 aa26.85■■□□□ 1.89
GOLIM4-201ENST00000309027 FGD5Q6ZNL6 1462 aa26.83■■□□□ 1.89
GOLIM4-201ENST00000309027 TOP2BQ02880 1626 aa26.82■■□□□ 1.88
GOLIM4-201ENST00000309027 SYNJ1O43426 1573 aa26.8■■□□□ 1.88
GOLIM4-201ENST00000309027 SOGA1O94964 1423 aa26.8■■□□□ 1.88
GOLIM4-201ENST00000309027 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa26.78■■□□□ 1.88
GOLIM4-201ENST00000309027 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa26.74■■□□□ 1.87
GOLIM4-201ENST00000309027 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP26.72■■□□□ 1.87
GOLIM4-201ENST00000309027 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP26.67■■□□□ 1.86
GOLIM4-201ENST00000309027 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa26.62■■□□□ 1.85
GOLIM4-201ENST00000309027 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP26.59■■□□□ 1.85
GOLIM4-201ENST00000309027 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP26.58■■□□□ 1.852e-6■■■■■ 36.4
GOLIM4-201ENST00000309027 TRIM41Q8WV44 630 aa26.57■■□□□ 1.84
GOLIM4-201ENST00000309027 WDR97A6NE52 1622 aa26.56■■□□□ 1.84
GOLIM4-201ENST00000309027 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP26.52■■□□□ 1.84
GOLIM4-201ENST00000309027 GAPVD1Q14C86 1478 aa26.47■■□□□ 1.83
GOLIM4-201ENST00000309027 CHIC1Q5VXU3 224 aa26.45■■□□□ 1.83
GOLIM4-201ENST00000309027 GRIN2BQ13224 1484 aa26.43■■□□□ 1.82
GOLIM4-201ENST00000309027 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa26.42■■□□□ 1.82
GOLIM4-201ENST00000309027 KIF27Q86VH2 1401 aa26.38■■□□□ 1.81
GOLIM4-201ENST00000309027 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa26.32■■□□□ 1.8
GOLIM4-201ENST00000309027 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP26.32■■□□□ 1.8
GOLIM4-201ENST00000309027 ERICH3Q5RHP9 1530 aa26.3■■□□□ 1.8
GOLIM4-201ENST00000309027 PBRM1Q86U86 1689 aa26.27■■□□□ 1.8
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GOLIM4-201ENST00000309027 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP26.22■■□□□ 1.79
GOLIM4-201ENST00000309027 SYNJ2O15056 1496 aa26.22■■□□□ 1.79
GOLIM4-201ENST00000309027 FBLN2P98095 1184 aa26.21■■□□□ 1.79
GOLIM4-201ENST00000309027 FHAD1B1AJZ9 1412 aa26.2■■□□□ 1.78
GOLIM4-201ENST00000309027 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa26.2■■□□□ 1.78
GOLIM4-201ENST00000309027 OSCARQ8IYS5 282 aa26.19■■□□□ 1.78
GOLIM4-201ENST00000309027 ADAMTS12P58397 1594 aa26.15■■□□□ 1.78
GOLIM4-201ENST00000309027 EEA1Q15075 1411 aa26.11■■□□□ 1.77
GOLIM4-201ENST00000309027 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa26.09■■□□□ 1.77
GOLIM4-201ENST00000309027 GRIN2AQ12879 1464 aa26.07■■□□□ 1.76
GOLIM4-201ENST00000309027 CHD1O14646 1710 aa26.07■■□□□ 1.76
GOLIM4-201ENST00000309027 CUL7Q14999 1698 aa26.07■■□□□ 1.76
GOLIM4-201ENST00000309027 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa26.05■■□□□ 1.76
GOLIM4-201ENST00000309027 CSRNP3Q8WYN3 585 aa26.04■■□□□ 1.76
GOLIM4-201ENST00000309027 NUP160Q12769 1436 aa25.97■■□□□ 1.75
GOLIM4-201ENST00000309027 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP25.96■■□□□ 1.75
GOLIM4-201ENST00000309027 PRXQ9BXM0 1461 aa25.96■■□□□ 1.75
GOLIM4-201ENST00000309027 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa25.96■■□□□ 1.75
GOLIM4-201ENST00000309027 CLASP1Q7Z460 1538 aa25.89■■□□□ 1.74
GOLIM4-201ENST00000309027 CEP170Q5SW79 1584 aa25.89■■□□□ 1.74
GOLIM4-201ENST00000309027 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa25.81■■□□□ 1.72
GOLIM4-201ENST00000309027 JPH4Q96JJ6 628 aa25.75■■□□□ 1.71
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