Protein–RNA interactions for Protein: P07498

CSN3, Kappa-casein, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSN3P07498 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CSN3P07498 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CSN3P07498 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CSN3P07498 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CSN3P07498 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CSN3P07498 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CSN3P07498 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CSN3P07498 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CSN3P07498 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CSN3P07498 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CSN3P07498 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CSN3P07498 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CSN3P07498 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CSN3P07498 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CSN3P07498 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CSN3P07498 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CSN3P07498 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CSN3P07498 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CSN3P07498 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CSN3P07498 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CSN3P07498 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CSN3P07498 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CSN3P07498 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CSN3P07498 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CSN3P07498 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CSN3P07498 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CSN3P07498 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CSN3P07498 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CSN3P07498 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CSN3P07498 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CSN3P07498 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CSN3P07498 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CSN3P07498 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CSN3P07498 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CSN3P07498 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CSN3P07498 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CSN3P07498 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CSN3P07498 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CSN3P07498 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CSN3P07498 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CSN3P07498 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CSN3P07498 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CSN3P07498 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CSN3P07498 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CSN3P07498 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CSN3P07498 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CSN3P07498 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CSN3P07498 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CSN3P07498 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CSN3P07498 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CSN3P07498 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CSN3P07498 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CSN3P07498 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CSN3P07498 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CSN3P07498 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CSN3P07498 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CSN3P07498 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CSN3P07498 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CSN3P07498 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CSN3P07498 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CSN3P07498 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CSN3P07498 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CSN3P07498 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CSN3P07498 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CSN3P07498 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CSN3P07498 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CSN3P07498 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CSN3P07498 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CSN3P07498 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CSN3P07498 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CSN3P07498 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CSN3P07498 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CSN3P07498 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CSN3P07498 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CSN3P07498 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CSN3P07498 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CSN3P07498 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CSN3P07498 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CSN3P07498 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CSN3P07498 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CSN3P07498 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CSN3P07498 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CSN3P07498 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CSN3P07498 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CSN3P07498 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CSN3P07498 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CSN3P07498 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CSN3P07498 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CSN3P07498 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CSN3P07498 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CSN3P07498 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CSN3P07498 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CSN3P07498 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CSN3P07498 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CSN3P07498 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CSN3P07498 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CSN3P07498 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CSN3P07498 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CSN3P07498 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CSN3P07498 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms