RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000618445.4

EPM2A-208, Transcript of EPM2A, laforin glucan phosphatase, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene EPM2A, Length 1,694 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPM2A-208ENST00000618445 NISCHQ9Y2I1 1504 aa56.37■■■■■ 6.61
EPM2A-208ENST00000618445 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa49.67■■■■■ 5.54
EPM2A-208ENST00000618445 ABCC9O60706 1549 aa47.72■■■■■ 5.23
EPM2A-208ENST00000618445 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP47.19■■■■■ 5.14
EPM2A-208ENST00000618445 DCAF8L2P0C7V8 631 aa46.9■■■■■ 5.1
EPM2A-208ENST00000618445 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa46.65■■■■■ 5.06
EPM2A-208ENST00000618445 NACADO15069 1562 aa46.44■■■■■ 5.03
EPM2A-208ENST00000618445 MYO15BQ96JP2 1530 aa46.44■■■■■ 5.02
EPM2A-208ENST00000618445 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa46.28■■■■■ 5
EPM2A-208ENST00000618445 SCRIBQ14160 1630 aa45.46■■■■■ 4.87
EPM2A-208ENST00000618445 UNC13AQ9UPW8 1703 aa45.34■■■■■ 4.85
EPM2A-208ENST00000618445 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa45.27■■■■■ 4.84
EPM2A-208ENST00000618445 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP44.81■■■■■ 4.76
EPM2A-208ENST00000618445 BICRAQ9NZM4 1560 aa44.81■■■■■ 4.76
EPM2A-208ENST00000618445 CECR2Q9BXF3 1484 aa43.83■■■■■ 4.61
EPM2A-208ENST00000618445 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP43.63■■■■■ 4.57
EPM2A-208ENST00000618445 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP43.56■■■■■ 4.56
EPM2A-208ENST00000618445 SMARCA4P51532 1647 aa43.56■■■■■ 4.56
EPM2A-208ENST00000618445 MROH2BQ7Z745 1585 aa43.5■■■■■ 4.55
EPM2A-208ENST00000618445 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP43.35■■■■■ 4.53
EPM2A-208ENST00000618445 WIZO95785 1651 aa43.15■■■■■ 4.5
EPM2A-208ENST00000618445 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa43.14■■■■■ 4.5
EPM2A-208ENST00000618445 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP43.12■■■■■ 4.49
EPM2A-208ENST00000618445 PEG3Q9GZU2 1588 aa43.07■■■■■ 4.48
EPM2A-208ENST00000618445 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa43.03■■■■■ 4.48
EPM2A-208ENST00000618445 SMARCA2P51531 1590 aa43.02■■■■■ 4.48
EPM2A-208ENST00000618445 DNAJC5BQ9UF47 199 aa42.92■■■■■ 4.46
EPM2A-208ENST00000618445 NCAPD3P42695 1498 aa42.85■■■■■ 4.45
EPM2A-208ENST00000618445 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP42.76■■■■■ 4.44
EPM2A-208ENST00000618445 HMGXB3Q12766 1538 aa42.7■■■■■ 4.43
EPM2A-208ENST00000618445 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP42.67■■■■■ 4.42
EPM2A-208ENST00000618445 CCDC88BA6NC98 1476 aa42.17■■■■■ 4.34
EPM2A-208ENST00000618445 CADPSQ9ULU8 1353 aa41.71■■■■■ 4.27
EPM2A-208ENST00000618445 CFTRP13569 1480 aa41.62■■■■■ 4.25
EPM2A-208ENST00000618445 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa41.56■■■■■ 4.24
EPM2A-208ENST00000618445 NESP48681 1621 aa41.53■■■■■ 4.24
EPM2A-208ENST00000618445 PRDM2Q13029 1718 aa41.51■■■■■ 4.24
EPM2A-208ENST00000618445 PDS5BQ9NTI5 1447 aa41.33■■■■■ 4.21
EPM2A-208ENST00000618445 FANCD2Q9BXW9 1451 aa41.21■■■■■ 4.19
EPM2A-208ENST00000618445 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa41.12■■■■■ 4.17
EPM2A-208ENST00000618445 ERCC6Q03468 1493 aa41.11■■■■■ 4.17
EPM2A-208ENST00000618445 CEP164Q9UPV0 1460 aa41.07■■■■■ 4.17
EPM2A-208ENST00000618445 CHIC1Q5VXU3 224 aa41.04■■■■■ 4.16
EPM2A-208ENST00000618445 ABCC8Q09428 1581 aa41.03■■■■■ 4.16
EPM2A-208ENST00000618445 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP40.85■■■■■ 4.13
EPM2A-208ENST00000618445 MRC2Q9UBG0 1479 aa40.79■■■■■ 4.12
EPM2A-208ENST00000618445 SYNJ1O43426 1573 aa40.76■■■■■ 4.11
EPM2A-208ENST00000618445 CUX1P39880 1505 aa40.74■■■■■ 4.11
EPM2A-208ENST00000618445 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP40.69■■■■■ 4.1
EPM2A-208ENST00000618445 TOP2BQ02880 1626 aa40.68■■■■■ 4.1
EPM2A-208ENST00000618445 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa40.68■■■■■ 4.1
EPM2A-208ENST00000618445 DNMBPQ6XZF7 1577 aa40.68■■■■■ 4.1
EPM2A-208ENST00000618445 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP40.64■■■■■ 4.1
EPM2A-208ENST00000618445 TRIM41Q8WV44 630 aa40.64■■■■■ 4.1
EPM2A-208ENST00000618445 TOPBP1Q92547 1522 aa40.63■■■■■ 4.1
EPM2A-208ENST00000618445 WDR62O43379 1518 aa40.58■■■■■ 4.09
EPM2A-208ENST00000618445 FGD5Q6ZNL6 1462 aa40.43■■■■■ 4.06
EPM2A-208ENST00000618445 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP40.35■■■■■ 4.05
EPM2A-208ENST00000618445 SOGA1O94964 1423 aa40.28■■■■■ 4.04
EPM2A-208ENST00000618445 CUX2O14529 1486 aa40.25■■■■■ 4.03
EPM2A-208ENST00000618445 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa40.19■■■■■ 4.02
EPM2A-208ENST00000618445 IFT140Q96RY7 1462 aa40.17■■■■■ 4.02
EPM2A-208ENST00000618445 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP40.13■■■■■ 4.01
EPM2A-208ENST00000618445 WDR97A6NE52 1622 aa40.1■■■■■ 4.01
EPM2A-208ENST00000618445 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa40.06■■■■■ 4
EPM2A-208ENST00000618445 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa39.94■■■■□ 3.98
EPM2A-208ENST00000618445 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP39.93■■■■□ 3.98
EPM2A-208ENST00000618445 KIF27Q86VH2 1401 aa39.92■■■■□ 3.98
EPM2A-208ENST00000618445 EEA1Q15075 1411 aa39.9■■■■□ 3.98
EPM2A-208ENST00000618445 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP39.88■■■■□ 3.97
EPM2A-208ENST00000618445 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa39.85■■■■□ 3.97
EPM2A-208ENST00000618445 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP39.83■■■■□ 3.97
EPM2A-208ENST00000618445 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP39.82■■■■□ 3.97
EPM2A-208ENST00000618445 GAPVD1Q14C86 1478 aa39.79■■■■□ 3.96
EPM2A-208ENST00000618445 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP39.77■■■■□ 3.96
EPM2A-208ENST00000618445 PBRM1Q86U86 1689 aa39.71■■■■□ 3.95
EPM2A-208ENST00000618445 GRIN2BQ13224 1484 aa39.66■■■■□ 3.94
EPM2A-208ENST00000618445 CSRNP3Q8WYN3 585 aa39.64■■■■□ 3.94
EPM2A-208ENST00000618445 IGF1RP08069 1367 aa39.61■■■■□ 3.93
EPM2A-208ENST00000618445 ERICH3Q5RHP9 1530 aa39.6■■■■□ 3.93
EPM2A-208ENST00000618445 CUL7Q14999 1698 aa39.5■■■■□ 3.91
EPM2A-208ENST00000618445 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa39.46■■■■□ 3.91
EPM2A-208ENST00000618445 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP39.43■■■■□ 3.9
EPM2A-208ENST00000618445 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa39.43■■■■□ 3.9
EPM2A-208ENST00000618445 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa39.43■■■■□ 3.9
EPM2A-208ENST00000618445 PRXQ9BXM0 1461 aa39.41■■■■□ 3.9
EPM2A-208ENST00000618445 KIF21BO75037 1637 aa39.41■■■■□ 3.9
EPM2A-208ENST00000618445 ADAMTS12P58397 1594 aa39.38■■■■□ 3.89
EPM2A-208ENST00000618445 FHAD1B1AJZ9 1412 aa39.37■■■■□ 3.89
EPM2A-208ENST00000618445 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP39.3■■■■□ 3.88
EPM2A-208ENST00000618445 FBLN2P98095 1184 aa39.29■■■■□ 3.88
EPM2A-208ENST00000618445 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa39.29■■■■□ 3.88
EPM2A-208ENST00000618445 EHMT2Q96KQ7 1210 aa39.28■■■■□ 3.88
EPM2A-208ENST00000618445 SYNJ2O15056 1496 aa39.27■■■■□ 3.88
EPM2A-208ENST00000618445 GOLGA3Q08378 1498 aa39.23■■■■□ 3.87
EPM2A-208ENST00000618445 CHD1O14646 1710 aa39.12■■■■□ 3.85
EPM2A-208ENST00000618445 GRIN2AQ12879 1464 aa39.12■■■■□ 3.85
EPM2A-208ENST00000618445 UBTFP17480 764 aaKnown RBP39.06■■■■□ 3.84
EPM2A-208ENST00000618445 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa38.98■■■■□ 3.83
EPM2A-208ENST00000618445 TNIKQ9UKE5 1360 aa38.92■■■■□ 3.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.1 ms