RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000301886.3

ARL2-SNX15-201, Transcript of ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene ARL2-SNX15, Length 2,392 nt, Biotype nonsense mediated decay.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 NISCHQ9Y2I1 1504 aa43.38■■■■■ 4.54
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 HRCP23327 699 aa38.45■■■■□ 3.75
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa37.88■■■■□ 3.65
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP37.75■■■■□ 3.63
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 MYO15BQ96JP2 1530 aa37.55■■■■□ 3.6
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 PCGF6Q9BYE7 350 aa37.42■■■■□ 3.58
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP37.33■■■■□ 3.57
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CHIC1Q5VXU3 224 aa37.33■■■■□ 3.57
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP37.25■■■■□ 3.55
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa37.03■■■■□ 3.52
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP36.94■■■■□ 3.5
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa36.61■■■■□ 3.45
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP36.47■■■■□ 3.43
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP36.29■■■■□ 3.4
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa36.26■■■■□ 3.4
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP36.25■■■■□ 3.39
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 MYT1Q01538 1121 aa35.88■■■■□ 3.33
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 DCAF8L2P0C7V8 631 aa35.63■■■■□ 3.29
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP35.45■■■■□ 3.27
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 NEUROD1Q13562 356 aa35.24■■■■□ 3.23
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ABCC9O60706 1549 aa35.09■■■■□ 3.21
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 TRIM41Q8WV44 630 aa35.08■■■■□ 3.21
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa35.03■■■■□ 3.2
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP35■■■■□ 3.19
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP34.83■■■■□ 3.17
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP34.82■■■■□ 3.16
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP34.78■■■■□ 3.16
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP34.73■■■■□ 3.15
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP34.7■■■■□ 3.15
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa34.65■■■■□ 3.14
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 EHMT2Q96KQ7 1210 aa34.48■■■■□ 3.11
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 SCRIBQ14160 1630 aa34.24■■■■□ 3.07
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP34.2■■■■□ 3.06
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP34.12■■■■□ 3.05
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP33.97■■■■□ 3.03
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 MIER1Q8N108 512 aa33.85■■■■□ 3.01
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP33.8■■■■□ 3
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 MROH2BQ7Z745 1585 aa33.79■■■■□ 3
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CECR2Q9BXF3 1484 aa33.77■■■■□ 3
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CEP162Q5TB80 1403 aa33.76■■■■□ 3
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP33.72■■■□□ 2.99
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CLSPNQ9HAW4 1339 aa33.72■■■□□ 2.99
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 WIZO95785 1651 aa33.69■■■□□ 2.98
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 TNIKQ9UKE5 1360 aa33.65■■■□□ 2.98
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP33.59■■■□□ 2.97
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CCDC88BA6NC98 1476 aa33.45■■■□□ 2.95
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP33.45■■■□□ 2.94
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ANP32EQ9BTT0 268 aa33.42■■■□□ 2.94
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 EEA1Q15075 1411 aa33.39■■■□□ 2.94
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ABCC8Q09428 1581 aa33.37■■■□□ 2.93
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 SOGA1O94964 1423 aa33.32■■■□□ 2.92
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa33.31■■■□□ 2.92
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 NACADO15069 1562 aa33.28■■■□□ 2.92
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CSRNP3Q8WYN3 585 aa33.27■■■□□ 2.92
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 BCL11AQ9H165 835 aa33.25■■■□□ 2.91
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 UBTFP17480 764 aaKnown RBP33.24■■■□□ 2.91
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP33.24■■■□□ 2.91
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 GOLGA3Q08378 1498 aa33.22■■■□□ 2.91
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP33.16■■■□□ 2.9
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa33.08■■■□□ 2.89
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 SMARCA2P51531 1590 aa33.03■■■□□ 2.88
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 VPS8Q8N3P4 1428 aa32.9■■■□□ 2.86
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CEP164Q9UPV0 1460 aa32.89■■■□□ 2.86
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CLIP1P30622 1438 aa32.87■■■□□ 2.85
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 KIF21BO75037 1637 aa32.87■■■□□ 2.85
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 APLP2Q06481 763 aa32.81■■■□□ 2.84
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP32.81■■■□□ 2.84
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 SMARCA4P51532 1647 aa32.79■■■□□ 2.84
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP32.69■■■□□ 2.82
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP32.5■■■□□ 2.79
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 SYNJ1O43426 1573 aa32.46■■■□□ 2.79
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 FKBP8Q14318 412 aa32.46■■■□□ 2.79
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 BCANQ96GW7 911 aa32.45■■■□□ 2.79
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa32.45■■■□□ 2.78
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CUX2O14529 1486 aa32.43■■■□□ 2.78
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 KCNH8Q96L42 1107 aa32.42■■■□□ 2.78
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP32.34■■■□□ 2.77
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 NEFLP07196 543 aa32.29■■■□□ 2.76
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP32.22■■■□□ 2.75
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 MSH5O43196 834 aa32.2■■■□□ 2.75
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ARAP1Q96P48 1450 aa32.19■■■□□ 2.74
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP32.19■■■□□ 2.74
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 FANCIQ9NVI1 1328 aa32.13■■■□□ 2.73
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ERICH3Q5RHP9 1530 aa32.12■■■□□ 2.73
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CCNB3Q8WWL7 1395 aa32.11■■■□□ 2.73
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 MAPKBP1O60336 1514 aa32.11■■■□□ 2.73
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 PEG3Q9GZU2 1588 aa32.09■■■□□ 2.73
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP32.07■■■□□ 2.72
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CCER2I3L3R5 266 aa32.06■■■□□ 2.72
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 UNC13AQ9UPW8 1703 aa32.06■■■□□ 2.72
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP32.02■■■□□ 2.72
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ITGAEP38570 1179 aa32.01■■■□□ 2.71
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 PRXQ9BXM0 1461 aa32■■■□□ 2.71
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa31.99■■■□□ 2.71
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 TOP2BQ02880 1626 aa31.97■■■□□ 2.71
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 MYT1LQ9UL68 1186 aa31.96■■■□□ 2.71
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 WDR97A6NE52 1622 aa31.96■■■□□ 2.71
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 TRIM52Q96A61 297 aa31.9■■■□□ 2.7
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ANP32CO43423 234 aa31.87■■■□□ 2.69
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa31.86■■■□□ 2.69
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.2 ms