Protein–RNA interactions for Protein: P07498

CSN3, Kappa-casein, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSN3P07498 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CSN3P07498 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CSN3P07498 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CSN3P07498 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CSN3P07498 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CSN3P07498 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CSN3P07498 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CSN3P07498 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CSN3P07498 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CSN3P07498 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CSN3P07498 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CSN3P07498 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CSN3P07498 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CSN3P07498 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CSN3P07498 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CSN3P07498 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CSN3P07498 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CSN3P07498 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CSN3P07498 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CSN3P07498 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CSN3P07498 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CSN3P07498 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CSN3P07498 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CSN3P07498 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CSN3P07498 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CSN3P07498 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CSN3P07498 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CSN3P07498 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CSN3P07498 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CSN3P07498 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CSN3P07498 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CSN3P07498 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CSN3P07498 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CSN3P07498 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CSN3P07498 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CSN3P07498 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CSN3P07498 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CSN3P07498 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CSN3P07498 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CSN3P07498 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CSN3P07498 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CSN3P07498 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CSN3P07498 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CSN3P07498 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CSN3P07498 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CSN3P07498 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CSN3P07498 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CSN3P07498 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CSN3P07498 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CSN3P07498 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CSN3P07498 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CSN3P07498 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CSN3P07498 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CSN3P07498 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CSN3P07498 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CSN3P07498 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CSN3P07498 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CSN3P07498 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CSN3P07498 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CSN3P07498 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CSN3P07498 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSN3P07498 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSN3P07498 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSN3P07498 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CSN3P07498 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CSN3P07498 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CSN3P07498 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CSN3P07498 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CSN3P07498 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CSN3P07498 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CSN3P07498 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CSN3P07498 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CSN3P07498 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CSN3P07498 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CSN3P07498 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CSN3P07498 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CSN3P07498 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CSN3P07498 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CSN3P07498 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CSN3P07498 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CSN3P07498 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CSN3P07498 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CSN3P07498 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CSN3P07498 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CSN3P07498 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CSN3P07498 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CSN3P07498 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CSN3P07498 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CSN3P07498 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CSN3P07498 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSN3P07498 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CSN3P07498 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CSN3P07498 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CSN3P07498 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CSN3P07498 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CSN3P07498 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CSN3P07498 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CSN3P07498 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CSN3P07498 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CSN3P07498 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms