RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000255198.2

ZBED3-201, Transcript of zinc finger BED-type containing 3, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene ZBED3, Length 6,172 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED3-201ENST00000255198 DCAF8L2P0C7V8 631 aa35.47■■■■□ 3.27
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ZBED3-201ENST00000255198 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP32.71■■■□□ 2.83
ZBED3-201ENST00000255198 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa32.56■■■□□ 2.8
ZBED3-201ENST00000255198 APLP2Q06481 763 aa32.21■■■□□ 2.75
ZBED3-201ENST00000255198 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP32.07■■■□□ 2.72
ZBED3-201ENST00000255198 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP31.77■■■□□ 2.68
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ZBED3-201ENST00000255198 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP31.62■■■□□ 2.65
ZBED3-201ENST00000255198 PCGF6Q9BYE7 350 aa31.48■■■□□ 2.63
ZBED3-201ENST00000255198 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP31.37■■■□□ 2.61
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ZBED3-201ENST00000255198 NEFLP07196 543 aa30.8■■■□□ 2.52
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ZBED3-201ENST00000255198 MYT1LQ9UL68 1186 aa30.37■■■□□ 2.45
ZBED3-201ENST00000255198 POLR3GLQ9BT43 218 aa30.35■■■□□ 2.45
ZBED3-201ENST00000255198 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP30.27■■■□□ 2.44
ZBED3-201ENST00000255198 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP30.17■■■□□ 2.42
ZBED3-201ENST00000255198 CHIC1Q5VXU3 224 aa30.1■■■□□ 2.41
ZBED3-201ENST00000255198 ITGAEP38570 1179 aa30.1■■■□□ 2.41
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ZBED3-201ENST00000255198 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP29.54■■■□□ 2.32
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ZBED3-201ENST00000255198 BCL11AQ9H165 835 aa29.11■■■□□ 2.25
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ZBED3-201ENST00000255198 TRIM52Q96A61 297 aa29.06■■■□□ 2.24
ZBED3-201ENST00000255198 SLC24A1O60721 1099 aa29.04■■■□□ 2.24
ZBED3-201ENST00000255198 BCANQ96GW7 911 aa29■■■□□ 2.23
ZBED3-201ENST00000255198 NEUROD1Q13562 356 aa28.96■■■□□ 2.23
ZBED3-201ENST00000255198 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP28.93■■■□□ 2.22
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ZBED3-201ENST00000255198 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa28.43■■■□□ 2.14
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ZBED3-201ENST00000255198 STAG3Q9UJ98 1225 aa27.97■■■□□ 2.07
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ZBED3-201ENST00000255198 FKBP8Q14318 412 aa27.78■■■□□ 2.04
ZBED3-201ENST00000255198 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP27.78■■■□□ 2.04
ZBED3-201ENST00000255198 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP27.76■■■□□ 2.04
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ZBED3-201ENST00000255198 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP27.59■■■□□ 2.01
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ZBED3-201ENST00000255198 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP27.51■■□□□ 1.99
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ZBED3-201ENST00000255198 CCDC136Q96JN2 1154 aa27.45■■□□□ 1.99
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ZBED3-201ENST00000255198 CHIC2Q9UKJ5 165 aa27.44■■□□□ 1.98
ZBED3-201ENST00000255198 TMC1Q8TDI8 760 aa27.43■■□□□ 1.98
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ZBED3-201ENST00000255198 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa27.39■■□□□ 1.97
ZBED3-201ENST00000255198 CSRNP3Q8WYN3 585 aa27.38■■□□□ 1.97
ZBED3-201ENST00000255198 C14orf37Q86TY3 774 aa27.37■■□□□ 1.97
ZBED3-201ENST00000255198 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP27.35■■□□□ 1.97
ZBED3-201ENST00000255198 MYH16Q9H6N6 1097 aa27.32■■□□□ 1.96
ZBED3-201ENST00000255198 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP27.29■■□□□ 1.96
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ZBED3-201ENST00000255198 TPRNQ4KMQ1 711 aa27.22■■□□□ 1.95
ZBED3-201ENST00000255198 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP27.18■■□□□ 1.94
ZBED3-201ENST00000255198 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa27.11■■□□□ 1.93
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