Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE2

TMEM79, Transmembrane protein 79, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM79Q9BSE2 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM79Q9BSE2 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM79Q9BSE2 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM79Q9BSE2 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM79Q9BSE2 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM79Q9BSE2 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM79Q9BSE2 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM79Q9BSE2 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM79Q9BSE2 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM79Q9BSE2 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM79Q9BSE2 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM79Q9BSE2 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM79Q9BSE2 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM79Q9BSE2 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM79Q9BSE2 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM79Q9BSE2 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM79Q9BSE2 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM79Q9BSE2 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM79Q9BSE2 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM79Q9BSE2 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM79Q9BSE2 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM79Q9BSE2 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM79Q9BSE2 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM79Q9BSE2 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM79Q9BSE2 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM79Q9BSE2 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM79Q9BSE2 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM79Q9BSE2 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM79Q9BSE2 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM79Q9BSE2 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM79Q9BSE2 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM79Q9BSE2 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM79Q9BSE2 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM79Q9BSE2 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM79Q9BSE2 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM79Q9BSE2 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM79Q9BSE2 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM79Q9BSE2 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM79Q9BSE2 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM79Q9BSE2 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM79Q9BSE2 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM79Q9BSE2 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM79Q9BSE2 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM79Q9BSE2 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM79Q9BSE2 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM79Q9BSE2 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM79Q9BSE2 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM79Q9BSE2 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM79Q9BSE2 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM79Q9BSE2 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM79Q9BSE2 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM79Q9BSE2 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM79Q9BSE2 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM79Q9BSE2 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM79Q9BSE2 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM79Q9BSE2 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM79Q9BSE2 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM79Q9BSE2 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM79Q9BSE2 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM79Q9BSE2 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM79Q9BSE2 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM79Q9BSE2 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM79Q9BSE2 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM79Q9BSE2 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM79Q9BSE2 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM79Q9BSE2 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM79Q9BSE2 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM79Q9BSE2 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM79Q9BSE2 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM79Q9BSE2 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM79Q9BSE2 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM79Q9BSE2 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM79Q9BSE2 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM79Q9BSE2 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM79Q9BSE2 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM79Q9BSE2 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM79Q9BSE2 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM79Q9BSE2 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM79Q9BSE2 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM79Q9BSE2 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM79Q9BSE2 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM79Q9BSE2 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM79Q9BSE2 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM79Q9BSE2 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM79Q9BSE2 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM79Q9BSE2 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM79Q9BSE2 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM79Q9BSE2 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM79Q9BSE2 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM79Q9BSE2 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM79Q9BSE2 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM79Q9BSE2 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM79Q9BSE2 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM79Q9BSE2 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM79Q9BSE2 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM79Q9BSE2 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM79Q9BSE2 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM79Q9BSE2 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM79Q9BSE2 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM79Q9BSE2 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms