RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487476.5

NF1-211, Transcript of neurofibromin 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NF1, Length 2,265 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NF1-211ENST00000487476 NISCHQ9Y2I1 1504 aa39.55■■■■□ 3.92
NF1-211ENST00000487476 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa34.68■■■■□ 3.14
NF1-211ENST00000487476 ABCC9O60706 1549 aa33.51■■■□□ 2.96
NF1-211ENST00000487476 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP33.08■■■□□ 2.89
NF1-211ENST00000487476 DCAF8L2P0C7V8 631 aa32.98■■■□□ 2.87
NF1-211ENST00000487476 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa32.64■■■□□ 2.82
NF1-211ENST00000487476 NACADO15069 1562 aa32.5■■■□□ 2.79
NF1-211ENST00000487476 MYO15BQ96JP2 1530 aa32.49■■■□□ 2.79
NF1-211ENST00000487476 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa32.37■■■□□ 2.77
NF1-211ENST00000487476 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa31.92■■■□□ 2.7
NF1-211ENST00000487476 SCRIBQ14160 1630 aa31.91■■■□□ 2.7
NF1-211ENST00000487476 UNC13AQ9UPW8 1703 aa31.68■■■□□ 2.66
NF1-211ENST00000487476 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP31.54■■■□□ 2.64
NF1-211ENST00000487476 BICRAQ9NZM4 1560 aa31.46■■■□□ 2.63
NF1-211ENST00000487476 CECR2Q9BXF3 1484 aa30.84■■■□□ 2.53
NF1-211ENST00000487476 MROH2BQ7Z745 1585 aa30.57■■■□□ 2.48
NF1-211ENST00000487476 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP30.55■■■□□ 2.48
NF1-211ENST00000487476 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP30.55■■■□□ 2.48
NF1-211ENST00000487476 SMARCA4P51532 1647 aa30.51■■■□□ 2.48
NF1-211ENST00000487476 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP30.48■■■□□ 2.47
NF1-211ENST00000487476 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP30.39■■■□□ 2.46
NF1-211ENST00000487476 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa30.26■■■□□ 2.44
NF1-211ENST00000487476 WIZO95785 1651 aa30.25■■■□□ 2.43
NF1-211ENST00000487476 DNAJC5BQ9UF47 199 aa30.23■■■□□ 2.43
NF1-211ENST00000487476 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa30.21■■■□□ 2.43
NF1-211ENST00000487476 PEG3Q9GZU2 1588 aa30.15■■■□□ 2.42
NF1-211ENST00000487476 SMARCA2P51531 1590 aa30.12■■■□□ 2.41
NF1-211ENST00000487476 NCAPD3P42695 1498 aa30.05■■■□□ 2.4
NF1-211ENST00000487476 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP29.99■■■□□ 2.39
NF1-211ENST00000487476 HMGXB3Q12766 1538 aa29.9■■■□□ 2.38
NF1-211ENST00000487476 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP29.89■■■□□ 2.38
NF1-211ENST00000487476 CCDC88BA6NC98 1476 aa29.64■■■□□ 2.34
NF1-211ENST00000487476 CADPSQ9ULU8 1353 aa29.25■■■□□ 2.27
NF1-211ENST00000487476 NESP48681 1621 aa29.24■■■□□ 2.27
NF1-211ENST00000487476 CFTRP13569 1480 aa29.21■■■□□ 2.27
NF1-211ENST00000487476 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa29.08■■■□□ 2.25
NF1-211ENST00000487476 FANCD2Q9BXW9 1451 aa28.92■■■□□ 2.22
NF1-211ENST00000487476 PDS5BQ9NTI5 1447 aa28.91■■■□□ 2.22
NF1-211ENST00000487476 PRDM2Q13029 1718 aa28.88■■■□□ 2.21
NF1-211ENST00000487476 ABCC8Q09428 1581 aa28.81■■■□□ 2.2
NF1-211ENST00000487476 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa28.79■■■□□ 2.2
NF1-211ENST00000487476 CEP164Q9UPV0 1460 aa28.78■■■□□ 2.2
NF1-211ENST00000487476 ERCC6Q03468 1493 aa28.76■■■□□ 2.19
NF1-211ENST00000487476 CHIC1Q5VXU3 224 aa28.74■■■□□ 2.19
NF1-211ENST00000487476 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP28.68■■■□□ 2.182e-6■■■■□ 22.3
NF1-211ENST00000487476 CUX1P39880 1505 aa28.62■■■□□ 2.17
NF1-211ENST00000487476 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP28.61■■■□□ 2.17
NF1-211ENST00000487476 SYNJ1O43426 1573 aa28.58■■■□□ 2.17
NF1-211ENST00000487476 TRIM41Q8WV44 630 aa28.58■■■□□ 2.17
NF1-211ENST00000487476 MRC2Q9UBG0 1479 aa28.58■■■□□ 2.17
NF1-211ENST00000487476 TOPBP1Q92547 1522 aa28.53■■■□□ 2.16
NF1-211ENST00000487476 DNMBPQ6XZF7 1577 aa28.5■■■□□ 2.15
NF1-211ENST00000487476 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP28.5■■■□□ 2.15
NF1-211ENST00000487476 TOP2BQ02880 1626 aa28.48■■■□□ 2.15
NF1-211ENST00000487476 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa28.44■■■□□ 2.14
NF1-211ENST00000487476 WDR62O43379 1518 aa28.44■■■□□ 2.14
NF1-211ENST00000487476 FGD5Q6ZNL6 1462 aa28.39■■■□□ 2.14
NF1-211ENST00000487476 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP28.35■■■□□ 2.13
NF1-211ENST00000487476 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa28.29■■■□□ 2.12
NF1-211ENST00000487476 CUX2O14529 1486 aa28.27■■■□□ 2.12
NF1-211ENST00000487476 SOGA1O94964 1423 aa28.26■■■□□ 2.11
NF1-211ENST00000487476 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP28.13■■■□□ 2.09
NF1-211ENST00000487476 IFT140Q96RY7 1462 aa28.12■■■□□ 2.09
NF1-211ENST00000487476 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa28.11■■■□□ 2.09
NF1-211ENST00000487476 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa28.1■■■□□ 2.09
NF1-211ENST00000487476 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP28.09■■■□□ 2.09
NF1-211ENST00000487476 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP28.09■■■□□ 2.09
NF1-211ENST00000487476 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP28.06■■■□□ 2.08
NF1-211ENST00000487476 WDR97A6NE52 1622 aa28.02■■■□□ 2.08
NF1-211ENST00000487476 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP28.01■■■□□ 2.07
NF1-211ENST00000487476 KIF27Q86VH2 1401 aa28■■■□□ 2.07
NF1-211ENST00000487476 GAPVD1Q14C86 1478 aa27.92■■■□□ 2.06
NF1-211ENST00000487476 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa27.9■■■□□ 2.06
NF1-211ENST00000487476 CSRNP3Q8WYN3 585 aa27.88■■■□□ 2.05
NF1-211ENST00000487476 IGF1RP08069 1367 aa27.88■■■□□ 2.05
NF1-211ENST00000487476 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP27.87■■■□□ 2.05
NF1-211ENST00000487476 EEA1Q15075 1411 aa27.87■■■□□ 2.05
NF1-211ENST00000487476 GRIN2BQ13224 1484 aa27.79■■■□□ 2.04
NF1-211ENST00000487476 EHMT2Q96KQ7 1210 aa27.77■■■□□ 2.04
NF1-211ENST00000487476 ERICH3Q5RHP9 1530 aa27.74■■■□□ 2.03
NF1-211ENST00000487476 PBRM1Q86U86 1689 aa27.74■■■□□ 2.03
NF1-211ENST00000487476 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa27.7■■■□□ 2.02
NF1-211ENST00000487476 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa27.7■■■□□ 2.02
NF1-211ENST00000487476 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa27.67■■■□□ 2.02
NF1-211ENST00000487476 PRXQ9BXM0 1461 aa27.67■■■□□ 2.02
NF1-211ENST00000487476 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP27.6■■■□□ 2.01
NF1-211ENST00000487476 FHAD1B1AJZ9 1412 aa27.6■■■□□ 2.01
NF1-211ENST00000487476 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa27.6■■■□□ 2.01
NF1-211ENST00000487476 ADAMTS12P58397 1594 aa27.59■■■□□ 2.01
NF1-211ENST00000487476 CUL7Q14999 1698 aa27.59■■■□□ 2.01
NF1-211ENST00000487476 FBLN2P98095 1184 aa27.58■■■□□ 2.01
NF1-211ENST00000487476 KIF21BO75037 1637 aa27.54■■■□□ 2
NF1-211ENST00000487476 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP27.54■■■□□ 2
NF1-211ENST00000487476 SYNJ2O15056 1496 aa27.52■■■□□ 2
NF1-211ENST00000487476 GOLGA3Q08378 1498 aa27.49■■□□□ 1.99
NF1-211ENST00000487476 UBTFP17480 764 aaKnown RBP27.47■■□□□ 1.99
NF1-211ENST00000487476 GRIN2AQ12879 1464 aa27.45■■□□□ 1.98
NF1-211ENST00000487476 CHD1O14646 1710 aa27.37■■□□□ 1.97
NF1-211ENST00000487476 TNIKQ9UKE5 1360 aa27.3■■□□□ 1.96
NF1-211ENST00000487476 CEP170Q5SW79 1584 aa27.3■■□□□ 1.96
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