RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000281623.7

FBXO4-201, Transcript of F-box protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene FBXO4, Length 1,682 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO4-201ENST00000281623 NISCHQ9Y2I1 1504 aa38.31■■■■□ 3.72
FBXO4-201ENST00000281623 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa34.04■■■■□ 3.04
FBXO4-201ENST00000281623 ABCC9O60706 1549 aa32.99■■■□□ 2.87
FBXO4-201ENST00000281623 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP32■■■□□ 2.71
FBXO4-201ENST00000281623 NACADO15069 1562 aa31.86■■■□□ 2.69
FBXO4-201ENST00000281623 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa31.83■■■□□ 2.69
FBXO4-201ENST00000281623 DCAF8L2P0C7V8 631 aa31.8■■■□□ 2.68
FBXO4-201ENST00000281623 MYO15BQ96JP2 1530 aa31.76■■■□□ 2.68
FBXO4-201ENST00000281623 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa31.74■■■□□ 2.67
FBXO4-201ENST00000281623 UNC13AQ9UPW8 1703 aa31.22■■■□□ 2.59
FBXO4-201ENST00000281623 SCRIBQ14160 1630 aa31.01■■■□□ 2.56
FBXO4-201ENST00000281623 BICRAQ9NZM4 1560 aa30.95■■■□□ 2.55
FBXO4-201ENST00000281623 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP30.86■■■□□ 2.53
FBXO4-201ENST00000281623 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa30.7■■■□□ 2.51
FBXO4-201ENST00000281623 DNAJC5BQ9UF47 199 aa30.17■■■□□ 2.42
FBXO4-201ENST00000281623 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP30.05■■■□□ 2.4
FBXO4-201ENST00000281623 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa29.87■■■□□ 2.37
FBXO4-201ENST00000281623 CECR2Q9BXF3 1484 aa29.86■■■□□ 2.37
FBXO4-201ENST00000281623 SMARCA4P51532 1647 aa29.71■■■□□ 2.35
FBXO4-201ENST00000281623 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP29.71■■■□□ 2.35
FBXO4-201ENST00000281623 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP29.6■■■□□ 2.33
FBXO4-201ENST00000281623 MROH2BQ7Z745 1585 aa29.55■■■□□ 2.32
FBXO4-201ENST00000281623 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa29.44■■■□□ 2.3
FBXO4-201ENST00000281623 SMARCA2P51531 1590 aa29.44■■■□□ 2.3
FBXO4-201ENST00000281623 PEG3Q9GZU2 1588 aa29.41■■■□□ 2.3
FBXO4-201ENST00000281623 NCAPD3P42695 1498 aa29.39■■■□□ 2.29
FBXO4-201ENST00000281623 HMGXB3Q12766 1538 aa29.29■■■□□ 2.28
FBXO4-201ENST00000281623 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP29.28■■■□□ 2.28
FBXO4-201ENST00000281623 WIZO95785 1651 aa29.27■■■□□ 2.28
FBXO4-201ENST00000281623 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP29.21■■■□□ 2.27
FBXO4-201ENST00000281623 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP28.97■■■□□ 2.23
FBXO4-201ENST00000281623 NESP48681 1621 aa28.67■■■□□ 2.18
FBXO4-201ENST00000281623 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa28.59■■■□□ 2.17
FBXO4-201ENST00000281623 CCDC88BA6NC98 1476 aa28.58■■■□□ 2.17
FBXO4-201ENST00000281623 CADPSQ9ULU8 1353 aa28.51■■■□□ 2.15
FBXO4-201ENST00000281623 CHIC1Q5VXU3 224 aa28.47■■■□□ 2.15
FBXO4-201ENST00000281623 CFTRP13569 1480 aa28.42■■■□□ 2.14
FBXO4-201ENST00000281623 PRDM2Q13029 1718 aa28.41■■■□□ 2.14
FBXO4-201ENST00000281623 ERCC6Q03468 1493 aa28.33■■■□□ 2.13
FBXO4-201ENST00000281623 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa28.33■■■□□ 2.13
FBXO4-201ENST00000281623 PDS5BQ9NTI5 1447 aa28.32■■■□□ 2.12
FBXO4-201ENST00000281623 FANCD2Q9BXW9 1451 aa28.19■■■□□ 2.1
FBXO4-201ENST00000281623 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP28.18■■■□□ 2.1
FBXO4-201ENST00000281623 CEP164Q9UPV0 1460 aa28.15■■■□□ 2.1
FBXO4-201ENST00000281623 MRC2Q9UBG0 1479 aa28.04■■■□□ 2.08
FBXO4-201ENST00000281623 WDR62O43379 1518 aa27.98■■■□□ 2.07
FBXO4-201ENST00000281623 CUX2O14529 1486 aa27.98■■■□□ 2.07
FBXO4-201ENST00000281623 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP27.96■■■□□ 2.07
FBXO4-201ENST00000281623 ABCC8Q09428 1581 aa27.82■■■□□ 2.04
FBXO4-201ENST00000281623 TRIM41Q8WV44 630 aa27.81■■■□□ 2.04
FBXO4-201ENST00000281623 DNMBPQ6XZF7 1577 aa27.81■■■□□ 2.04
FBXO4-201ENST00000281623 TOPBP1Q92547 1522 aa27.79■■■□□ 2.04
FBXO4-201ENST00000281623 CUX1P39880 1505 aa27.7■■■□□ 2.03
FBXO4-201ENST00000281623 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP27.61■■■□□ 2.01
FBXO4-201ENST00000281623 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa27.6■■■□□ 2.01
FBXO4-201ENST00000281623 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP27.58■■■□□ 2.01
FBXO4-201ENST00000281623 TOP2BQ02880 1626 aa27.57■■■□□ 2
FBXO4-201ENST00000281623 SYNJ1O43426 1573 aa27.57■■■□□ 2
FBXO4-201ENST00000281623 FGD5Q6ZNL6 1462 aa27.55■■■□□ 2
FBXO4-201ENST00000281623 IFT140Q96RY7 1462 aa27.53■■■□□ 2
FBXO4-201ENST00000281623 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP27.52■■■□□ 2
FBXO4-201ENST00000281623 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa27.47■■□□□ 1.99
FBXO4-201ENST00000281623 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP27.46■■□□□ 1.99
FBXO4-201ENST00000281623 SOGA1O94964 1423 aa27.42■■□□□ 1.98
FBXO4-201ENST00000281623 WDR97A6NE52 1622 aa27.4■■□□□ 1.98
FBXO4-201ENST00000281623 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa27.36■■□□□ 1.97
FBXO4-201ENST00000281623 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP27.35■■□□□ 1.97
FBXO4-201ENST00000281623 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP27.3■■□□□ 1.96
FBXO4-201ENST00000281623 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP27.3■■□□□ 1.96
FBXO4-201ENST00000281623 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa27.3■■□□□ 1.96
FBXO4-201ENST00000281623 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP27.27■■□□□ 1.96
FBXO4-201ENST00000281623 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa27.22■■□□□ 1.95
FBXO4-201ENST00000281623 PBRM1Q86U86 1689 aa27.19■■□□□ 1.94
FBXO4-201ENST00000281623 EEA1Q15075 1411 aa27.17■■□□□ 1.94
FBXO4-201ENST00000281623 GAPVD1Q14C86 1478 aa27.14■■□□□ 1.94
FBXO4-201ENST00000281623 GRIN2BQ13224 1484 aa27.1■■□□□ 1.93
FBXO4-201ENST00000281623 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa27.07■■□□□ 1.92
FBXO4-201ENST00000281623 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa27.03■■□□□ 1.92
FBXO4-201ENST00000281623 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP27.02■■□□□ 1.92
FBXO4-201ENST00000281623 KIF27Q86VH2 1401 aa27.01■■□□□ 1.91
FBXO4-201ENST00000281623 ERICH3Q5RHP9 1530 aa27■■□□□ 1.91
FBXO4-201ENST00000281623 CHD1O14646 1710 aa26.98■■□□□ 1.91
FBXO4-201ENST00000281623 CSRNP3Q8WYN3 585 aa26.95■■□□□ 1.9
FBXO4-201ENST00000281623 ADAMTS12P58397 1594 aa26.92■■□□□ 1.9
FBXO4-201ENST00000281623 SYNJ2O15056 1496 aa26.89■■□□□ 1.9
FBXO4-201ENST00000281623 EHMT2Q96KQ7 1210 aa26.89■■□□□ 1.89
FBXO4-201ENST00000281623 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa26.89■■□□□ 1.89
FBXO4-201ENST00000281623 CUL7Q14999 1698 aa26.87■■□□□ 1.89
FBXO4-201ENST00000281623 KIF21BO75037 1637 aa26.85■■□□□ 1.89
FBXO4-201ENST00000281623 IGF1RP08069 1367 aa26.84■■□□□ 1.89
FBXO4-201ENST00000281623 FHAD1B1AJZ9 1412 aa26.83■■□□□ 1.89
FBXO4-201ENST00000281623 OSCARQ8IYS5 282 aa26.82■■□□□ 1.88
FBXO4-201ENST00000281623 FBLN2P98095 1184 aa26.82■■□□□ 1.88
FBXO4-201ENST00000281623 GOLGA3Q08378 1498 aa26.81■■□□□ 1.88
FBXO4-201ENST00000281623 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP26.8■■□□□ 1.88
FBXO4-201ENST00000281623 GRIN2AQ12879 1464 aa26.76■■□□□ 1.87
FBXO4-201ENST00000281623 TNIKQ9UKE5 1360 aa26.74■■□□□ 1.87
FBXO4-201ENST00000281623 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa26.68■■□□□ 1.86
FBXO4-201ENST00000281623 CLASP1Q7Z460 1538 aa26.68■■□□□ 1.86
FBXO4-201ENST00000281623 CEP170Q5SW79 1584 aa26.66■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 112 ms