Protein–RNA interactions for Protein: O43172

PRPF4, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4O43172 VPS53-202ENST00000389040 1903 ntTSL 1 (best)10.34□□□□□ -0.751e-8■■□□□ 11.6
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PRPF4O43172 SOX5-212ENST00000541536 2365 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.796e-6■■□□□ 11.6
PRPF4O43172 MTOR-201ENST00000361445 8677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.86e-6■■□□□ 11.6
PRPF4O43172 ACAA1-210ENST00000451419 964 ntTSL 39.98□□□□□ -0.816e-6■■□□□ 11.6
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PRPF4O43172 FBXO38-211ENST00000508326 745 ntTSL 29.69□□□□□ -0.861e-8■■□□□ 11.6
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PRPF4O43172 CAPN1-210ENST00000527699 564 ntTSL 39.35□□□□□ -0.916e-6■■□□□ 11.6
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PRPF4O43172 FBXO38-203ENST00000394370 4132 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.951e-8■■□□□ 11.6
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PRPF4O43172 FBXO38-201ENST00000296701 3680 ntTSL 2 BASIC7.91□□□□□ -1.141e-8■■□□□ 11.6
PRPF4O43172 VPS53-204ENST00000437048 13106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.241e-8■■□□□ 11.6
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PRPF4O43172 SOX5-205ENST00000451604 4261 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.316e-6■■□□□ 11.6
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PRPF4O43172 VPS53-219ENST00000576019 613 ntTSL 35.89□□□□□ -1.471e-8■■□□□ 11.6
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PRPF4O43172 FAM35A-201ENST00000298784 3402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.566e-6■■□□□ 11.6
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PRPF4O43172 CUX1-203ENST00000360264 13762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.773e-6■■□□□ 11.6
PRPF4O43172 CUX1-201ENST00000292535 13747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.833e-6■■□□□ 11.6
PRPF4O43172 CUX1-206ENST00000437600 3031 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.843e-6■■□□□ 11.6
PRPF4O43172 CUX1-216ENST00000558469 588 ntTSL 49.35□□□□□ -0.913e-6■■□□□ 11.6
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PRPF4O43172 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.092e-6■■□□□ 11.6
PRPF4O43172 MOB2-202ENST00000526462 795 ntTSL 213.6□□□□□ -0.232e-6■■□□□ 11.6
PRPF4O43172 DGKD-213ENST00000490764 2902 ntTSL 1 (best)13.6□□□□□ -0.232e-6■■□□□ 11.6
PRPF4O43172 PROZ-201ENST00000342783 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.332e-6■■□□□ 11.6
PRPF4O43172 CYTH2-213ENST00000620214 2020 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.342e-6■■□□□ 11.6
PRPF4O43172 PLEC-212ENST00000527816 583 ntTSL 312.88□□□□□ -0.353e-6■■□□□ 11.6
PRPF4O43172 CYTH2-210ENST00000493260 4652 ntTSL 512.51□□□□□ -0.412e-6■■□□□ 11.6
PRPF4O43172 PPP6R3-204ENST00000393801 5069 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.484e-6■■□□□ 11.6
PRPF4O43172 MST1-201ENST00000448220 667 ntTSL 511.63□□□□□ -0.552e-6■■□□□ 11.6
PRPF4O43172 PPP6R3-203ENST00000393800 5093 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.64e-6■■□□□ 11.6
PRPF4O43172 PPP6R3-205ENST00000524845 2771 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.614e-6■■□□□ 11.6
PRPF4O43172 PPP6R3-201ENST00000265636 4794 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.634e-6■■□□□ 11.6
PRPF4O43172 PPP6R3-226ENST00000534534 2968 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.674e-6■■□□□ 11.6
PRPF4O43172 PPP6R3-202ENST00000265637 4783 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.744e-6■■□□□ 11.6
PRPF4O43172 PPP6R3-218ENST00000529710 3228 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.064e-6■■□□□ 11.6
PRPF4O43172 PPP6R3-206ENST00000524904 4292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.144e-6■■□□□ 11.6
PRPF4O43172 C8orf4-201ENST00000315792 1854 ntAPPRIS P1 BASIC4.8□□□□□ -1.647e-12■■□□□ 11.6
PRPF4O43172 EXOC7-216ENST00000589210 4751 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.363e-7■■□□□ 11.6
PRPF4O43172 EXOC7-201ENST00000332065 4596 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.523e-7■■□□□ 11.6
PRPF4O43172 HNRNPA2B1-203ENST00000360787 1724 ntTSL 515.78■□□□□ 0.124e-8■■□□□ 11.6
PRPF4O43172 HNRNPA2B1-206ENST00000490912 5328 ntTSL 215.46■□□□□ 0.074e-8■■□□□ 11.6
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