RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486441.1

SDCCAG3-211, Transcript of Serologically defined colon cancer antigen 3, humanhuman

TSL 5

Gene SDCCAG3, Length 570 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDCCAG3-211ENST00000486441 NISCHQ9Y2I1 1504 aa36.4■■■■□ 3.42
SDCCAG3-211ENST00000486441 ABCC9O60706 1549 aa33.02■■■□□ 2.88
SDCCAG3-211ENST00000486441 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa32.64■■■□□ 2.82
SDCCAG3-211ENST00000486441 DNAJC5BQ9UF47 199 aa31.44■■■□□ 2.62
SDCCAG3-211ENST00000486441 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa31.22■■■□□ 2.59
SDCCAG3-211ENST00000486441 NACADO15069 1562 aa30.98■■■□□ 2.55
SDCCAG3-211ENST00000486441 DCAF8L2P0C7V8 631 aa30.79■■■□□ 2.52
SDCCAG3-211ENST00000486441 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP30.78■■■□□ 2.52
SDCCAG3-211ENST00000486441 UNC13AQ9UPW8 1703 aa30.55■■■□□ 2.48
SDCCAG3-211ENST00000486441 MYO15BQ96JP2 1530 aa30.52■■■□□ 2.48
SDCCAG3-211ENST00000486441 BICRAQ9NZM4 1560 aa30.48■■■□□ 2.47
SDCCAG3-211ENST00000486441 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP30.09■■■□□ 2.41
SDCCAG3-211ENST00000486441 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa30.03■■■□□ 2.4
SDCCAG3-211ENST00000486441 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa29.9■■■□□ 2.38
SDCCAG3-211ENST00000486441 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa29.79■■■□□ 2.36
SDCCAG3-211ENST00000486441 CECR2Q9BXF3 1484 aa29.76■■■□□ 2.35
SDCCAG3-211ENST00000486441 SCRIBQ14160 1630 aa29.76■■■□□ 2.35
SDCCAG3-211ENST00000486441 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP29.67■■■□□ 2.34
SDCCAG3-211ENST00000486441 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa28.95■■■□□ 2.22
SDCCAG3-211ENST00000486441 NCAPD3P42695 1498 aa28.71■■■□□ 2.19
SDCCAG3-211ENST00000486441 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa28.57■■■□□ 2.16
SDCCAG3-211ENST00000486441 CUX2O14529 1486 aa28.52■■■□□ 2.16
SDCCAG3-211ENST00000486441 ERCC6Q03468 1493 aa28.41■■■□□ 2.14
SDCCAG3-211ENST00000486441 SMARCA4P51532 1647 aa28.4■■■□□ 2.14
SDCCAG3-211ENST00000486441 HMGXB3Q12766 1538 aa28.37■■■□□ 2.13
SDCCAG3-211ENST00000486441 SMARCA2P51531 1590 aa28.36■■■□□ 2.13
SDCCAG3-211ENST00000486441 NESP48681 1621 aa28.34■■■□□ 2.13
SDCCAG3-211ENST00000486441 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP28.19■■■□□ 2.1
SDCCAG3-211ENST00000486441 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP28.18■■■□□ 2.1
SDCCAG3-211ENST00000486441 PEG3Q9GZU2 1588 aa28.16■■■□□ 2.1
SDCCAG3-211ENST00000486441 MROH2BQ7Z745 1585 aa28.07■■■□□ 2.08
SDCCAG3-211ENST00000486441 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP28.03■■■□□ 2.08
SDCCAG3-211ENST00000486441 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa27.98■■■□□ 2.07
SDCCAG3-211ENST00000486441 PDS5BQ9NTI5 1447 aa27.85■■■□□ 2.05
SDCCAG3-211ENST00000486441 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa27.84■■■□□ 2.05
SDCCAG3-211ENST00000486441 CADPSQ9ULU8 1353 aa27.81■■■□□ 2.04
SDCCAG3-211ENST00000486441 WIZO95785 1651 aa27.66■■■□□ 2.02
SDCCAG3-211ENST00000486441 MRC2Q9UBG0 1479 aa27.64■■■□□ 2.01
SDCCAG3-211ENST00000486441 WDR62O43379 1518 aa27.59■■■□□ 2.01
SDCCAG3-211ENST00000486441 TRIM41Q8WV44 630 aa27.46■■□□□ 1.99
SDCCAG3-211ENST00000486441 FANCD2Q9BXW9 1451 aa27.44■■□□□ 1.98
SDCCAG3-211ENST00000486441 CEP164Q9UPV0 1460 aa27.44■■□□□ 1.98
SDCCAG3-211ENST00000486441 CFTRP13569 1480 aa27.43■■□□□ 1.98
SDCCAG3-211ENST00000486441 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP27.42■■□□□ 1.98
SDCCAG3-211ENST00000486441 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP27.28■■□□□ 1.96
SDCCAG3-211ENST00000486441 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP27.26■■□□□ 1.96
SDCCAG3-211ENST00000486441 OSCARQ8IYS5 282 aa27.23■■□□□ 1.95
SDCCAG3-211ENST00000486441 CCDC88BA6NC98 1476 aa27.05■■□□□ 1.92
SDCCAG3-211ENST00000486441 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP27■■□□□ 1.91
SDCCAG3-211ENST00000486441 IFT140Q96RY7 1462 aa26.93■■□□□ 1.9
SDCCAG3-211ENST00000486441 PRDM2Q13029 1718 aa26.93■■□□□ 1.9
SDCCAG3-211ENST00000486441 TOPBP1Q92547 1522 aa26.9■■□□□ 1.9
SDCCAG3-211ENST00000486441 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa26.86■■□□□ 1.89
SDCCAG3-211ENST00000486441 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa26.86■■□□□ 1.89
SDCCAG3-211ENST00000486441 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa26.86■■□□□ 1.89
SDCCAG3-211ENST00000486441 ARHGEF11O15085 1522 aa26.77■■□□□ 1.88
SDCCAG3-211ENST00000486441 ABCC8Q09428 1581 aa26.76■■□□□ 1.87
SDCCAG3-211ENST00000486441 DNMBPQ6XZF7 1577 aa26.73■■□□□ 1.87
SDCCAG3-211ENST00000486441 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP26.73■■□□□ 1.874e-8■■□□□ 13.7
SDCCAG3-211ENST00000486441 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP26.71■■□□□ 1.87
SDCCAG3-211ENST00000486441 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP26.69■■□□□ 1.86
SDCCAG3-211ENST00000486441 CYB5RLQ6IPT4 315 aa26.63■■□□□ 1.85
SDCCAG3-211ENST00000486441 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP26.62■■□□□ 1.85
SDCCAG3-211ENST00000486441 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa26.57■■□□□ 1.84
SDCCAG3-211ENST00000486441 CHD1O14646 1710 aa26.55■■□□□ 1.84
SDCCAG3-211ENST00000486441 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP26.52■■□□□ 1.84
SDCCAG3-211ENST00000486441 ARAP1Q96P48 1450 aa26.52■■□□□ 1.84
SDCCAG3-211ENST00000486441 FBLN2P98095 1184 aa26.51■■□□□ 1.83
SDCCAG3-211ENST00000486441 SOGA1O94964 1423 aa26.49■■□□□ 1.83
SDCCAG3-211ENST00000486441 FGD5Q6ZNL6 1462 aa26.39■■□□□ 1.82
SDCCAG3-211ENST00000486441 CUX1P39880 1505 aa26.37■■□□□ 1.81
SDCCAG3-211ENST00000486441 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa26.36■■□□□ 1.81
SDCCAG3-211ENST00000486441 TRHP20396 242 aaPredicted RBP26.33■■□□□ 1.81
SDCCAG3-211ENST00000486441 CLASP1Q7Z460 1538 aa26.33■■□□□ 1.81
SDCCAG3-211ENST00000486441 WDR97A6NE52 1622 aa26.29■■□□□ 1.8
SDCCAG3-211ENST00000486441 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP26.29■■□□□ 1.8
SDCCAG3-211ENST00000486441 GRIN2BQ13224 1484 aa26.26■■□□□ 1.79
SDCCAG3-211ENST00000486441 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP26.26■■□□□ 1.79
SDCCAG3-211ENST00000486441 SYNJ2O15056 1496 aa26.2■■□□□ 1.78
SDCCAG3-211ENST00000486441 SYNJ1O43426 1573 aa26.19■■□□□ 1.78
SDCCAG3-211ENST00000486441 GAPVD1Q14C86 1478 aa26.14■■□□□ 1.78
SDCCAG3-211ENST00000486441 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa26.09■■□□□ 1.77
SDCCAG3-211ENST00000486441 PBRM1Q86U86 1689 aa26.05■■□□□ 1.76
SDCCAG3-211ENST00000486441 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa26.04■■□□□ 1.76
SDCCAG3-211ENST00000486441 ERCC6L2Q5T890 1561 aa25.96■■□□□ 1.75
SDCCAG3-211ENST00000486441 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP25.94■■□□□ 1.74
SDCCAG3-211ENST00000486441 GRIN2AQ12879 1464 aa25.93■■□□□ 1.74
SDCCAG3-211ENST00000486441 NUP160Q12769 1436 aa25.9■■□□□ 1.74
SDCCAG3-211ENST00000486441 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP25.9■■□□□ 1.74
SDCCAG3-211ENST00000486441 CEP170Q5SW79 1584 aa25.86■■□□□ 1.73
SDCCAG3-211ENST00000486441 ADAMTS12P58397 1594 aa25.85■■□□□ 1.73
SDCCAG3-211ENST00000486441 TOP2BQ02880 1626 aa25.81■■□□□ 1.72
SDCCAG3-211ENST00000486441 FHAD1B1AJZ9 1412 aa25.8■■□□□ 1.72
SDCCAG3-211ENST00000486441 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa25.8■■□□□ 1.72
SDCCAG3-211ENST00000486441 SHROOM2Q13796 1616 aa25.77■■□□□ 1.72
SDCCAG3-211ENST00000486441 ERICH3Q5RHP9 1530 aa25.72■■□□□ 1.71
SDCCAG3-211ENST00000486441 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP25.69■■□□□ 1.7
SDCCAG3-211ENST00000486441 JPH4Q96JJ6 628 aa25.65■■□□□ 1.7
SDCCAG3-211ENST00000486441 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP25.64■■□□□ 1.7
SDCCAG3-211ENST00000486441 KIF13AQ9H1H9 1805 aa25.54■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.1 ms