Protein–RNA interactions for Protein: Q5JUX0

SPIN3, Spindlin-3, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIN3Q5JUX0 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SPIN3Q5JUX0 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SPIN3Q5JUX0 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SPIN3Q5JUX0 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SPIN3Q5JUX0 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SPIN3Q5JUX0 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SPIN3Q5JUX0 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SPIN3Q5JUX0 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
SPIN3Q5JUX0 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SPIN3Q5JUX0 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SPIN3Q5JUX0 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SPIN3Q5JUX0 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SPIN3Q5JUX0 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SPIN3Q5JUX0 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SPIN3Q5JUX0 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SPIN3Q5JUX0 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SPIN3Q5JUX0 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SPIN3Q5JUX0 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SPIN3Q5JUX0 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SPIN3Q5JUX0 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SPIN3Q5JUX0 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SPIN3Q5JUX0 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SPIN3Q5JUX0 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SPIN3Q5JUX0 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SPIN3Q5JUX0 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SPIN3Q5JUX0 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SPIN3Q5JUX0 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SPIN3Q5JUX0 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SPIN3Q5JUX0 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SPIN3Q5JUX0 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SPIN3Q5JUX0 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SPIN3Q5JUX0 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SPIN3Q5JUX0 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SPIN3Q5JUX0 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SPIN3Q5JUX0 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SPIN3Q5JUX0 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SPIN3Q5JUX0 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SPIN3Q5JUX0 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SPIN3Q5JUX0 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SPIN3Q5JUX0 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SPIN3Q5JUX0 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SPIN3Q5JUX0 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SPIN3Q5JUX0 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SPIN3Q5JUX0 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SPIN3Q5JUX0 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SPIN3Q5JUX0 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SPIN3Q5JUX0 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SPIN3Q5JUX0 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SPIN3Q5JUX0 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SPIN3Q5JUX0 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SPIN3Q5JUX0 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SPIN3Q5JUX0 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SPIN3Q5JUX0 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SPIN3Q5JUX0 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SPIN3Q5JUX0 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SPIN3Q5JUX0 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SPIN3Q5JUX0 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SPIN3Q5JUX0 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SPIN3Q5JUX0 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SPIN3Q5JUX0 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SPIN3Q5JUX0 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SPIN3Q5JUX0 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SPIN3Q5JUX0 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SPIN3Q5JUX0 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SPIN3Q5JUX0 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SPIN3Q5JUX0 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SPIN3Q5JUX0 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SPIN3Q5JUX0 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SPIN3Q5JUX0 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SPIN3Q5JUX0 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SPIN3Q5JUX0 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SPIN3Q5JUX0 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SPIN3Q5JUX0 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SPIN3Q5JUX0 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
SPIN3Q5JUX0 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
SPIN3Q5JUX0 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SPIN3Q5JUX0 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SPIN3Q5JUX0 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SPIN3Q5JUX0 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SPIN3Q5JUX0 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SPIN3Q5JUX0 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SPIN3Q5JUX0 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SPIN3Q5JUX0 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SPIN3Q5JUX0 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SPIN3Q5JUX0 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SPIN3Q5JUX0 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SPIN3Q5JUX0 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SPIN3Q5JUX0 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SPIN3Q5JUX0 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SPIN3Q5JUX0 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SPIN3Q5JUX0 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SPIN3Q5JUX0 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SPIN3Q5JUX0 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
SPIN3Q5JUX0 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
SPIN3Q5JUX0 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SPIN3Q5JUX0 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SPIN3Q5JUX0 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SPIN3Q5JUX0 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SPIN3Q5JUX0 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
SPIN3Q5JUX0 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.7 ms