Protein–RNA interactions for Protein: Q5JUX0

SPIN3, Spindlin-3, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIN3Q5JUX0 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SPIN3Q5JUX0 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SPIN3Q5JUX0 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SPIN3Q5JUX0 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
SPIN3Q5JUX0 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SPIN3Q5JUX0 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SPIN3Q5JUX0 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SPIN3Q5JUX0 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SPIN3Q5JUX0 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SPIN3Q5JUX0 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SPIN3Q5JUX0 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.97
SPIN3Q5JUX0 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SPIN3Q5JUX0 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SPIN3Q5JUX0 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SPIN3Q5JUX0 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SPIN3Q5JUX0 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SPIN3Q5JUX0 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SPIN3Q5JUX0 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SPIN3Q5JUX0 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SPIN3Q5JUX0 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SPIN3Q5JUX0 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SPIN3Q5JUX0 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SPIN3Q5JUX0 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SPIN3Q5JUX0 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SPIN3Q5JUX0 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SPIN3Q5JUX0 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SPIN3Q5JUX0 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SPIN3Q5JUX0 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SPIN3Q5JUX0 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SPIN3Q5JUX0 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SPIN3Q5JUX0 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SPIN3Q5JUX0 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SPIN3Q5JUX0 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SPIN3Q5JUX0 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SPIN3Q5JUX0 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SPIN3Q5JUX0 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SPIN3Q5JUX0 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SPIN3Q5JUX0 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SPIN3Q5JUX0 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SPIN3Q5JUX0 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SPIN3Q5JUX0 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SPIN3Q5JUX0 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SPIN3Q5JUX0 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SPIN3Q5JUX0 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SPIN3Q5JUX0 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SPIN3Q5JUX0 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SPIN3Q5JUX0 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SPIN3Q5JUX0 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SPIN3Q5JUX0 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SPIN3Q5JUX0 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SPIN3Q5JUX0 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SPIN3Q5JUX0 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SPIN3Q5JUX0 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SPIN3Q5JUX0 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SPIN3Q5JUX0 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SPIN3Q5JUX0 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SPIN3Q5JUX0 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SPIN3Q5JUX0 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SPIN3Q5JUX0 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SPIN3Q5JUX0 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SPIN3Q5JUX0 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SPIN3Q5JUX0 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SPIN3Q5JUX0 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SPIN3Q5JUX0 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SPIN3Q5JUX0 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SPIN3Q5JUX0 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SPIN3Q5JUX0 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SPIN3Q5JUX0 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SPIN3Q5JUX0 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SPIN3Q5JUX0 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SPIN3Q5JUX0 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SPIN3Q5JUX0 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SPIN3Q5JUX0 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SPIN3Q5JUX0 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SPIN3Q5JUX0 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SPIN3Q5JUX0 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SPIN3Q5JUX0 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SPIN3Q5JUX0 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
SPIN3Q5JUX0 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SPIN3Q5JUX0 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SPIN3Q5JUX0 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SPIN3Q5JUX0 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SPIN3Q5JUX0 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SPIN3Q5JUX0 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SPIN3Q5JUX0 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SPIN3Q5JUX0 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SPIN3Q5JUX0 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SPIN3Q5JUX0 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SPIN3Q5JUX0 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SPIN3Q5JUX0 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SPIN3Q5JUX0 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPIN3Q5JUX0 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SPIN3Q5JUX0 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SPIN3Q5JUX0 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SPIN3Q5JUX0 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPIN3Q5JUX0 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SPIN3Q5JUX0 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SPIN3Q5JUX0 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SPIN3Q5JUX0 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SPIN3Q5JUX0 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms