RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000399240.5

RUNX1-205, Transcript of runt related transcription factor 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene RUNX1, Length 1,590 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX1-205ENST00000399240 NISCHQ9Y2I1 1504 aa57.85■■■■■ 6.85
RUNX1-205ENST00000399240 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa51.04■■■■■ 5.76
RUNX1-205ENST00000399240 ABCC9O60706 1549 aa49.12■■■■■ 5.45
RUNX1-205ENST00000399240 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP48.38■■■■■ 5.34
RUNX1-205ENST00000399240 DCAF8L2P0C7V8 631 aa47.97■■■■■ 5.27
RUNX1-205ENST00000399240 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa47.85■■■■■ 5.25
RUNX1-205ENST00000399240 NACADO15069 1562 aa47.73■■■■■ 5.23
RUNX1-205ENST00000399240 MYO15BQ96JP2 1530 aa47.7■■■■■ 5.23
RUNX1-205ENST00000399240 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa47.58■■■■■ 5.21
RUNX1-205ENST00000399240 SCRIBQ14160 1630 aa46.7■■■■■ 5.07
RUNX1-205ENST00000399240 UNC13AQ9UPW8 1703 aa46.69■■■■■ 5.06
RUNX1-205ENST00000399240 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa46.31■■■■■ 5
RUNX1-205ENST00000399240 BICRAQ9NZM4 1560 aa46.2■■■■■ 4.99
RUNX1-205ENST00000399240 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP46.05■■■■■ 4.96
RUNX1-205ENST00000399240 CECR2Q9BXF3 1484 aa45.02■■■■■ 4.8
RUNX1-205ENST00000399240 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP44.87■■■■■ 4.77
RUNX1-205ENST00000399240 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP44.75■■■■■ 4.75
RUNX1-205ENST00000399240 SMARCA4P51532 1647 aa44.73■■■■■ 4.75
RUNX1-205ENST00000399240 MROH2BQ7Z745 1585 aa44.64■■■■■ 4.74
RUNX1-205ENST00000399240 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa44.49■■■■■ 4.71
RUNX1-205ENST00000399240 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP44.41■■■■■ 4.7
RUNX1-205ENST00000399240 DNAJC5BQ9UF47 199 aa44.31■■■■■ 4.68
RUNX1-205ENST00000399240 WIZO95785 1651 aa44.25■■■■■ 4.67
RUNX1-205ENST00000399240 PEG3Q9GZU2 1588 aa44.25■■■■■ 4.67
RUNX1-205ENST00000399240 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa44.22■■■■■ 4.67
RUNX1-205ENST00000399240 SMARCA2P51531 1590 aa44.18■■■■■ 4.66
RUNX1-205ENST00000399240 NCAPD3P42695 1498 aa44.03■■■■■ 4.64
RUNX1-205ENST00000399240 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP43.97■■■■■ 4.63
RUNX1-205ENST00000399240 HMGXB3Q12766 1538 aa43.92■■■■■ 4.62
RUNX1-205ENST00000399240 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP43.9■■■■■ 4.62
RUNX1-205ENST00000399240 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP43.75■■■■■ 4.59
RUNX1-205ENST00000399240 CCDC88BA6NC98 1476 aa43.25■■■■■ 4.51
RUNX1-205ENST00000399240 NESP48681 1621 aa42.81■■■■■ 4.44
RUNX1-205ENST00000399240 CADPSQ9ULU8 1353 aa42.79■■■■■ 4.44
RUNX1-205ENST00000399240 CFTRP13569 1480 aa42.76■■■■■ 4.43
RUNX1-205ENST00000399240 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa42.75■■■■■ 4.43
RUNX1-205ENST00000399240 PRDM2Q13029 1718 aa42.59■■■■■ 4.41
RUNX1-205ENST00000399240 PDS5BQ9NTI5 1447 aa42.38■■■■■ 4.37
RUNX1-205ENST00000399240 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa42.36■■■■■ 4.37
RUNX1-205ENST00000399240 FANCD2Q9BXW9 1451 aa42.34■■■■■ 4.37
RUNX1-205ENST00000399240 ERCC6Q03468 1493 aa42.21■■■■■ 4.35
RUNX1-205ENST00000399240 CEP164Q9UPV0 1460 aa42.18■■■■■ 4.34
RUNX1-205ENST00000399240 ABCC8Q09428 1581 aa42.01■■■■■ 4.32
RUNX1-205ENST00000399240 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP41.95■■■■■ 4.31
RUNX1-205ENST00000399240 MRC2Q9UBG0 1479 aa41.94■■■■■ 4.3
RUNX1-205ENST00000399240 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP41.89■■■■■ 4.3
RUNX1-205ENST00000399240 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP41.83■■■■■ 4.29
RUNX1-205ENST00000399240 CUX1P39880 1505 aa41.82■■■■■ 4.29
RUNX1-205ENST00000399240 WDR62O43379 1518 aa41.8■■■■■ 4.28
RUNX1-205ENST00000399240 DNMBPQ6XZF7 1577 aa41.8■■■■■ 4.28
RUNX1-205ENST00000399240 TOPBP1Q92547 1522 aa41.78■■■■■ 4.28
RUNX1-205ENST00000399240 SYNJ1O43426 1573 aa41.76■■■■■ 4.28
RUNX1-205ENST00000399240 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa41.69■■■■■ 4.26
RUNX1-205ENST00000399240 TOP2BQ02880 1626 aa41.68■■■■■ 4.26
RUNX1-205ENST00000399240 CHIC1Q5VXU3 224 aa41.55■■■■■ 4.24
RUNX1-205ENST00000399240 FGD5Q6ZNL6 1462 aa41.52■■■■■ 4.24
RUNX1-205ENST00000399240 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP41.49■■■■■ 4.23
RUNX1-205ENST00000399240 TRIM41Q8WV44 630 aa41.44■■■■■ 4.22
RUNX1-205ENST00000399240 CUX2O14529 1486 aa41.41■■■■■ 4.22
RUNX1-205ENST00000399240 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa41.33■■■■■ 4.21
RUNX1-205ENST00000399240 SOGA1O94964 1423 aa41.29■■■■■ 4.2
RUNX1-205ENST00000399240 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP41.29■■■■■ 4.2
RUNX1-205ENST00000399240 IFT140Q96RY7 1462 aa41.24■■■■■ 4.19
RUNX1-205ENST00000399240 WDR97A6NE52 1622 aa41.2■■■■■ 4.19
RUNX1-205ENST00000399240 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa41.13■■■■■ 4.17
RUNX1-205ENST00000399240 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP41.07■■■■■ 4.17
RUNX1-205ENST00000399240 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP40.99■■■■■ 4.15
RUNX1-205ENST00000399240 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP40.95■■■■■ 4.15
RUNX1-205ENST00000399240 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa40.94■■■■■ 4.14
RUNX1-205ENST00000399240 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP40.93■■■■■ 4.147e-7■■■■□ 24.7
RUNX1-205ENST00000399240 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa40.89■■■■■ 4.14
RUNX1-205ENST00000399240 KIF27Q86VH2 1401 aa40.85■■■■■ 4.13
RUNX1-205ENST00000399240 GAPVD1Q14C86 1478 aa40.84■■■■■ 4.13
RUNX1-205ENST00000399240 PBRM1Q86U86 1689 aa40.79■■■■■ 4.12
RUNX1-205ENST00000399240 GRIN2BQ13224 1484 aa40.69■■■■■ 4.1
RUNX1-205ENST00000399240 ERICH3Q5RHP9 1530 aa40.64■■■■■ 4.1
RUNX1-205ENST00000399240 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP40.63■■■■■ 4.09
RUNX1-205ENST00000399240 EEA1Q15075 1411 aa40.63■■■■■ 4.09
RUNX1-205ENST00000399240 IGF1RP08069 1367 aa40.61■■■■■ 4.09
RUNX1-205ENST00000399240 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa40.56■■■■■ 4.08
RUNX1-205ENST00000399240 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP40.49■■■■■ 4.07
RUNX1-205ENST00000399240 CSRNP3Q8WYN3 585 aa40.48■■■■■ 4.07
RUNX1-205ENST00000399240 CUL7Q14999 1698 aa40.47■■■■■ 4.07
RUNX1-205ENST00000399240 ADAMTS12P58397 1594 aa40.47■■■■■ 4.07
RUNX1-205ENST00000399240 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa40.38■■■■■ 4.05
RUNX1-205ENST00000399240 FHAD1B1AJZ9 1412 aa40.37■■■■■ 4.05
RUNX1-205ENST00000399240 PRXQ9BXM0 1461 aa40.34■■■■■ 4.05
RUNX1-205ENST00000399240 SYNJ2O15056 1496 aa40.33■■■■■ 4.05
RUNX1-205ENST00000399240 CHD1O14646 1710 aa40.3■■■■■ 4.04
RUNX1-205ENST00000399240 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa40.24■■■■■ 4.03
RUNX1-205ENST00000399240 KIF21BO75037 1637 aa40.23■■■■■ 4.03
RUNX1-205ENST00000399240 FBLN2P98095 1184 aa40.23■■■■■ 4.03
RUNX1-205ENST00000399240 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP40.23■■■■■ 4.03
RUNX1-205ENST00000399240 GRIN2AQ12879 1464 aa40.2■■■■■ 4.03
RUNX1-205ENST00000399240 EHMT2Q96KQ7 1210 aa40.08■■■■■ 4.01
RUNX1-205ENST00000399240 GOLGA3Q08378 1498 aa40.03■■■■■ 4
RUNX1-205ENST00000399240 CEP170Q5SW79 1584 aa40.01■■■■■ 4
RUNX1-205ENST00000399240 NUP160Q12769 1436 aa39.97■■■■□ 3.99
RUNX1-205ENST00000399240 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa39.91■■■■□ 3.98
RUNX1-205ENST00000399240 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa39.9■■■■□ 3.98
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