RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000303004.4

CEBPB-201, Transcript of CCAAT enhancer binding protein beta, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene CEBPB, Length 1,956 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEBPB-201ENST00000303004 NISCHQ9Y2I1 1504 aa49.43■■■■■ 5.5
CEBPB-201ENST00000303004 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa42.19■■■■■ 4.35
CEBPB-201ENST00000303004 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP41.89■■■■■ 4.3
CEBPB-201ENST00000303004 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa41.63■■■■■ 4.25
CEBPB-201ENST00000303004 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP40.92■■■■■ 4.14
CEBPB-201ENST00000303004 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa40.85■■■■■ 4.13
CEBPB-201ENST00000303004 DCAF8L2P0C7V8 631 aa40.32■■■■■ 4.04
CEBPB-201ENST00000303004 CHIC1Q5VXU3 224 aa40.1■■■■■ 4.01
CEBPB-201ENST00000303004 MYO15BQ96JP2 1530 aa39.87■■■■□ 3.97
CEBPB-201ENST00000303004 ABCC9O60706 1549 aa39.54■■■■□ 3.92
CEBPB-201ENST00000303004 SCRIBQ14160 1630 aa39.14■■■■□ 3.86
CEBPB-201ENST00000303004 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP39.07■■■■□ 3.84
CEBPB-201ENST00000303004 HRCP23327 699 aa39.05■■■■□ 3.84
CEBPB-201ENST00000303004 NACADO15069 1562 aa38.93■■■■□ 3.82
CEBPB-201ENST00000303004 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa38.77■■■■□ 3.8
CEBPB-201ENST00000303004 PCGF6Q9BYE7 350 aa38.72■■■■□ 3.79
CEBPB-201ENST00000303004 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa38.65■■■■□ 3.78
CEBPB-201ENST00000303004 CECR2Q9BXF3 1484 aa38.33■■■■□ 3.73
CEBPB-201ENST00000303004 TRIM41Q8WV44 630 aa38.31■■■■□ 3.72
CEBPB-201ENST00000303004 MROH2BQ7Z745 1585 aa38.29■■■■□ 3.72
CEBPB-201ENST00000303004 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP38.27■■■■□ 3.72
CEBPB-201ENST00000303004 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP38.05■■■■□ 3.68
CEBPB-201ENST00000303004 WIZO95785 1651 aa38.05■■■■□ 3.68
CEBPB-201ENST00000303004 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP37.83■■■■□ 3.65
CEBPB-201ENST00000303004 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP37.82■■■■□ 3.64
CEBPB-201ENST00000303004 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP37.69■■■■□ 3.62
CEBPB-201ENST00000303004 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP37.67■■■■□ 3.62
CEBPB-201ENST00000303004 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP37.64■■■■□ 3.62
CEBPB-201ENST00000303004 SMARCA4P51532 1647 aa37.61■■■■□ 3.61
CEBPB-201ENST00000303004 UNC13AQ9UPW8 1703 aa37.49■■■■□ 3.59
CEBPB-201ENST00000303004 SMARCA2P51531 1590 aa37.39■■■■□ 3.58
CEBPB-201ENST00000303004 CCDC88BA6NC98 1476 aa37.38■■■■□ 3.57
CEBPB-201ENST00000303004 ABCC8Q09428 1581 aa37.14■■■■□ 3.54
CEBPB-201ENST00000303004 EHMT2Q96KQ7 1210 aa37.11■■■■□ 3.53
CEBPB-201ENST00000303004 PEG3Q9GZU2 1588 aa37.09■■■■□ 3.53
CEBPB-201ENST00000303004 EEA1Q15075 1411 aa37.08■■■■□ 3.53
CEBPB-201ENST00000303004 BICRAQ9NZM4 1560 aa37.07■■■■□ 3.52
CEBPB-201ENST00000303004 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP37.04■■■■□ 3.52
CEBPB-201ENST00000303004 TNIKQ9UKE5 1360 aa36.9■■■■□ 3.5
CEBPB-201ENST00000303004 SOGA1O94964 1423 aa36.84■■■■□ 3.49
CEBPB-201ENST00000303004 CEP162Q5TB80 1403 aa36.83■■■■□ 3.49
CEBPB-201ENST00000303004 CSRNP3Q8WYN3 585 aa36.74■■■■□ 3.47
CEBPB-201ENST00000303004 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP36.68■■■■□ 3.46
CEBPB-201ENST00000303004 GOLGA3Q08378 1498 aa36.65■■■■□ 3.46
CEBPB-201ENST00000303004 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa36.6■■■■□ 3.45
CEBPB-201ENST00000303004 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa36.59■■■■□ 3.45
CEBPB-201ENST00000303004 KIF21BO75037 1637 aa36.48■■■■□ 3.43
CEBPB-201ENST00000303004 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP36.47■■■■□ 3.43
CEBPB-201ENST00000303004 SYNJ1O43426 1573 aa36.47■■■■□ 3.43
CEBPB-201ENST00000303004 CEP164Q9UPV0 1460 aa36.46■■■■□ 3.43
CEBPB-201ENST00000303004 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP36.45■■■■□ 3.43
CEBPB-201ENST00000303004 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP36.42■■■■□ 3.42
CEBPB-201ENST00000303004 UBTFP17480 764 aaKnown RBP36.41■■■■□ 3.42
CEBPB-201ENST00000303004 TOP2BQ02880 1626 aa36.17■■■■□ 3.38
CEBPB-201ENST00000303004 CLIP1P30622 1438 aa36.14■■■■□ 3.38
CEBPB-201ENST00000303004 VPS8Q8N3P4 1428 aa36.08■■■■□ 3.37
CEBPB-201ENST00000303004 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa36.07■■■■□ 3.37
CEBPB-201ENST00000303004 HMGXB3Q12766 1538 aa36.04■■■■□ 3.36
CEBPB-201ENST00000303004 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP36.01■■■■□ 3.36
CEBPB-201ENST00000303004 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa36■■■■□ 3.35
CEBPB-201ENST00000303004 NCAPD3P42695 1498 aa35.98■■■■□ 3.35
CEBPB-201ENST00000303004 ERICH3Q5RHP9 1530 aa35.93■■■■□ 3.34
CEBPB-201ENST00000303004 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP35.86■■■■□ 3.33
CEBPB-201ENST00000303004 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP35.84■■■■□ 3.33
CEBPB-201ENST00000303004 PRXQ9BXM0 1461 aa35.83■■■■□ 3.33
CEBPB-201ENST00000303004 APLP2Q06481 763 aa35.74■■■■□ 3.31
CEBPB-201ENST00000303004 CUX1P39880 1505 aa35.68■■■■□ 3.3
CEBPB-201ENST00000303004 CFTRP13569 1480 aa35.68■■■■□ 3.3
CEBPB-201ENST00000303004 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP35.65■■■■□ 3.3
CEBPB-201ENST00000303004 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP35.64■■■■□ 3.3
CEBPB-201ENST00000303004 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP35.61■■■■□ 3.29
CEBPB-201ENST00000303004 KIF27Q86VH2 1401 aa35.6■■■■□ 3.29
CEBPB-201ENST00000303004 ARAP1Q96P48 1450 aa35.57■■■■□ 3.28
CEBPB-201ENST00000303004 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP35.55■■■■□ 3.28
CEBPB-201ENST00000303004 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP35.52■■■■□ 3.28
CEBPB-201ENST00000303004 PRDM2Q13029 1718 aa35.48■■■■□ 3.27
CEBPB-201ENST00000303004 NEUROD1Q13562 356 aa35.45■■■■□ 3.27
CEBPB-201ENST00000303004 CLSPNQ9HAW4 1339 aa35.43■■■■□ 3.26
CEBPB-201ENST00000303004 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP35.31■■■■□ 3.24
CEBPB-201ENST00000303004 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP35.31■■■■□ 3.24
CEBPB-201ENST00000303004 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa35.25■■■■□ 3.23
CEBPB-201ENST00000303004 CUX2O14529 1486 aa35.21■■■■□ 3.23
CEBPB-201ENST00000303004 CADPSQ9ULU8 1353 aa35.2■■■■□ 3.23
CEBPB-201ENST00000303004 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP35.18■■■■□ 3.22
CEBPB-201ENST00000303004 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP35.18■■■■□ 3.22
CEBPB-201ENST00000303004 IGF1RP08069 1367 aa35.15■■■■□ 3.22
CEBPB-201ENST00000303004 MAP3K1Q13233 1512 aa35.14■■■■□ 3.22
CEBPB-201ENST00000303004 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa35.09■■■■□ 3.21
CEBPB-201ENST00000303004 CCNB3Q8WWL7 1395 aa35.04■■■■□ 3.2
CEBPB-201ENST00000303004 FGD5Q6ZNL6 1462 aa35.01■■■■□ 3.2
CEBPB-201ENST00000303004 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa34.98■■■■□ 3.19
CEBPB-201ENST00000303004 MIER1Q8N108 512 aa34.98■■■■□ 3.19
CEBPB-201ENST00000303004 TIAM1Q13009 1591 aa34.94■■■■□ 3.18
CEBPB-201ENST00000303004 FHAD1B1AJZ9 1412 aa34.83■■■■□ 3.17
CEBPB-201ENST00000303004 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa34.82■■■■□ 3.17
CEBPB-201ENST00000303004 FANCD2Q9BXW9 1451 aa34.81■■■■□ 3.16
CEBPB-201ENST00000303004 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa34.79■■■■□ 3.16
CEBPB-201ENST00000303004 DNMBPQ6XZF7 1577 aa34.78■■■■□ 3.16
CEBPB-201ENST00000303004 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa34.75■■■■□ 3.15
CEBPB-201ENST00000303004 CFAP43Q8NDM7 1665 aa34.74■■■■□ 3.15
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