RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489155.1

PFN2-211, Transcript of profilin 2, humanhuman

TSL 4 BASIC

Gene PFN2, Length 636 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFN2-211ENST00000489155 NISCHQ9Y2I1 1504 aa58.87■■■■■ 7.01
PFN2-211ENST00000489155 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa52.22■■■■■ 5.95
PFN2-211ENST00000489155 ABCC9O60706 1549 aa50.63■■■■■ 5.7
PFN2-211ENST00000489155 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP49.1■■■■■ 5.45
PFN2-211ENST00000489155 NACADO15069 1562 aa49.01■■■■■ 5.44
PFN2-211ENST00000489155 DCAF8L2P0C7V8 631 aa48.97■■■■■ 5.43
PFN2-211ENST00000489155 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa48.96■■■■■ 5.43
PFN2-211ENST00000489155 MYO15BQ96JP2 1530 aa48.88■■■■■ 5.42
PFN2-211ENST00000489155 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa48.79■■■■■ 5.4
PFN2-211ENST00000489155 UNC13AQ9UPW8 1703 aa47.81■■■■■ 5.24
PFN2-211ENST00000489155 SCRIBQ14160 1630 aa47.56■■■■■ 5.2
PFN2-211ENST00000489155 BICRAQ9NZM4 1560 aa47.42■■■■■ 5.18
PFN2-211ENST00000489155 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP47.37■■■■■ 5.17
PFN2-211ENST00000489155 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa47.06■■■■■ 5.12
PFN2-211ENST00000489155 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP46.14■■■■■ 4.98
PFN2-211ENST00000489155 DNAJC5BQ9UF47 199 aa46.14■■■■■ 4.98
PFN2-211ENST00000489155 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa45.85■■■■■ 4.93
PFN2-211ENST00000489155 CECR2Q9BXF3 1484 aa45.76■■■■■ 4.92
PFN2-211ENST00000489155 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP45.62■■■■■ 4.89
PFN2-211ENST00000489155 SMARCA4P51532 1647 aa45.59■■■■■ 4.89
PFN2-211ENST00000489155 MROH2BQ7Z745 1585 aa45.33■■■■■ 4.85
PFN2-211ENST00000489155 SMARCA2P51531 1590 aa45.25■■■■■ 4.83
PFN2-211ENST00000489155 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa45.25■■■■■ 4.83
PFN2-211ENST00000489155 NCAPD3P42695 1498 aa45.21■■■■■ 4.83
PFN2-211ENST00000489155 PEG3Q9GZU2 1588 aa45.18■■■■■ 4.82
PFN2-211ENST00000489155 HMGXB3Q12766 1538 aa45.01■■■■■ 4.8
PFN2-211ENST00000489155 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP44.97■■■■■ 4.79
PFN2-211ENST00000489155 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP44.9■■■■■ 4.78
PFN2-211ENST00000489155 WIZO95785 1651 aa44.86■■■■■ 4.77
PFN2-211ENST00000489155 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP44.45■■■■■ 4.71
PFN2-211ENST00000489155 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP44.06■■■■■ 4.64
PFN2-211ENST00000489155 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa43.96■■■■■ 4.63
PFN2-211ENST00000489155 NESP48681 1621 aa43.91■■■■■ 4.62
PFN2-211ENST00000489155 CCDC88BA6NC98 1476 aa43.91■■■■■ 4.62
PFN2-211ENST00000489155 CADPSQ9ULU8 1353 aa43.9■■■■■ 4.62
PFN2-211ENST00000489155 CFTRP13569 1480 aa43.71■■■■■ 4.59
PFN2-211ENST00000489155 PDS5BQ9NTI5 1447 aa43.65■■■■■ 4.58
PFN2-211ENST00000489155 ERCC6Q03468 1493 aa43.64■■■■■ 4.58
PFN2-211ENST00000489155 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa43.43■■■■■ 4.54
PFN2-211ENST00000489155 PRDM2Q13029 1718 aa43.43■■■■■ 4.54
PFN2-211ENST00000489155 FANCD2Q9BXW9 1451 aa43.36■■■■■ 4.53
PFN2-211ENST00000489155 CEP164Q9UPV0 1460 aa43.28■■■■■ 4.52
PFN2-211ENST00000489155 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP43.2■■■■■ 4.51
PFN2-211ENST00000489155 MRC2Q9UBG0 1479 aa43.15■■■■■ 4.5
PFN2-211ENST00000489155 CUX2O14529 1486 aa43.11■■■■■ 4.49
PFN2-211ENST00000489155 WDR62O43379 1518 aa42.99■■■■■ 4.47
PFN2-211ENST00000489155 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP42.89■■■■■ 4.46
PFN2-211ENST00000489155 ABCC8Q09428 1581 aa42.82■■■■■ 4.44
PFN2-211ENST00000489155 TOPBP1Q92547 1522 aa42.71■■■■■ 4.43
PFN2-211ENST00000489155 DNMBPQ6XZF7 1577 aa42.71■■■■■ 4.43
PFN2-211ENST00000489155 CUX1P39880 1505 aa42.51■■■■■ 4.39
PFN2-211ENST00000489155 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP42.4■■■■■ 4.38
PFN2-211ENST00000489155 IFT140Q96RY7 1462 aa42.38■■■■■ 4.38
PFN2-211ENST00000489155 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP42.37■■■■■ 4.37
PFN2-211ENST00000489155 FGD5Q6ZNL6 1462 aa42.31■■■■■ 4.36
PFN2-211ENST00000489155 TOP2BQ02880 1626 aa42.28■■■■■ 4.36
PFN2-211ENST00000489155 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa42.28■■■■■ 4.36
PFN2-211ENST00000489155 SYNJ1O43426 1573 aa42.23■■■■■ 4.35
PFN2-211ENST00000489155 SOGA1O94964 1423 aa42.23■■■■■ 4.35
PFN2-211ENST00000489155 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP42.23■■■■■ 4.35
PFN2-211ENST00000489155 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa42.15■■■■■ 4.34
PFN2-211ENST00000489155 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP42.09■■■■■ 4.33
PFN2-211ENST00000489155 WDR97A6NE52 1622 aa41.99■■■■■ 4.31
PFN2-211ENST00000489155 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa41.96■■■■■ 4.31
PFN2-211ENST00000489155 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP41.96■■■■■ 4.31
PFN2-211ENST00000489155 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP41.92■■■■■ 4.35e-12■■■■■ 47.9
PFN2-211ENST00000489155 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP41.9■■■■■ 4.3
PFN2-211ENST00000489155 GAPVD1Q14C86 1478 aa41.74■■■■■ 4.27
PFN2-211ENST00000489155 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa41.74■■■■■ 4.27
PFN2-211ENST00000489155 GRIN2BQ13224 1484 aa41.7■■■■■ 4.27
PFN2-211ENST00000489155 TRIM41Q8WV44 630 aa41.65■■■■■ 4.26
PFN2-211ENST00000489155 PBRM1Q86U86 1689 aa41.61■■■■■ 4.25
PFN2-211ENST00000489155 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP41.56■■■■■ 4.24
PFN2-211ENST00000489155 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa41.53■■■■■ 4.24
PFN2-211ENST00000489155 KIF27Q86VH2 1401 aa41.51■■■■■ 4.24
PFN2-211ENST00000489155 ERICH3Q5RHP9 1530 aa41.49■■■■■ 4.23
PFN2-211ENST00000489155 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa41.48■■■■■ 4.23
PFN2-211ENST00000489155 OSCARQ8IYS5 282 aa41.39■■■■■ 4.22
PFN2-211ENST00000489155 CHIC1Q5VXU3 224 aa41.38■■■■■ 4.21
PFN2-211ENST00000489155 SYNJ2O15056 1496 aa41.38■■■■■ 4.21
PFN2-211ENST00000489155 CHD1O14646 1710 aa41.37■■■■■ 4.21
PFN2-211ENST00000489155 FBLN2P98095 1184 aa41.34■■■■■ 4.21
PFN2-211ENST00000489155 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP41.34■■■■■ 4.21
PFN2-211ENST00000489155 ADAMTS12P58397 1594 aa41.29■■■■■ 4.2
PFN2-211ENST00000489155 FHAD1B1AJZ9 1412 aa41.29■■■■■ 4.2
PFN2-211ENST00000489155 IGF1RP08069 1367 aa41.29■■■■■ 4.2
PFN2-211ENST00000489155 CUL7Q14999 1698 aa41.17■■■■■ 4.18
PFN2-211ENST00000489155 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa41.16■■■■■ 4.18
PFN2-211ENST00000489155 GRIN2AQ12879 1464 aa41.14■■■■■ 4.18
PFN2-211ENST00000489155 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa41.05■■■■■ 4.16
PFN2-211ENST00000489155 EEA1Q15075 1411 aa41.01■■■■■ 4.15
PFN2-211ENST00000489155 NUP160Q12769 1436 aa40.95■■■■■ 4.15
PFN2-211ENST00000489155 CLASP1Q7Z460 1538 aa40.95■■■■■ 4.15
PFN2-211ENST00000489155 CEP170Q5SW79 1584 aa40.9■■■■■ 4.14
PFN2-211ENST00000489155 CSRNP3Q8WYN3 585 aa40.86■■■■■ 4.13
PFN2-211ENST00000489155 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa40.85■■■■■ 4.13
PFN2-211ENST00000489155 PRXQ9BXM0 1461 aa40.79■■■■■ 4.12
PFN2-211ENST00000489155 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP40.69■■■■■ 4.1
PFN2-211ENST00000489155 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa40.67■■■■■ 4.1
PFN2-211ENST00000489155 ARHGEF11O15085 1522 aa40.67■■■■■ 4.1
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