RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000379390.10

TM6SF1-204, Transcript of transmembrane 6 superfamily member 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TM6SF1, Length 1,638 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM6SF1-204ENST00000379390 NISCHQ9Y2I1 1504 aa57.92■■■■■ 6.86
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TM6SF1-204ENST00000379390 PRDM2Q13029 1718 aa42.75■■■■■ 4.43
TM6SF1-204ENST00000379390 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa42.52■■■■■ 4.4
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TM6SF1-204ENST00000379390 FANCD2Q9BXW9 1451 aa42.43■■■■■ 4.38
TM6SF1-204ENST00000379390 ERCC6Q03468 1493 aa42.38■■■■■ 4.37
TM6SF1-204ENST00000379390 CEP164Q9UPV0 1460 aa42.31■■■■■ 4.36
TM6SF1-204ENST00000379390 ABCC8Q09428 1581 aa42.09■■■■■ 4.33
TM6SF1-204ENST00000379390 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP42.09■■■■■ 4.33
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TM6SF1-204ENST00000379390 WDR97A6NE52 1622 aa41.3■■■■■ 4.2
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TM6SF1-204ENST00000379390 CEP170Q5SW79 1584 aa40.12■■■■■ 4.01
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TM6SF1-204ENST00000379390 OSCARQ8IYS5 282 aa39.94■■■■□ 3.99
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