RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000532743.5

RAD51-208, Transcript of RAD51 recombinase, humanhuman

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Gene RAD51, Length 1,515 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD51-208ENST00000532743 NISCHQ9Y2I1 1504 aa59.27■■■■■ 7.08
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RAD51-208ENST00000532743 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa49.49■■■■■ 5.51
RAD51-208ENST00000532743 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP49.44■■■■■ 5.51
RAD51-208ENST00000532743 NACADO15069 1562 aa49.43■■■■■ 5.5
RAD51-208ENST00000532743 DCAF8L2P0C7V8 631 aa49.43■■■■■ 5.5
RAD51-208ENST00000532743 MYO15BQ96JP2 1530 aa49.13■■■■■ 5.46
RAD51-208ENST00000532743 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa49.04■■■■■ 5.44
RAD51-208ENST00000532743 UNC13AQ9UPW8 1703 aa48.56■■■■■ 5.36
RAD51-208ENST00000532743 SCRIBQ14160 1630 aa48.15■■■■■ 5.3
RAD51-208ENST00000532743 BICRAQ9NZM4 1560 aa47.9■■■■■ 5.26
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RAD51-208ENST00000532743 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa47.42■■■■■ 5.18
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RAD51-208ENST00000532743 DNAJC5BQ9UF47 199 aa46.62■■■■■ 5.05
RAD51-208ENST00000532743 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa46.44■■■■■ 5.03
RAD51-208ENST00000532743 CECR2Q9BXF3 1484 aa46.1■■■■■ 4.97
RAD51-208ENST00000532743 SMARCA4P51532 1647 aa46.04■■■■■ 4.96
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RAD51-208ENST00000532743 MROH2BQ7Z745 1585 aa45.69■■■■■ 4.9
RAD51-208ENST00000532743 SMARCA2P51531 1590 aa45.66■■■■■ 4.9
RAD51-208ENST00000532743 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa45.6■■■■■ 4.89
RAD51-208ENST00000532743 PEG3Q9GZU2 1588 aa45.52■■■■■ 4.88
RAD51-208ENST00000532743 NCAPD3P42695 1498 aa45.49■■■■■ 4.87
RAD51-208ENST00000532743 HMGXB3Q12766 1538 aa45.41■■■■■ 4.86
RAD51-208ENST00000532743 WIZO95785 1651 aa45.33■■■■■ 4.85
RAD51-208ENST00000532743 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP45.33■■■■■ 4.85
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RAD51-208ENST00000532743 NESP48681 1621 aa44.41■■■■■ 4.7
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RAD51-208ENST00000532743 ERCC6Q03468 1493 aa44.23■■■■■ 4.67
RAD51-208ENST00000532743 CADPSQ9ULU8 1353 aa44.19■■■■■ 4.66
RAD51-208ENST00000532743 CCDC88BA6NC98 1476 aa44.19■■■■■ 4.66
RAD51-208ENST00000532743 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa44.1■■■■■ 4.65
RAD51-208ENST00000532743 PRDM2Q13029 1718 aa44.07■■■■■ 4.64
RAD51-208ENST00000532743 PDS5BQ9NTI5 1447 aa44.02■■■■■ 4.64
RAD51-208ENST00000532743 CFTRP13569 1480 aa44.01■■■■■ 4.64
RAD51-208ENST00000532743 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP43.78■■■■■ 4.6
RAD51-208ENST00000532743 FANCD2Q9BXW9 1451 aa43.77■■■■■ 4.6
RAD51-208ENST00000532743 CEP164Q9UPV0 1460 aa43.73■■■■■ 4.59
RAD51-208ENST00000532743 CUX2O14529 1486 aa43.59■■■■■ 4.57
RAD51-208ENST00000532743 MRC2Q9UBG0 1479 aa43.59■■■■■ 4.57
RAD51-208ENST00000532743 WDR62O43379 1518 aa43.46■■■■■ 4.55
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RAD51-208ENST00000532743 DNMBPQ6XZF7 1577 aa43.13■■■■■ 4.49
RAD51-208ENST00000532743 ABCC8Q09428 1581 aa43.11■■■■■ 4.49
RAD51-208ENST00000532743 TOPBP1Q92547 1522 aa43.1■■■■■ 4.49
RAD51-208ENST00000532743 CUX1P39880 1505 aa42.86■■■■■ 4.45
RAD51-208ENST00000532743 IFT140Q96RY7 1462 aa42.76■■■■■ 4.43
RAD51-208ENST00000532743 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP42.74■■■■■ 4.43
RAD51-208ENST00000532743 FGD5Q6ZNL6 1462 aa42.7■■■■■ 4.43
RAD51-208ENST00000532743 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP42.67■■■■■ 4.42
RAD51-208ENST00000532743 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa42.67■■■■■ 4.42
RAD51-208ENST00000532743 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP42.65■■■■■ 4.42
RAD51-208ENST00000532743 SYNJ1O43426 1573 aa42.63■■■■■ 4.41
RAD51-208ENST00000532743 TOP2BQ02880 1626 aa42.62■■■■■ 4.41
RAD51-208ENST00000532743 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa42.53■■■■■ 4.4
RAD51-208ENST00000532743 SOGA1O94964 1423 aa42.53■■■■■ 4.4
RAD51-208ENST00000532743 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP42.52■■■■■ 4.4
RAD51-208ENST00000532743 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP42.52■■■■■ 4.4
RAD51-208ENST00000532743 WDR97A6NE52 1622 aa42.47■■■■■ 4.39
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RAD51-208ENST00000532743 PBRM1Q86U86 1689 aa42.21■■■■■ 4.35
RAD51-208ENST00000532743 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa42.17■■■■■ 4.34
RAD51-208ENST00000532743 GAPVD1Q14C86 1478 aa42.1■■■■■ 4.33
RAD51-208ENST00000532743 GRIN2BQ13224 1484 aa42.04■■■■■ 4.32
RAD51-208ENST00000532743 CHD1O14646 1710 aa42.03■■■■■ 4.32
RAD51-208ENST00000532743 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa41.98■■■■■ 4.31
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RAD51-208ENST00000532743 TRIM41Q8WV44 630 aa41.81■■■■■ 4.28
RAD51-208ENST00000532743 ERICH3Q5RHP9 1530 aa41.81■■■■■ 4.28
RAD51-208ENST00000532743 FBLN2P98095 1184 aa41.79■■■■■ 4.28
RAD51-208ENST00000532743 KIF27Q86VH2 1401 aa41.76■■■■■ 4.28
RAD51-208ENST00000532743 OSCARQ8IYS5 282 aa41.76■■■■■ 4.28
RAD51-208ENST00000532743 ADAMTS12P58397 1594 aa41.75■■■■■ 4.27
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RAD51-208ENST00000532743 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP41.68■■■■■ 4.26
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RAD51-208ENST00000532743 FHAD1B1AJZ9 1412 aa41.58■■■■■ 4.25
RAD51-208ENST00000532743 GRIN2AQ12879 1464 aa41.53■■■■■ 4.24
RAD51-208ENST00000532743 IGF1RP08069 1367 aa41.44■■■■■ 4.22
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RAD51-208ENST00000532743 CHIC1Q5VXU3 224 aa41.37■■■■■ 4.21
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RAD51-208ENST00000532743 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa41.24■■■■■ 4.19
RAD51-208ENST00000532743 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa41.24■■■■■ 4.19
RAD51-208ENST00000532743 ARHGEF11O15085 1522 aa41.19■■■■■ 4.18
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RAD51-208ENST00000532743 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa41.11■■■■■ 4.17
RAD51-208ENST00000532743 SHROOM2Q13796 1616 aa41.05■■■■■ 4.16
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