Protein–RNA interactions for Protein: O15553

MEFV, Pyrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEFVO15553 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
MEFVO15553 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
MEFVO15553 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
MEFVO15553 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
MEFVO15553 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
MEFVO15553 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
MEFVO15553 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
MEFVO15553 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
MEFVO15553 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
MEFVO15553 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
MEFVO15553 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
MEFVO15553 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
MEFVO15553 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
MEFVO15553 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
MEFVO15553 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
MEFVO15553 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
MEFVO15553 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
MEFVO15553 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
MEFVO15553 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
MEFVO15553 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
MEFVO15553 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
MEFVO15553 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
MEFVO15553 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
MEFVO15553 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
MEFVO15553 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
MEFVO15553 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
MEFVO15553 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
MEFVO15553 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
MEFVO15553 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
MEFVO15553 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
MEFVO15553 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
MEFVO15553 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
MEFVO15553 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
MEFVO15553 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
MEFVO15553 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
MEFVO15553 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
MEFVO15553 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
MEFVO15553 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
MEFVO15553 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
MEFVO15553 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
MEFVO15553 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
MEFVO15553 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
MEFVO15553 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
MEFVO15553 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
MEFVO15553 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
MEFVO15553 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
MEFVO15553 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
MEFVO15553 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
MEFVO15553 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
MEFVO15553 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
MEFVO15553 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
MEFVO15553 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
MEFVO15553 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
MEFVO15553 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
MEFVO15553 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
MEFVO15553 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
MEFVO15553 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
MEFVO15553 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
MEFVO15553 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
MEFVO15553 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
MEFVO15553 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
MEFVO15553 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
MEFVO15553 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MEFVO15553 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
MEFVO15553 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MEFVO15553 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MEFVO15553 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
MEFVO15553 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MEFVO15553 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
MEFVO15553 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
MEFVO15553 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
MEFVO15553 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
MEFVO15553 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
MEFVO15553 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
MEFVO15553 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
MEFVO15553 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MEFVO15553 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
MEFVO15553 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MEFVO15553 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MEFVO15553 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
MEFVO15553 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
MEFVO15553 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
MEFVO15553 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
MEFVO15553 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
MEFVO15553 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
MEFVO15553 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
MEFVO15553 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
MEFVO15553 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
MEFVO15553 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
MEFVO15553 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MEFVO15553 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MEFVO15553 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MEFVO15553 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
MEFVO15553 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MEFVO15553 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
MEFVO15553 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MEFVO15553 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MEFVO15553 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MEFVO15553 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MEFVO15553 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms