Protein–RNA interactions for Protein: P35269

GTF2F1, General transcription factor IIF subunit 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2F1P35269 RBM14-204ENST00000409738 372 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.052e-12■■□□□ 13.3
GTF2F1P35269 RBM14-205ENST00000443702 732 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.112e-12■■□□□ 13.3
GTF2F1P35269 RBM14-203ENST00000409372 876 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.252e-12■■□□□ 13.3
GTF2F1P35269 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.633e-7■■□□□ 13.2
GTF2F1P35269 FUS-209ENST00000566605 1787 ntTSL 1 (best)28.65■■■□□ 2.182e-13■■□□□ 13.2
GTF2F1P35269 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.782e-13■■□□□ 13.2
GTF2F1P35269 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.432e-13■■□□□ 13.2
GTF2F1P35269 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.462e-13■■□□□ 13.2
GTF2F1P35269 FUS-207ENST00000487974 643 ntTSL 217.65■□□□□ 0.422e-13■■□□□ 13.2
GTF2F1P35269 FUS-206ENST00000487509 4920 ntTSL 215.96■□□□□ 0.152e-13■■□□□ 13.2
GTF2F1P35269 ZYX-207ENST00000457235 703 ntTSL 428.17■■■□□ 2.13e-6■■□□□ 13.2
GTF2F1P35269 PVT1-204ENST00000517525 392 ntTSL 327.16■■□□□ 1.943e-6■■□□□ 13.2
GTF2F1P35269 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.753e-6■■□□□ 13.2
GTF2F1P35269 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.683e-6■■□□□ 13.2
GTF2F1P35269 YWHAH-204ENST00000443669 822 ntTSL 325.44■■□□□ 1.663e-6■■□□□ 13.2
GTF2F1P35269 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.523e-6■■□□□ 13.2
GTF2F1P35269 ZYX-208ENST00000468083 1146 ntTSL 523.67■■□□□ 1.383e-6■■□□□ 13.2
GTF2F1P35269 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.153e-6■■□□□ 13.2
GTF2F1P35269 MFSD12-204ENST00000585788 1769 nt21.48■■□□□ 1.033e-6■■□□□ 13.2
GTF2F1P35269 STRN4-208ENST00000594581 2692 ntTSL 221.24■□□□□ 0.993e-6■■□□□ 13.2
GTF2F1P35269 ZNF655-219ENST00000467680 1979 ntTSL 221.12■□□□□ 0.973e-6■■□□□ 13.2
GTF2F1P35269 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.973e-6■■□□□ 13.2
GTF2F1P35269 ZYX-206ENST00000449630 533 ntTSL 420.51■□□□□ 0.873e-6■■□□□ 13.2
GTF2F1P35269 ZNF655-210ENST00000422647 573 ntTSL 420.44■□□□□ 0.863e-6■■□□□ 13.2
GTF2F1P35269 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.793e-6■■□□□ 13.2
GTF2F1P35269 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.783e-7■■□□□ 13.2
GTF2F1P35269 ZNF655-214ENST00000427931 567 ntTSL 419.75■□□□□ 0.753e-6■■□□□ 13.2
GTF2F1P35269 ZNF655-206ENST00000416144 1496 ntTSL 319.56■□□□□ 0.723e-6■■□□□ 13.2
GTF2F1P35269 ZNF436-AS1-204ENST00000458053 375 ntTSL 219.51■□□□□ 0.713e-6■■□□□ 13.2
GTF2F1P35269 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.713e-6■■□□□ 13.2
GTF2F1P35269 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.694e-9■■□□□ 13.2
GTF2F1P35269 STRN4-211ENST00000595357 1602 ntTSL 219.16■□□□□ 0.663e-6■■□□□ 13.2
GTF2F1P35269 ZNF655-217ENST00000452314 545 ntTSL 219.13■□□□□ 0.653e-6■■□□□ 13.2
GTF2F1P35269 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.653e-6■■□□□ 13.2
GTF2F1P35269 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.643e-6■■□□□ 13.2
GTF2F1P35269 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.633e-6■■□□□ 13.2
GTF2F1P35269 ZNF655-205ENST00000412636 655 ntTSL 218.86■□□□□ 0.613e-6■■□□□ 13.2
GTF2F1P35269 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.613e-6■■□□□ 13.2
GTF2F1P35269 ZNF655-223ENST00000493947 593 ntTSL 418.86■□□□□ 0.613e-6■■□□□ 13.2
GTF2F1P35269 ZNF655-221ENST00000489320 671 ntTSL 218.38■□□□□ 0.533e-6■■□□□ 13.2
GTF2F1P35269 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.523e-6■■□□□ 13.2
GTF2F1P35269 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.514e-9■■□□□ 13.2
GTF2F1P35269 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.453e-6■■□□□ 13.2
GTF2F1P35269 ZNF655-220ENST00000488751 924 ntTSL 317.7■□□□□ 0.423e-6■■□□□ 13.2
GTF2F1P35269 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.413e-6■■□□□ 13.2
GTF2F1P35269 ZNF655-211ENST00000423973 1441 ntTSL 1 (best)17.48■□□□□ 0.393e-6■■□□□ 13.2
GTF2F1P35269 CTCFL-219ENST00000608720 2241 ntTSL 1 (best)17.48■□□□□ 0.393e-6■■□□□ 13.2
GTF2F1P35269 ZNF655-208ENST00000422164 793 ntTSL 217.27■□□□□ 0.363e-6■■□□□ 13.2
GTF2F1P35269 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.343e-6■■□□□ 13.2
GTF2F1P35269 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.323e-6■■□□□ 13.2
GTF2F1P35269 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.323e-6■■□□□ 13.2
GTF2F1P35269 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.34e-9■■□□□ 13.2
GTF2F1P35269 WIZ-202ENST00000389282 4067 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.224e-9■■□□□ 13.2
GTF2F1P35269 WDR60-203ENST00000444851 2769 ntTSL 1 (best)16.19■□□□□ 0.183e-6■■□□□ 13.2
GTF2F1P35269 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.184e-9■■□□□ 13.2
GTF2F1P35269 CTCFL-203ENST00000422109 2964 ntTSL 1 (best)15.93■□□□□ 0.143e-6■■□□□ 13.2
GTF2F1P35269 CTCFL-208ENST00000432255 2955 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.143e-6■■□□□ 13.2
GTF2F1P35269 CTCFL-213ENST00000607923 2964 ntTSL 1 (best)15.93■□□□□ 0.143e-6■■□□□ 13.2
GTF2F1P35269 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.093e-6■■□□□ 13.2
GTF2F1P35269 CTCFL-204ENST00000422869 2966 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.063e-6■■□□□ 13.2
GTF2F1P35269 ZNF436-AS1-201ENST00000335648 2547 ntBASIC15□□□□□ -0.013e-6■■□□□ 13.2
GTF2F1P35269 CTCFL-217ENST00000608425 2915 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.063e-6■■□□□ 13.2
GTF2F1P35269 WDR60-205ENST00000467220 5410 ntTSL 214.62□□□□□ -0.073e-6■■□□□ 13.2
GTF2F1P35269 STAG3L1-204ENST00000619870 1192 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.091e-12■■□□□ 13.2
GTF2F1P35269 CTCFL-202ENST00000371196 3491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.133e-6■■□□□ 13.2
GTF2F1P35269 NFIC-207ENST00000589164 435 ntTSL 313.89□□□□□ -0.193e-6■■□□□ 13.2
GTF2F1P35269 PVT1-203ENST00000513868 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.193e-6■■□□□ 13.2
GTF2F1P35269 ZNF655-209ENST00000422422 782 ntTSL 313.77□□□□□ -0.213e-6■■□□□ 13.2
GTF2F1P35269 CTCFL-211ENST00000502686 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.213e-6■■□□□ 13.2
GTF2F1P35269 CTCFL-209ENST00000433949 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.253e-6■■□□□ 13.2
GTF2F1P35269 STRN4-219ENST00000600615 788 ntTSL 213.22□□□□□ -0.293e-6■■□□□ 13.2
GTF2F1P35269 ZNF655-204ENST00000394163 4528 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.383e-6■■□□□ 13.2
GTF2F1P35269 YWHAH-206ENST00000479649 662 ntTSL 312.64□□□□□ -0.393e-6■■□□□ 13.2
GTF2F1P35269 CTCFL-207ENST00000429804 3864 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.393e-6■■□□□ 13.2
GTF2F1P35269 CTCFL-221ENST00000608903 2135 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.413e-6■■□□□ 13.2
GTF2F1P35269 PVT1-208ENST00000519481 542 ntTSL 212.25□□□□□ -0.453e-6■■□□□ 13.2
GTF2F1P35269 ANKRD18B-201ENST00000290943 3773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.463e-6■■□□□ 13.2
GTF2F1P35269 CTCFL-212ENST00000539382 2262 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.463e-6■■□□□ 13.2
GTF2F1P35269 CTCFL-206ENST00000426658 3996 ntTSL 1 (best)12.12□□□□□ -0.473e-6■■□□□ 13.2
GTF2F1P35269 CTCFL-201ENST00000243914 3567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.473e-6■■□□□ 13.2
GTF2F1P35269 PVT1-209ENST00000520913 584 ntTSL 211.99□□□□□ -0.493e-6■■□□□ 13.2
GTF2F1P35269 CTCFL-216ENST00000608263 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.493e-6■■□□□ 13.2
GTF2F1P35269 CTCFL-214ENST00000608108 1628 ntTSL 1 (best)11.63□□□□□ -0.553e-6■■□□□ 13.2
GTF2F1P35269 CTCFL-220ENST00000608858 905 ntTSL 1 (best)11.14□□□□□ -0.633e-6■■□□□ 13.2
GTF2F1P35269 CTCFL-222ENST00000609232 3668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.633e-6■■□□□ 13.2
GTF2F1P35269 STAG3L1-201ENST00000404291 496 ntTSL 3 BASIC9.25□□□□□ -0.931e-12■■□□□ 13.2
GTF2F1P35269 ZNF655-222ENST00000493277 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.973e-6■■□□□ 13.2
GTF2F1P35269 ZNF655-213ENST00000425063 4624 ntTSL 3 BASIC8.46□□□□□ -1.063e-6■■□□□ 13.2
GTF2F1P35269 PVT1-206ENST00000517838 518 ntTSL 28.41□□□□□ -1.063e-6■■□□□ 13.2
GTF2F1P35269 PTP4A1-202ENST00000470661 479 ntTSL 28.2□□□□□ -1.12e-7■■□□□ 13.2
GTF2F1P35269 KATNAL1-201ENST00000380615 7551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.533e-6■■□□□ 13.2
GTF2F1P35269 ZNF436-AS1-205ENST00000518600 376 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.643e-6■■□□□ 13.2
GTF2F1P35269 PTP4A1-204ENST00000578299 135 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.853e-7■■□□□ 13.2
GTF2F1P35269 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.573e-7■■□□□ 13.2
GTF2F1P35269 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.573e-7■■□□□ 13.2
GTF2F1P35269 FERMT3-205ENST00000541252 714 ntTSL 318.36■□□□□ 0.533e-7■■□□□ 13.2
GTF2F1P35269 FERMT3-207ENST00000544997 1006 ntTSL 318.27■□□□□ 0.523e-7■■□□□ 13.2
GTF2F1P35269 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.96■■□□□ 1.911e-7■■□□□ 13.2
GTF2F1P35269 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.431e-7■■□□□ 13.2
GTF2F1P35269 RTKN-205ENST00000464094 1266 ntTSL 1 (best)24.72■■□□□ 1.554e-6■■□□□ 13.2
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