RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000502686.6

CTCFL-211, Transcript of CCCTC-binding factor like, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTCFL, Length 2,023 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTCFL-211ENST00000502686 NISCHQ9Y2I1 1504 aa30.46■■■□□ 2.47
CTCFL-211ENST00000502686 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa26.71■■□□□ 1.87
CTCFL-211ENST00000502686 ABCC9O60706 1549 aa25.57■■□□□ 1.68
CTCFL-211ENST00000502686 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP25.53■■□□□ 1.68
CTCFL-211ENST00000502686 DCAF8L2P0C7V8 631 aa25.27■■□□□ 1.64
CTCFL-211ENST00000502686 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa25.18■■□□□ 1.62
CTCFL-211ENST00000502686 MYO15BQ96JP2 1530 aa25■■□□□ 1.59
CTCFL-211ENST00000502686 NACADO15069 1562 aa24.96■■□□□ 1.59
CTCFL-211ENST00000502686 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa24.82■■□□□ 1.56
CTCFL-211ENST00000502686 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa24.63■■□□□ 1.53
CTCFL-211ENST00000502686 SCRIBQ14160 1630 aa24.53■■□□□ 1.52
CTCFL-211ENST00000502686 UNC13AQ9UPW8 1703 aa24.3■■□□□ 1.48
CTCFL-211ENST00000502686 BICRAQ9NZM4 1560 aa24.08■■□□□ 1.45
CTCFL-211ENST00000502686 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP24.05■■□□□ 1.44
CTCFL-211ENST00000502686 CECR2Q9BXF3 1484 aa23.71■■□□□ 1.39
CTCFL-211ENST00000502686 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP23.54■■□□□ 1.36
CTCFL-211ENST00000502686 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP23.53■■□□□ 1.36
CTCFL-211ENST00000502686 MROH2BQ7Z745 1585 aa23.53■■□□□ 1.36
CTCFL-211ENST00000502686 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
CTCFL-211ENST00000502686 SMARCA4P51532 1647 aa23.49■■□□□ 1.35
CTCFL-211ENST00000502686 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.33
CTCFL-211ENST00000502686 WIZO95785 1651 aa23.32■■□□□ 1.32
CTCFL-211ENST00000502686 PEG3Q9GZU2 1588 aa23.21■■□□□ 1.31
CTCFL-211ENST00000502686 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa23.19■■□□□ 1.3
CTCFL-211ENST00000502686 SMARCA2P51531 1590 aa23.16■■□□□ 1.3
CTCFL-211ENST00000502686 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa23.13■■□□□ 1.29
CTCFL-211ENST00000502686 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP23.07■■□□□ 1.28
CTCFL-211ENST00000502686 NCAPD3P42695 1498 aa23.04■■□□□ 1.28
CTCFL-211ENST00000502686 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP23.04■■□□□ 1.28
CTCFL-211ENST00000502686 HMGXB3Q12766 1538 aa22.98■■□□□ 1.27
CTCFL-211ENST00000502686 DNAJC5BQ9UF47 199 aa22.86■■□□□ 1.25
CTCFL-211ENST00000502686 CCDC88BA6NC98 1476 aa22.83■■□□□ 1.24
CTCFL-211ENST00000502686 CFTRP13569 1480 aa22.43■■□□□ 1.18
CTCFL-211ENST00000502686 CADPSQ9ULU8 1353 aa22.43■■□□□ 1.18
CTCFL-211ENST00000502686 NESP48681 1621 aa22.35■■□□□ 1.17
CTCFL-211ENST00000502686 CHIC1Q5VXU3 224 aa22.34■■□□□ 1.17
CTCFL-211ENST00000502686 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa22.3■■□□□ 1.16
CTCFL-211ENST00000502686 PRDM2Q13029 1718 aa22.29■■□□□ 1.16
CTCFL-211ENST00000502686 ABCC8Q09428 1581 aa22.24■■□□□ 1.15
CTCFL-211ENST00000502686 FANCD2Q9BXW9 1451 aa22.18■■□□□ 1.14
CTCFL-211ENST00000502686 PDS5BQ9NTI5 1447 aa22.15■■□□□ 1.14
CTCFL-211ENST00000502686 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP22.14■■□□□ 1.13
CTCFL-211ENST00000502686 TRIM41Q8WV44 630 aa22.14■■□□□ 1.13
CTCFL-211ENST00000502686 CEP164Q9UPV0 1460 aa22.08■■□□□ 1.12
CTCFL-211ENST00000502686 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa22.07■■□□□ 1.12
CTCFL-211ENST00000502686 SYNJ1O43426 1573 aa22.06■■□□□ 1.12
CTCFL-211ENST00000502686 CUX1P39880 1505 aa22.02■■□□□ 1.12
CTCFL-211ENST00000502686 TOP2BQ02880 1626 aa21.99■■□□□ 1.11
CTCFL-211ENST00000502686 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa21.97■■□□□ 1.11
CTCFL-211ENST00000502686 ERCC6Q03468 1493 aa21.96■■□□□ 1.11
CTCFL-211ENST00000502686 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
CTCFL-211ENST00000502686 DNMBPQ6XZF7 1577 aa21.92■■□□□ 1.1
CTCFL-211ENST00000502686 TOPBP1Q92547 1522 aa21.91■■□□□ 1.1
CTCFL-211ENST00000502686 MRC2Q9UBG0 1479 aa21.9■■□□□ 1.1
CTCFL-211ENST00000502686 FGD5Q6ZNL6 1462 aa21.84■■□□□ 1.09
CTCFL-211ENST00000502686 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
CTCFL-211ENST00000502686 WDR62O43379 1518 aa21.79■■□□□ 1.08
CTCFL-211ENST00000502686 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
CTCFL-211ENST00000502686 SOGA1O94964 1423 aa21.76■■□□□ 1.07
CTCFL-211ENST00000502686 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP21.74■■□□□ 1.07
CTCFL-211ENST00000502686 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa21.71■■□□□ 1.07
CTCFL-211ENST00000502686 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa21.7■■□□□ 1.06
CTCFL-211ENST00000502686 CUX2O14529 1486 aa21.65■■□□□ 1.06
CTCFL-211ENST00000502686 EEA1Q15075 1411 aa21.63■■□□□ 1.05
CTCFL-211ENST00000502686 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa21.63■■□□□ 1.05
CTCFL-211ENST00000502686 KIF27Q86VH2 1401 aa21.6■■□□□ 1.05
CTCFL-211ENST00000502686 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
CTCFL-211ENST00000502686 WDR97A6NE52 1622 aa21.58■■□□□ 1.05
CTCFL-211ENST00000502686 IFT140Q96RY7 1462 aa21.57■■□□□ 1.04
CTCFL-211ENST00000502686 CSRNP3Q8WYN3 585 aa21.56■■□□□ 1.04
CTCFL-211ENST00000502686 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
CTCFL-211ENST00000502686 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa21.48■■□□□ 1.03
CTCFL-211ENST00000502686 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa21.48■■□□□ 1.03
CTCFL-211ENST00000502686 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
CTCFL-211ENST00000502686 GAPVD1Q14C86 1478 aa21.45■■□□□ 1.03
CTCFL-211ENST00000502686 IGF1RP08069 1367 aa21.45■■□□□ 1.02
CTCFL-211ENST00000502686 EHMT2Q96KQ7 1210 aa21.45■■□□□ 1.02
CTCFL-211ENST00000502686 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP21.44■■□□□ 1.023e-6■■■□□ 17.6
CTCFL-211ENST00000502686 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
CTCFL-211ENST00000502686 PRXQ9BXM0 1461 aa21.38■■□□□ 1.01
CTCFL-211ENST00000502686 KIF21BO75037 1637 aa21.38■■□□□ 1.01
CTCFL-211ENST00000502686 ERICH3Q5RHP9 1530 aa21.37■■□□□ 1.01
CTCFL-211ENST00000502686 PBRM1Q86U86 1689 aa21.35■■□□□ 1.01
CTCFL-211ENST00000502686 GRIN2BQ13224 1484 aa21.34■■□□□ 1.01
CTCFL-211ENST00000502686 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa21.33■■□□□ 1.01
CTCFL-211ENST00000502686 GOLGA3Q08378 1498 aa21.33■■□□□ 1.01
CTCFL-211ENST00000502686 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa21.33■■□□□ 1.01
CTCFL-211ENST00000502686 CUL7Q14999 1698 aa21.31■■□□□ 1
CTCFL-211ENST00000502686 UBTFP17480 764 aaKnown RBP21.26■□□□□ 0.99
CTCFL-211ENST00000502686 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa21.25■□□□□ 0.99
CTCFL-211ENST00000502686 ADAMTS12P58397 1594 aa21.23■□□□□ 0.99
CTCFL-211ENST00000502686 FHAD1B1AJZ9 1412 aa21.22■□□□□ 0.99
CTCFL-211ENST00000502686 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP21.19■□□□□ 0.98
CTCFL-211ENST00000502686 TNIKQ9UKE5 1360 aa21.19■□□□□ 0.98
CTCFL-211ENST00000502686 SYNJ2O15056 1496 aa21.12■□□□□ 0.97
CTCFL-211ENST00000502686 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP21.09■□□□□ 0.97
CTCFL-211ENST00000502686 GRIN2AQ12879 1464 aa21.08■□□□□ 0.96
CTCFL-211ENST00000502686 FBLN2P98095 1184 aa21.07■□□□□ 0.96
CTCFL-211ENST00000502686 CEP162Q5TB80 1403 aa21.06■□□□□ 0.96
CTCFL-211ENST00000502686 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP21.02■□□□□ 0.96
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