RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481655.2

CTCFL-210, Transcript of CCCTC-binding factor like, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CTCFL, Length 1,512 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTCFL-210ENST00000481655 NISCHQ9Y2I1 1504 aa34.86■■■■□ 3.17
CTCFL-210ENST00000481655 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa30.67■■■□□ 2.5
CTCFL-210ENST00000481655 ABCC9O60706 1549 aa29.46■■■□□ 2.31
CTCFL-210ENST00000481655 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP29.17■■■□□ 2.26
CTCFL-210ENST00000481655 DCAF8L2P0C7V8 631 aa28.96■■■□□ 2.23
CTCFL-210ENST00000481655 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa28.89■■■□□ 2.22
CTCFL-210ENST00000481655 MYO15BQ96JP2 1530 aa28.79■■■□□ 2.2
CTCFL-210ENST00000481655 NACADO15069 1562 aa28.74■■■□□ 2.19
CTCFL-210ENST00000481655 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa28.62■■■□□ 2.17
CTCFL-210ENST00000481655 SCRIBQ14160 1630 aa28.06■■■□□ 2.08
CTCFL-210ENST00000481655 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa27.95■■■□□ 2.06
CTCFL-210ENST00000481655 UNC13AQ9UPW8 1703 aa27.8■■■□□ 2.04
CTCFL-210ENST00000481655 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP27.65■■■□□ 2.02
CTCFL-210ENST00000481655 BICRAQ9NZM4 1560 aa27.64■■■□□ 2.02
CTCFL-210ENST00000481655 CECR2Q9BXF3 1484 aa27.05■■□□□ 1.92
CTCFL-210ENST00000481655 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP27■■□□□ 1.91
CTCFL-210ENST00000481655 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP26.92■■□□□ 1.9
CTCFL-210ENST00000481655 SMARCA4P51532 1647 aa26.89■■□□□ 1.9
CTCFL-210ENST00000481655 MROH2BQ7Z745 1585 aa26.84■■□□□ 1.89
CTCFL-210ENST00000481655 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP26.8■■□□□ 1.88
CTCFL-210ENST00000481655 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP26.66■■□□□ 1.86
CTCFL-210ENST00000481655 SMARCA2P51531 1590 aa26.65■■□□□ 1.86
CTCFL-210ENST00000481655 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa26.63■■□□□ 1.85
CTCFL-210ENST00000481655 PEG3Q9GZU2 1588 aa26.63■■□□□ 1.85
CTCFL-210ENST00000481655 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa26.62■■□□□ 1.85
CTCFL-210ENST00000481655 DNAJC5BQ9UF47 199 aa26.57■■□□□ 1.84
CTCFL-210ENST00000481655 WIZO95785 1651 aa26.55■■□□□ 1.84
CTCFL-210ENST00000481655 NCAPD3P42695 1498 aa26.52■■□□□ 1.84
CTCFL-210ENST00000481655 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP26.47■■□□□ 1.83
CTCFL-210ENST00000481655 HMGXB3Q12766 1538 aa26.44■■□□□ 1.82
CTCFL-210ENST00000481655 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP26.38■■□□□ 1.81
CTCFL-210ENST00000481655 CCDC88BA6NC98 1476 aa26.07■■□□□ 1.76
CTCFL-210ENST00000481655 CADPSQ9ULU8 1353 aa25.81■■□□□ 1.72
CTCFL-210ENST00000481655 CFTRP13569 1480 aa25.76■■□□□ 1.71
CTCFL-210ENST00000481655 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa25.71■■□□□ 1.71
CTCFL-210ENST00000481655 NESP48681 1621 aa25.63■■□□□ 1.69
CTCFL-210ENST00000481655 PDS5BQ9NTI5 1447 aa25.58■■□□□ 1.69
CTCFL-210ENST00000481655 PRDM2Q13029 1718 aa25.5■■□□□ 1.67
CTCFL-210ENST00000481655 FANCD2Q9BXW9 1451 aa25.5■■□□□ 1.67
CTCFL-210ENST00000481655 CEP164Q9UPV0 1460 aa25.42■■□□□ 1.66
CTCFL-210ENST00000481655 ERCC6Q03468 1493 aa25.4■■□□□ 1.66
CTCFL-210ENST00000481655 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa25.3■■□□□ 1.64
CTCFL-210ENST00000481655 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP25.3■■□□□ 1.64
CTCFL-210ENST00000481655 ABCC8Q09428 1581 aa25.27■■□□□ 1.64
CTCFL-210ENST00000481655 MRC2Q9UBG0 1479 aa25.24■■□□□ 1.63
CTCFL-210ENST00000481655 CHIC1Q5VXU3 224 aa25.22■■□□□ 1.63
CTCFL-210ENST00000481655 TRIM41Q8WV44 630 aa25.2■■□□□ 1.62
CTCFL-210ENST00000481655 CUX1P39880 1505 aa25.16■■□□□ 1.62
CTCFL-210ENST00000481655 DNMBPQ6XZF7 1577 aa25.16■■□□□ 1.62
CTCFL-210ENST00000481655 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
CTCFL-210ENST00000481655 TOPBP1Q92547 1522 aa25.13■■□□□ 1.61
CTCFL-210ENST00000481655 TOP2BQ02880 1626 aa25.12■■□□□ 1.61
CTCFL-210ENST00000481655 SYNJ1O43426 1573 aa25.12■■□□□ 1.61
CTCFL-210ENST00000481655 WDR62O43379 1518 aa25.1■■□□□ 1.61
CTCFL-210ENST00000481655 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
CTCFL-210ENST00000481655 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa25.07■■□□□ 1.6
CTCFL-210ENST00000481655 FGD5Q6ZNL6 1462 aa25■■□□□ 1.59
CTCFL-210ENST00000481655 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP24.97■■□□□ 1.59
CTCFL-210ENST00000481655 SOGA1O94964 1423 aa24.92■■□□□ 1.58
CTCFL-210ENST00000481655 CUX2O14529 1486 aa24.87■■□□□ 1.57
CTCFL-210ENST00000481655 IFT140Q96RY7 1462 aa24.86■■□□□ 1.57
CTCFL-210ENST00000481655 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa24.84■■□□□ 1.57
CTCFL-210ENST00000481655 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa24.8■■□□□ 1.56
CTCFL-210ENST00000481655 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP24.76■■□□□ 1.55
CTCFL-210ENST00000481655 KIF27Q86VH2 1401 aa24.75■■□□□ 1.55
CTCFL-210ENST00000481655 EEA1Q15075 1411 aa24.72■■□□□ 1.55
CTCFL-210ENST00000481655 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP24.68■■□□□ 1.54
CTCFL-210ENST00000481655 WDR97A6NE52 1622 aa24.67■■□□□ 1.54
CTCFL-210ENST00000481655 GAPVD1Q14C86 1478 aa24.63■■□□□ 1.53
CTCFL-210ENST00000481655 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP24.63■■□□□ 1.53
CTCFL-210ENST00000481655 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP24.61■■□□□ 1.53
CTCFL-210ENST00000481655 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP24.6■■□□□ 1.531e-7■■■■□ 21.1
CTCFL-210ENST00000481655 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa24.59■■□□□ 1.53
CTCFL-210ENST00000481655 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa24.59■■□□□ 1.53
CTCFL-210ENST00000481655 CSRNP3Q8WYN3 585 aa24.57■■□□□ 1.52
CTCFL-210ENST00000481655 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP24.56■■□□□ 1.52
CTCFL-210ENST00000481655 GRIN2BQ13224 1484 aa24.55■■□□□ 1.52
CTCFL-210ENST00000481655 IGF1RP08069 1367 aa24.52■■□□□ 1.52
CTCFL-210ENST00000481655 ERICH3Q5RHP9 1530 aa24.52■■□□□ 1.52
CTCFL-210ENST00000481655 PBRM1Q86U86 1689 aa24.44■■□□□ 1.5
CTCFL-210ENST00000481655 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa24.42■■□□□ 1.5
CTCFL-210ENST00000481655 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP24.42■■□□□ 1.5
CTCFL-210ENST00000481655 CUL7Q14999 1698 aa24.41■■□□□ 1.5
CTCFL-210ENST00000481655 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa24.4■■□□□ 1.5
CTCFL-210ENST00000481655 FHAD1B1AJZ9 1412 aa24.38■■□□□ 1.49
CTCFL-210ENST00000481655 PRXQ9BXM0 1461 aa24.38■■□□□ 1.49
CTCFL-210ENST00000481655 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa24.34■■□□□ 1.49
CTCFL-210ENST00000481655 ADAMTS12P58397 1594 aa24.33■■□□□ 1.49
CTCFL-210ENST00000481655 KIF21BO75037 1637 aa24.32■■□□□ 1.48
CTCFL-210ENST00000481655 SYNJ2O15056 1496 aa24.3■■□□□ 1.48
CTCFL-210ENST00000481655 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP24.3■■□□□ 1.48
CTCFL-210ENST00000481655 GOLGA3Q08378 1498 aa24.29■■□□□ 1.48
CTCFL-210ENST00000481655 FBLN2P98095 1184 aa24.26■■□□□ 1.47
CTCFL-210ENST00000481655 EHMT2Q96KQ7 1210 aa24.23■■□□□ 1.47
CTCFL-210ENST00000481655 GRIN2AQ12879 1464 aa24.22■■□□□ 1.47
CTCFL-210ENST00000481655 UBTFP17480 764 aaKnown RBP24.21■■□□□ 1.47
CTCFL-210ENST00000481655 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa24.2■■□□□ 1.46
CTCFL-210ENST00000481655 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa24.17■■□□□ 1.46
CTCFL-210ENST00000481655 TNIKQ9UKE5 1360 aa24.1■■□□□ 1.45
CTCFL-210ENST00000481655 NUP160Q12769 1436 aa24.07■■□□□ 1.44
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