RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000464094.2

RTKN-205, Transcript of rhotekin, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene RTKN, Length 1,266 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTKN-205ENST00000464094 NISCHQ9Y2I1 1504 aa54.97■■■■■ 6.39
RTKN-205ENST00000464094 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa49.16■■■■■ 5.46
RTKN-205ENST00000464094 ABCC9O60706 1549 aa48.44■■■■■ 5.35
RTKN-205ENST00000464094 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa46.43■■■■■ 5.02
RTKN-205ENST00000464094 NACADO15069 1562 aa46.26■■■■■ 5
RTKN-205ENST00000464094 DCAF8L2P0C7V8 631 aa45.99■■■■■ 4.95
RTKN-205ENST00000464094 MYO15BQ96JP2 1530 aa45.82■■■■■ 4.93
RTKN-205ENST00000464094 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP45.72■■■■■ 4.91
RTKN-205ENST00000464094 UNC13AQ9UPW8 1703 aa45.51■■■■■ 4.88
RTKN-205ENST00000464094 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa45.47■■■■■ 4.87
RTKN-205ENST00000464094 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP45.14■■■■■ 4.82
RTKN-205ENST00000464094 BICRAQ9NZM4 1560 aa45.08■■■■■ 4.81
RTKN-205ENST00000464094 DNAJC5BQ9UF47 199 aa44.85■■■■■ 4.77
RTKN-205ENST00000464094 SCRIBQ14160 1630 aa44.78■■■■■ 4.76
RTKN-205ENST00000464094 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa44.51■■■■■ 4.72
RTKN-205ENST00000464094 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP43.9■■■■■ 4.62
RTKN-205ENST00000464094 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa43.85■■■■■ 4.61
RTKN-205ENST00000464094 CECR2Q9BXF3 1484 aa43.57■■■■■ 4.56
RTKN-205ENST00000464094 SMARCA4P51532 1647 aa42.79■■■■■ 4.44
RTKN-205ENST00000464094 NCAPD3P42695 1498 aa42.66■■■■■ 4.42
RTKN-205ENST00000464094 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP42.65■■■■■ 4.42
RTKN-205ENST00000464094 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa42.62■■■■■ 4.41
RTKN-205ENST00000464094 SMARCA2P51531 1590 aa42.56■■■■■ 4.4
RTKN-205ENST00000464094 HMGXB3Q12766 1538 aa42.45■■■■■ 4.39
RTKN-205ENST00000464094 PEG3Q9GZU2 1588 aa42.38■■■■■ 4.37
RTKN-205ENST00000464094 MROH2BQ7Z745 1585 aa42.37■■■■■ 4.37
RTKN-205ENST00000464094 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP42.24■■■■■ 4.35
RTKN-205ENST00000464094 WIZO95785 1651 aa41.93■■■■■ 4.3
RTKN-205ENST00000464094 NESP48681 1621 aa41.81■■■■■ 4.28
RTKN-205ENST00000464094 ERCC6Q03468 1493 aa41.76■■■■■ 4.28
RTKN-205ENST00000464094 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP41.69■■■■■ 4.26
RTKN-205ENST00000464094 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa41.64■■■■■ 4.26
RTKN-205ENST00000464094 CUX2O14529 1486 aa41.51■■■■■ 4.24
RTKN-205ENST00000464094 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP41.43■■■■■ 4.22
RTKN-205ENST00000464094 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa41.39■■■■■ 4.22
RTKN-205ENST00000464094 CADPSQ9ULU8 1353 aa41.37■■■■■ 4.21
RTKN-205ENST00000464094 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP41.33■■■■■ 4.21
RTKN-205ENST00000464094 PDS5BQ9NTI5 1447 aa41.31■■■■■ 4.2
RTKN-205ENST00000464094 CFTRP13569 1480 aa41.06■■■■■ 4.16
RTKN-205ENST00000464094 MRC2Q9UBG0 1479 aa40.96■■■■■ 4.15
RTKN-205ENST00000464094 FANCD2Q9BXW9 1451 aa40.92■■■■■ 4.14
RTKN-205ENST00000464094 CEP164Q9UPV0 1460 aa40.92■■■■■ 4.14
RTKN-205ENST00000464094 CCDC88BA6NC98 1476 aa40.91■■■■■ 4.14
RTKN-205ENST00000464094 WDR62O43379 1518 aa40.88■■■■■ 4.13
RTKN-205ENST00000464094 PRDM2Q13029 1718 aa40.86■■■■■ 4.13
RTKN-205ENST00000464094 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa40.72■■■■■ 4.11
RTKN-205ENST00000464094 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP40.57■■■■■ 4.09
RTKN-205ENST00000464094 TOPBP1Q92547 1522 aa40.24■■■■■ 4.03
RTKN-205ENST00000464094 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP40.21■■■■■ 4.03
RTKN-205ENST00000464094 ABCC8Q09428 1581 aa40.17■■■■■ 4.02
RTKN-205ENST00000464094 DNMBPQ6XZF7 1577 aa40.17■■■■■ 4.02
RTKN-205ENST00000464094 IFT140Q96RY7 1462 aa40.07■■■■■ 4
RTKN-205ENST00000464094 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP39.96■■■■□ 3.99
RTKN-205ENST00000464094 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP39.88■■■■□ 3.97
RTKN-205ENST00000464094 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP39.86■■■■□ 3.97
RTKN-205ENST00000464094 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP39.83■■■■□ 3.97
RTKN-205ENST00000464094 CUX1P39880 1505 aa39.79■■■■□ 3.96
RTKN-205ENST00000464094 FGD5Q6ZNL6 1462 aa39.7■■■■□ 3.95
RTKN-205ENST00000464094 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa39.68■■■■□ 3.94
RTKN-205ENST00000464094 SOGA1O94964 1423 aa39.65■■■■□ 3.94
RTKN-205ENST00000464094 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP39.64■■■■□ 3.949e-8■■■■□ 20
RTKN-205ENST00000464094 OSCARQ8IYS5 282 aa39.64■■■■□ 3.94
RTKN-205ENST00000464094 WDR97A6NE52 1622 aa39.52■■■■□ 3.92
RTKN-205ENST00000464094 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP39.47■■■■□ 3.91
RTKN-205ENST00000464094 CHD1O14646 1710 aa39.45■■■■□ 3.91
RTKN-205ENST00000464094 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa39.36■■■■□ 3.89
RTKN-205ENST00000464094 TOP2BQ02880 1626 aa39.33■■■■□ 3.89
RTKN-205ENST00000464094 SYNJ1O43426 1573 aa39.31■■■■□ 3.88
RTKN-205ENST00000464094 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP39.31■■■■□ 3.88
RTKN-205ENST00000464094 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa39.29■■■■□ 3.88
RTKN-205ENST00000464094 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa39.29■■■■□ 3.88
RTKN-205ENST00000464094 PBRM1Q86U86 1689 aa39.26■■■■□ 3.88
RTKN-205ENST00000464094 GRIN2BQ13224 1484 aa39.25■■■■□ 3.87
RTKN-205ENST00000464094 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa39.24■■■■□ 3.87
RTKN-205ENST00000464094 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP39.22■■■■□ 3.87
RTKN-205ENST00000464094 GAPVD1Q14C86 1478 aa39.2■■■■□ 3.87
RTKN-205ENST00000464094 FBLN2P98095 1184 aa39.19■■■■□ 3.86
RTKN-205ENST00000464094 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa39.18■■■■□ 3.86
RTKN-205ENST00000464094 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa39.18■■■■□ 3.86
RTKN-205ENST00000464094 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa39.18■■■■□ 3.86
RTKN-205ENST00000464094 TRIM41Q8WV44 630 aa39.16■■■■□ 3.86
RTKN-205ENST00000464094 ARHGEF11O15085 1522 aa39.09■■■■□ 3.85
RTKN-205ENST00000464094 SYNJ2O15056 1496 aa39.07■■■■□ 3.85
RTKN-205ENST00000464094 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP39.01■■■■□ 3.84
RTKN-205ENST00000464094 CLASP1Q7Z460 1538 aa38.97■■■■□ 3.83
RTKN-205ENST00000464094 ADAMTS12P58397 1594 aa38.88■■■■□ 3.81
RTKN-205ENST00000464094 ERICH3Q5RHP9 1530 aa38.82■■■■□ 3.8
RTKN-205ENST00000464094 GRIN2AQ12879 1464 aa38.77■■■■□ 3.8
RTKN-205ENST00000464094 ARAP1Q96P48 1450 aa38.74■■■■□ 3.79
RTKN-205ENST00000464094 FHAD1B1AJZ9 1412 aa38.72■■■■□ 3.79
RTKN-205ENST00000464094 CYB5RLQ6IPT4 315 aa38.66■■■■□ 3.78
RTKN-205ENST00000464094 CEP170Q5SW79 1584 aa38.65■■■■□ 3.78
RTKN-205ENST00000464094 NUP160Q12769 1436 aa38.62■■■■□ 3.77
RTKN-205ENST00000464094 KIF27Q86VH2 1401 aa38.5■■■■□ 3.75
RTKN-205ENST00000464094 SHROOM2Q13796 1616 aa38.45■■■■□ 3.75
RTKN-205ENST00000464094 CUL7Q14999 1698 aa38.42■■■■□ 3.74
RTKN-205ENST00000464094 IGF1RP08069 1367 aa38.4■■■■□ 3.74
RTKN-205ENST00000464094 ERCC6L2Q5T890 1561 aa38.4■■■■□ 3.74
RTKN-205ENST00000464094 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa38.33■■■■□ 3.73
RTKN-205ENST00000464094 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP38.16■■■■□ 3.7
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.8 ms