RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468083.1

ZYX-208, Transcript of zyxin, humanhuman

TSL 5

Gene ZYX, Length 1,146 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZYX-208ENST00000468083 NISCHQ9Y2I1 1504 aa52.72■■■■■ 6.03
ZYX-208ENST00000468083 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa46.74■■■■■ 5.07
ZYX-208ENST00000468083 ABCC9O60706 1549 aa45.68■■■■■ 4.9
ZYX-208ENST00000468083 DCAF8L2P0C7V8 631 aa44.06■■■■■ 4.64
ZYX-208ENST00000468083 NACADO15069 1562 aa44.04■■■■■ 4.64
ZYX-208ENST00000468083 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa44.02■■■■■ 4.64
ZYX-208ENST00000468083 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP43.9■■■■■ 4.62
ZYX-208ENST00000468083 MYO15BQ96JP2 1530 aa43.89■■■■■ 4.62
ZYX-208ENST00000468083 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa43.69■■■■■ 4.59
ZYX-208ENST00000468083 UNC13AQ9UPW8 1703 aa42.82■■■■■ 4.44
ZYX-208ENST00000468083 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP42.77■■■■■ 4.44
ZYX-208ENST00000468083 BICRAQ9NZM4 1560 aa42.63■■■■■ 4.41
ZYX-208ENST00000468083 SCRIBQ14160 1630 aa42.59■■■■■ 4.41
ZYX-208ENST00000468083 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa42.34■■■■■ 4.37
ZYX-208ENST00000468083 DNAJC5BQ9UF47 199 aa41.95■■■■■ 4.31
ZYX-208ENST00000468083 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP41.52■■■■■ 4.24
ZYX-208ENST00000468083 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa41.31■■■■■ 4.2
ZYX-208ENST00000468083 CECR2Q9BXF3 1484 aa41.09■■■■■ 4.17
ZYX-208ENST00000468083 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP40.85■■■■■ 4.13
ZYX-208ENST00000468083 SMARCA4P51532 1647 aa40.81■■■■■ 4.12
ZYX-208ENST00000468083 NCAPD3P42695 1498 aa40.7■■■■■ 4.11
ZYX-208ENST00000468083 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa40.67■■■■■ 4.1
ZYX-208ENST00000468083 SMARCA2P51531 1590 aa40.61■■■■■ 4.09
ZYX-208ENST00000468083 MROH2BQ7Z745 1585 aa40.58■■■■■ 4.09
ZYX-208ENST00000468083 PEG3Q9GZU2 1588 aa40.5■■■■■ 4.07
ZYX-208ENST00000468083 HMGXB3Q12766 1538 aa40.41■■■■■ 4.06
ZYX-208ENST00000468083 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP40.3■■■■■ 4.04
ZYX-208ENST00000468083 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP40.23■■■■■ 4.03
ZYX-208ENST00000468083 WIZO95785 1651 aa40.08■■■■■ 4.01
ZYX-208ENST00000468083 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP39.73■■■■□ 3.95
ZYX-208ENST00000468083 NESP48681 1621 aa39.54■■■■□ 3.92
ZYX-208ENST00000468083 CADPSQ9ULU8 1353 aa39.52■■■■□ 3.92
ZYX-208ENST00000468083 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa39.51■■■■□ 3.92
ZYX-208ENST00000468083 ERCC6Q03468 1493 aa39.39■■■■□ 3.9
ZYX-208ENST00000468083 PDS5BQ9NTI5 1447 aa39.33■■■■□ 3.89
ZYX-208ENST00000468083 CCDC88BA6NC98 1476 aa39.31■■■■□ 3.88
ZYX-208ENST00000468083 CFTRP13569 1480 aa39.26■■■■□ 3.88
ZYX-208ENST00000468083 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP39.25■■■■□ 3.87
ZYX-208ENST00000468083 CUX2O14529 1486 aa39.01■■■■□ 3.84
ZYX-208ENST00000468083 FANCD2Q9BXW9 1451 aa38.98■■■■□ 3.83
ZYX-208ENST00000468083 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa38.97■■■■□ 3.83
ZYX-208ENST00000468083 CEP164Q9UPV0 1460 aa38.91■■■■□ 3.82
ZYX-208ENST00000468083 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP38.88■■■■□ 3.81
ZYX-208ENST00000468083 MRC2Q9UBG0 1479 aa38.84■■■■□ 3.81
ZYX-208ENST00000468083 PRDM2Q13029 1718 aa38.74■■■■□ 3.79
ZYX-208ENST00000468083 WDR62O43379 1518 aa38.68■■■■□ 3.78
ZYX-208ENST00000468083 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP38.54■■■■□ 3.76
ZYX-208ENST00000468083 ABCC8Q09428 1581 aa38.47■■■■□ 3.75
ZYX-208ENST00000468083 TOPBP1Q92547 1522 aa38.35■■■■□ 3.73
ZYX-208ENST00000468083 DNMBPQ6XZF7 1577 aa38.29■■■■□ 3.72
ZYX-208ENST00000468083 IFT140Q96RY7 1462 aa38.15■■■■□ 3.7
ZYX-208ENST00000468083 CUX1P39880 1505 aa38.05■■■■□ 3.68
ZYX-208ENST00000468083 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP38.03■■■■□ 3.68
ZYX-208ENST00000468083 SOGA1O94964 1423 aa37.95■■■■□ 3.67
ZYX-208ENST00000468083 FGD5Q6ZNL6 1462 aa37.93■■■■□ 3.66
ZYX-208ENST00000468083 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP37.92■■■■□ 3.66
ZYX-208ENST00000468083 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP37.88■■■■□ 3.65
ZYX-208ENST00000468083 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP37.87■■■■□ 3.65
ZYX-208ENST00000468083 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa37.85■■■■□ 3.65
ZYX-208ENST00000468083 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa37.81■■■■□ 3.64
ZYX-208ENST00000468083 TOP2BQ02880 1626 aa37.76■■■■□ 3.64
ZYX-208ENST00000468083 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP37.72■■■■□ 3.638e-9■■■■■ 30.4
ZYX-208ENST00000468083 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa37.72■■■■□ 3.63
ZYX-208ENST00000468083 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP37.69■■■■□ 3.62
ZYX-208ENST00000468083 SYNJ1O43426 1573 aa37.69■■■■□ 3.62
ZYX-208ENST00000468083 WDR97A6NE52 1622 aa37.66■■■■□ 3.62
ZYX-208ENST00000468083 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP37.66■■■■□ 3.62
ZYX-208ENST00000468083 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa37.63■■■■□ 3.61
ZYX-208ENST00000468083 OSCARQ8IYS5 282 aa37.52■■■■□ 3.6
ZYX-208ENST00000468083 GRIN2BQ13224 1484 aa37.47■■■■□ 3.59
ZYX-208ENST00000468083 GAPVD1Q14C86 1478 aa37.47■■■■□ 3.59
ZYX-208ENST00000468083 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa37.36■■■■□ 3.57
ZYX-208ENST00000468083 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP37.36■■■■□ 3.57
ZYX-208ENST00000468083 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa37.33■■■■□ 3.57
ZYX-208ENST00000468083 FBLN2P98095 1184 aa37.28■■■■□ 3.56
ZYX-208ENST00000468083 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP37.26■■■■□ 3.56
ZYX-208ENST00000468083 SYNJ2O15056 1496 aa37.2■■■■□ 3.55
ZYX-208ENST00000468083 PBRM1Q86U86 1689 aa37.2■■■■□ 3.55
ZYX-208ENST00000468083 ERICH3Q5RHP9 1530 aa37.17■■■■□ 3.54
ZYX-208ENST00000468083 KIF27Q86VH2 1401 aa37.16■■■■□ 3.54
ZYX-208ENST00000468083 TRIM41Q8WV44 630 aa37.15■■■■□ 3.54
ZYX-208ENST00000468083 CHD1O14646 1710 aa37.11■■■■□ 3.53
ZYX-208ENST00000468083 FHAD1B1AJZ9 1412 aa37.08■■■■□ 3.53
ZYX-208ENST00000468083 IGF1RP08069 1367 aa37.04■■■■□ 3.52
ZYX-208ENST00000468083 ADAMTS12P58397 1594 aa36.99■■■■□ 3.51
ZYX-208ENST00000468083 GRIN2AQ12879 1464 aa36.94■■■■□ 3.5
ZYX-208ENST00000468083 CLASP1Q7Z460 1538 aa36.84■■■■□ 3.49
ZYX-208ENST00000468083 NUP160Q12769 1436 aa36.83■■■■□ 3.49
ZYX-208ENST00000468083 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa36.79■■■■□ 3.48
ZYX-208ENST00000468083 CUL7Q14999 1698 aa36.77■■■■□ 3.48
ZYX-208ENST00000468083 CHIC1Q5VXU3 224 aa36.75■■■■□ 3.47
ZYX-208ENST00000468083 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa36.74■■■■□ 3.47
ZYX-208ENST00000468083 ARHGEF11O15085 1522 aa36.73■■■■□ 3.47
ZYX-208ENST00000468083 CEP170Q5SW79 1584 aa36.69■■■■□ 3.46
ZYX-208ENST00000468083 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa36.67■■■■□ 3.46
ZYX-208ENST00000468083 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa36.67■■■■□ 3.46
ZYX-208ENST00000468083 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa36.67■■■■□ 3.46
ZYX-208ENST00000468083 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa36.56■■■■□ 3.44
ZYX-208ENST00000468083 JPH4Q96JJ6 628 aa36.54■■■■□ 3.44
ZYX-208ENST00000468083 EEA1Q15075 1411 aa36.53■■■■□ 3.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.6 ms