RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568685.1

FUS-210, Transcript of FUS RNA binding protein, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene FUS, Length 1,785 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Exosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FUS-210ENST00000568685 NISCHQ9Y2I1 1504 aa53.65■■■■■ 6.18
FUS-210ENST00000568685 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa47.48■■■■■ 5.19
FUS-210ENST00000568685 ABCC9O60706 1549 aa45.99■■■■■ 4.95
FUS-210ENST00000568685 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP44.79■■■■■ 4.76
FUS-210ENST00000568685 DCAF8L2P0C7V8 631 aa44.6■■■■■ 4.73
FUS-210ENST00000568685 NACADO15069 1562 aa44.54■■■■■ 4.72
FUS-210ENST00000568685 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa44.45■■■■■ 4.71
FUS-210ENST00000568685 MYO15BQ96JP2 1530 aa44.44■■■■■ 4.7
FUS-210ENST00000568685 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa44.42■■■■■ 4.7
FUS-210ENST00000568685 UNC13AQ9UPW8 1703 aa43.48■■■■■ 4.55
FUS-210ENST00000568685 SCRIBQ14160 1630 aa43.34■■■■■ 4.53
FUS-210ENST00000568685 BICRAQ9NZM4 1560 aa43.11■■■■■ 4.49
FUS-210ENST00000568685 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP43.06■■■■■ 4.485e-12■■■■□ 24.4
FUS-210ENST00000568685 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa42.69■■■■■ 4.43
FUS-210ENST00000568685 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP41.93■■■■■ 4.3
FUS-210ENST00000568685 DNAJC5BQ9UF47 199 aa41.81■■■■■ 4.28
FUS-210ENST00000568685 CECR2Q9BXF3 1484 aa41.74■■■■■ 4.27
FUS-210ENST00000568685 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa41.64■■■■■ 4.26
FUS-210ENST00000568685 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP41.54■■■■■ 4.24
FUS-210ENST00000568685 SMARCA4P51532 1647 aa41.52■■■■■ 4.24
FUS-210ENST00000568685 MROH2BQ7Z745 1585 aa41.34■■■■■ 4.21
FUS-210ENST00000568685 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa41.19■■■■■ 4.18
FUS-210ENST00000568685 SMARCA2P51531 1590 aa41.15■■■■■ 4.18
FUS-210ENST00000568685 PEG3Q9GZU2 1588 aa41.13■■■■■ 4.17
FUS-210ENST00000568685 NCAPD3P42695 1498 aa41.1■■■■■ 4.17
FUS-210ENST00000568685 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP41.06■■■■■ 4.16
FUS-210ENST00000568685 HMGXB3Q12766 1538 aa40.93■■■■■ 4.14
FUS-210ENST00000568685 WIZO95785 1651 aa40.93■■■■■ 4.14
FUS-210ENST00000568685 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP40.86■■■■■ 4.13
FUS-210ENST00000568685 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP40.51■■■■■ 4.08
FUS-210ENST00000568685 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP40.35■■■■■ 4.05
FUS-210ENST00000568685 CCDC88BA6NC98 1476 aa40.04■■■■■ 4
FUS-210ENST00000568685 NESP48681 1621 aa39.95■■■■□ 3.99
FUS-210ENST00000568685 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa39.93■■■■□ 3.98
FUS-210ENST00000568685 CADPSQ9ULU8 1353 aa39.92■■■■□ 3.98
FUS-210ENST00000568685 CFTRP13569 1480 aa39.79■■■■□ 3.96
FUS-210ENST00000568685 PDS5BQ9NTI5 1447 aa39.64■■■■□ 3.94
FUS-210ENST00000568685 ERCC6Q03468 1493 aa39.59■■■■□ 3.93
FUS-210ENST00000568685 PRDM2Q13029 1718 aa39.51■■■■□ 3.92
FUS-210ENST00000568685 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa39.49■■■■□ 3.91
FUS-210ENST00000568685 FANCD2Q9BXW9 1451 aa39.45■■■■□ 3.91
FUS-210ENST00000568685 CEP164Q9UPV0 1460 aa39.35■■■■□ 3.89
FUS-210ENST00000568685 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP39.24■■■■□ 3.87
FUS-210ENST00000568685 MRC2Q9UBG0 1479 aa39.19■■■■□ 3.86
FUS-210ENST00000568685 WDR62O43379 1518 aa39.06■■■■□ 3.84
FUS-210ENST00000568685 CUX2O14529 1486 aa39.02■■■■□ 3.84
FUS-210ENST00000568685 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP39.02■■■■□ 3.84
FUS-210ENST00000568685 ABCC8Q09428 1581 aa38.91■■■■□ 3.82
FUS-210ENST00000568685 TOPBP1Q92547 1522 aa38.87■■■■□ 3.81
FUS-210ENST00000568685 DNMBPQ6XZF7 1577 aa38.86■■■■□ 3.81
FUS-210ENST00000568685 CUX1P39880 1505 aa38.76■■■■□ 3.8
FUS-210ENST00000568685 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP38.69■■■■□ 3.787e-6■□□□□ 9.3
FUS-210ENST00000568685 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP38.58■■■■□ 3.77
FUS-210ENST00000568685 SYNJ1O43426 1573 aa38.56■■■■□ 3.76
FUS-210ENST00000568685 TOP2BQ02880 1626 aa38.56■■■■□ 3.76
FUS-210ENST00000568685 FGD5Q6ZNL6 1462 aa38.55■■■■□ 3.76
FUS-210ENST00000568685 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa38.54■■■■□ 3.76
FUS-210ENST00000568685 IFT140Q96RY7 1462 aa38.51■■■■□ 3.76
FUS-210ENST00000568685 SOGA1O94964 1423 aa38.43■■■■□ 3.74
FUS-210ENST00000568685 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP38.43■■■■□ 3.74
FUS-210ENST00000568685 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa38.4■■■■□ 3.74
FUS-210ENST00000568685 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP38.3■■■■□ 3.72
FUS-210ENST00000568685 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa38.21■■■■□ 3.71
FUS-210ENST00000568685 WDR97A6NE52 1622 aa38.21■■■■□ 3.71
FUS-210ENST00000568685 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP38.16■■■■□ 3.7
FUS-210ENST00000568685 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP38.15■■■■□ 3.7
FUS-210ENST00000568685 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP38.15■■■■□ 3.74e-7■■■■□ 23.6
FUS-210ENST00000568685 TRIM41Q8WV44 630 aa38.1■■■■□ 3.69
FUS-210ENST00000568685 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa38.01■■■■□ 3.68
FUS-210ENST00000568685 GAPVD1Q14C86 1478 aa37.99■■■■□ 3.67
FUS-210ENST00000568685 CHIC1Q5VXU3 224 aa37.96■■■■□ 3.67
FUS-210ENST00000568685 GRIN2BQ13224 1484 aa37.92■■■■□ 3.66
FUS-210ENST00000568685 PBRM1Q86U86 1689 aa37.87■■■■□ 3.65
FUS-210ENST00000568685 KIF27Q86VH2 1401 aa37.84■■■■□ 3.65
FUS-210ENST00000568685 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa37.79■■■■□ 3.64
FUS-210ENST00000568685 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP37.78■■■■□ 3.64
FUS-210ENST00000568685 ERICH3Q5RHP9 1530 aa37.76■■■■□ 3.64
FUS-210ENST00000568685 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa37.65■■■■□ 3.62
FUS-210ENST00000568685 IGF1RP08069 1367 aa37.65■■■■□ 3.62
FUS-210ENST00000568685 SYNJ2O15056 1496 aa37.62■■■■□ 3.61
FUS-210ENST00000568685 ADAMTS12P58397 1594 aa37.6■■■■□ 3.61
FUS-210ENST00000568685 CHD1O14646 1710 aa37.59■■■■□ 3.61
FUS-210ENST00000568685 FBLN2P98095 1184 aa37.57■■■■□ 3.61
FUS-210ENST00000568685 FHAD1B1AJZ9 1412 aa37.57■■■■□ 3.61
FUS-210ENST00000568685 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP37.57■■■■□ 3.6
FUS-210ENST00000568685 OSCARQ8IYS5 282 aa37.51■■■■□ 3.6
FUS-210ENST00000568685 CUL7Q14999 1698 aa37.5■■■■□ 3.59
FUS-210ENST00000568685 GRIN2AQ12879 1464 aa37.44■■■■□ 3.58
FUS-210ENST00000568685 EEA1Q15075 1411 aa37.43■■■■□ 3.58
FUS-210ENST00000568685 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa37.42■■■■□ 3.58
FUS-210ENST00000568685 CSRNP3Q8WYN3 585 aa37.32■■■■□ 3.57
FUS-210ENST00000568685 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa37.29■■■■□ 3.56
FUS-210ENST00000568685 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP37.27■■■■□ 3.56
FUS-210ENST00000568685 NUP160Q12769 1436 aa37.26■■■■□ 3.56
FUS-210ENST00000568685 PRXQ9BXM0 1461 aa37.25■■■■□ 3.55
FUS-210ENST00000568685 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa37.25■■■■□ 3.55
FUS-210ENST00000568685 CEP170Q5SW79 1584 aa37.23■■■■□ 3.55
FUS-210ENST00000568685 CLASP1Q7Z460 1538 aa37.2■■■■□ 3.55
FUS-210ENST00000568685 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa37.02■■■■□ 3.52
FUS-210ENST00000568685 KIF21BO75037 1637 aa37.01■■■■□ 3.51
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