Protein–RNA interactions for Protein: Q8WYQ5

DGCR8, Microprocessor complex subunit DGCR8, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 773 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DGCR8Q8WYQ5 CACNA1C-211ENST00000399617 7482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.162e-6■■■■■ 45.2
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DGCR8Q8WYQ5 CACNA1C-219ENST00000399649 6529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.342e-6■■■■■ 45.2
DGCR8Q8WYQ5 CACNA1C-204ENST00000347598 6655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.42e-6■■■■■ 45.2
DGCR8Q8WYQ5 CACNA1C-213ENST00000399629 6562 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.42e-6■■■■■ 45.2
DGCR8Q8WYQ5 CACNA1C-205ENST00000399591 6535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.492e-6■■■■■ 45.2
DGCR8Q8WYQ5 CACNA1C-206ENST00000399595 6535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.492e-6■■■■■ 45.2
DGCR8Q8WYQ5 CACNA1C-207ENST00000399597 6511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.52e-6■■■■■ 45.2
DGCR8Q8WYQ5 CACNA1C-208ENST00000399601 6511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.52e-6■■■■■ 45.2
DGCR8Q8WYQ5 CACNA1C-217ENST00000399641 6511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.52e-6■■■■■ 45.2
DGCR8Q8WYQ5 CACNA1C-218ENST00000399644 6511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.52e-6■■■■■ 45.2
DGCR8Q8WYQ5 CACNA1C-203ENST00000344100 6634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.542e-6■■■■■ 45.2
DGCR8Q8WYQ5 CACNA1C-210ENST00000399606 6571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.562e-6■■■■■ 45.2
DGCR8Q8WYQ5 CACNA1C-212ENST00000399621 6568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.562e-6■■■■■ 45.2
DGCR8Q8WYQ5 CACNA1C-215ENST00000399637 6568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.562e-6■■■■■ 45.2
DGCR8Q8WYQ5 CACNA1C-216ENST00000399638 6595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.562e-6■■■■■ 45.2
DGCR8Q8WYQ5 CACNA1C-221ENST00000402845 6568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.562e-6■■■■■ 45.2
DGCR8Q8WYQ5 CACNA1C-201ENST00000327702 6616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.572e-6■■■■■ 45.2
DGCR8Q8WYQ5 CACNA1C-202ENST00000335762 6968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.642e-6■■■■■ 45.2
DGCR8Q8WYQ5 CACNA1C-225ENST00000480911 6811 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.782e-6■■■■■ 45.2
DGCR8Q8WYQ5 CACNA1C-220ENST00000399655 13433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.882e-6■■■■■ 45.2
DGCR8Q8WYQ5 BRD4-203ENST00000371835 4624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.357e-7■■■■■ 45.2
DGCR8Q8WYQ5 NCOA7-203ENST00000392477 6457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.136e-12■■■■■ 45.1
DGCR8Q8WYQ5 NCOA7-210ENST00000453302 581 ntTSL 311.75□□□□□ -0.536e-12■■■■■ 45.1
DGCR8Q8WYQ5 ZC3H13-202ENST00000282007 6412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.559e-8■■■■■ 45.1
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DGCR8Q8WYQ5 ZC3H13-201ENST00000242848 8018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.059e-8■■■■■ 45.1
DGCR8Q8WYQ5 NCOA7-201ENST00000229634 2998 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.356e-12■■■■■ 45.1
DGCR8Q8WYQ5 NCOA7-202ENST00000368357 5521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.566e-12■■■■■ 45.1
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DGCR8Q8WYQ5 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.192e-7■■■■■ 45.1
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DGCR8Q8WYQ5 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.556e-7■■■■■ 45.1
DGCR8Q8WYQ5 PPM1L-205ENST00000498165 10934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.096e-7■■■■■ 45.1
DGCR8Q8WYQ5 PPP2R2D-207ENST00000616467 2058 ntTSL 1 (best)26.1■■□□□ 1.772e-6■■■■■ 44.9
DGCR8Q8WYQ5 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.392e-6■■■■■ 44.9
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DGCR8Q8WYQ5 PPP2R2D-202ENST00000470416 6203 ntTSL 1 (best)11.42□□□□□ -0.582e-6■■■■■ 44.9
DGCR8Q8WYQ5 MSI2-216ENST00000582772 398 ntTSL 34.24□□□□□ -1.731e-6■■■■■ 44.9
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DGCR8Q8WYQ5 ARHGEF3-208ENST00000477440 587 ntTSL 324.06■■□□□ 1.444e-7■■■■■ 44.8
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DGCR8Q8WYQ5 SNX29-204ENST00000564791 1633 ntTSL 1 (best)11.58□□□□□ -0.564e-7■■■■■ 44.8
DGCR8Q8WYQ5 ARHGEF3-202ENST00000338458 3639 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.724e-7■■■■■ 44.8
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DGCR8Q8WYQ5 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.872e-6■■■■■ 44.6
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DGCR8Q8WYQ5 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.62e-6■■■■■ 44.6
DGCR8Q8WYQ5 DNAJB2-213ENST00000477917 4487 ntTSL 215.83■□□□□ 0.132e-6■■■■■ 44.6
DGCR8Q8WYQ5 GNG12-202ENST00000494936 463 ntTSL 214.55□□□□□ -0.083e-8■■■■■ 44.6
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DGCR8Q8WYQ5 LIMCH1-217ENST00000512946 5057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.462e-6■■■■■ 44.5
DGCR8Q8WYQ5 LIMCH1-215ENST00000512632 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.82e-6■■■■■ 44.5
DGCR8Q8WYQ5 LIMCH1-218ENST00000513024 5129 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.92e-6■■■■■ 44.5
DGCR8Q8WYQ5 LIMCH1-216ENST00000512820 5071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.952e-6■■■■■ 44.5
DGCR8Q8WYQ5 LIMCH1-201ENST00000313860 6165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -12e-6■■■■■ 44.5
DGCR8Q8WYQ5 PDGFRA-201ENST00000257290 6576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.181e-6■■■■■ 44.5
DGCR8Q8WYQ5 SEC14L1-202ENST00000430767 5283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.364e-7■■■■■ 44.3
DGCR8Q8WYQ5 SEC14L1-204ENST00000436233 5295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.364e-7■■■■■ 44.3
DGCR8Q8WYQ5 SEC14L1-201ENST00000392476 2957 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.64e-7■■■■■ 44.3
DGCR8Q8WYQ5 SEC14L1-205ENST00000443798 2908 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.634e-7■■■■■ 44.3
DGCR8Q8WYQ5 SNTB1-203ENST00000519177 1962 ntTSL 1 (best)20.01■□□□□ 0.791e-6■■■■■ 44.3
DGCR8Q8WYQ5 ASAP1-215ENST00000524299 550 ntTSL 410.07□□□□□ -0.83e-7■■■■■ 44.3
DGCR8Q8WYQ5 MIR660-201ENST00000385235 97 ntBASIC0.59□□□□□ -2.311e-13■■■■■ 44.3
DGCR8Q8WYQ5 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.577e-7■■■■■ 44.2
DGCR8Q8WYQ5 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.017e-7■■■■■ 44.2
DGCR8Q8WYQ5 CTTN-201ENST00000301843 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.087e-7■■■■■ 44.2
DGCR8Q8WYQ5 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.512e-9■■■■■ 44.1
DGCR8Q8WYQ5 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.132e-9■■■■■ 44.1
DGCR8Q8WYQ5 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.092e-9■■■■■ 44.1
DGCR8Q8WYQ5 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.042e-9■■■■■ 44.1
DGCR8Q8WYQ5 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.012e-9■■■■■ 44.1
DGCR8Q8WYQ5 PRKRIP1-207ENST00000482549 1625 ntTSL 1 (best)26.72■■□□□ 1.872e-9■■■■■ 44.1
DGCR8Q8WYQ5 ZEB1-214ENST00000558863 1355 ntTSL 524.01■■□□□ 1.432e-9■■■■■ 44.1
DGCR8Q8WYQ5 PRKRIP1-204ENST00000469763 1642 ntTSL 523.66■■□□□ 1.382e-9■■■■■ 44.1
DGCR8Q8WYQ5 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.272e-9■■■■■ 44.1
DGCR8Q8WYQ5 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.271e-6■■■■■ 44.1
DGCR8Q8WYQ5 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.252e-9■■■■■ 44.1
DGCR8Q8WYQ5 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.172e-9■■■■■ 44.1
DGCR8Q8WYQ5 ST3GAL4-216ENST00000533826 1037 ntTSL 321.22■□□□□ 0.992e-9■■■■■ 44.1
DGCR8Q8WYQ5 PRKRIP1-205ENST00000477886 986 ntTSL 1 (best)21.16■□□□□ 0.982e-9■■■■■ 44.1
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