RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000393028.5

GIPC1-202, Transcript of GIPC PDZ domain containing family member 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene GIPC1, Length 1,483 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC1-202ENST00000393028 NISCHQ9Y2I1 1504 aa66.73■■■■■ 8.27
GIPC1-202ENST00000393028 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa58.92■■■■■ 7.02
GIPC1-202ENST00000393028 ABCC9O60706 1549 aa56.68■■■■■ 6.66
GIPC1-202ENST00000393028 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP55.84■■■■■ 6.53
GIPC1-202ENST00000393028 DCAF8L2P0C7V8 631 aa55.34■■■■■ 6.45
GIPC1-202ENST00000393028 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa55.18■■■■■ 6.42
GIPC1-202ENST00000393028 NACADO15069 1562 aa55.05■■■■■ 6.4
GIPC1-202ENST00000393028 MYO15BQ96JP2 1530 aa54.98■■■■■ 6.39
GIPC1-202ENST00000393028 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa54.9■■■■■ 6.38
GIPC1-202ENST00000393028 SCRIBQ14160 1630 aa53.96■■■■■ 6.23
GIPC1-202ENST00000393028 UNC13AQ9UPW8 1703 aa53.9■■■■■ 6.22
GIPC1-202ENST00000393028 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa53.5■■■■■ 6.15
GIPC1-202ENST00000393028 BICRAQ9NZM4 1560 aa53.29■■■■■ 6.12
GIPC1-202ENST00000393028 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP53.11■■■■■ 6.09
GIPC1-202ENST00000393028 CECR2Q9BXF3 1484 aa51.93■■■■■ 5.9
GIPC1-202ENST00000393028 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP51.77■■■■■ 5.88
GIPC1-202ENST00000393028 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP51.64■■■■■ 5.86
GIPC1-202ENST00000393028 SMARCA4P51532 1647 aa51.63■■■■■ 5.86
GIPC1-202ENST00000393028 MROH2BQ7Z745 1585 aa51.52■■■■■ 5.84
GIPC1-202ENST00000393028 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa51.33■■■■■ 5.81
GIPC1-202ENST00000393028 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP51.23■■■■■ 5.79
GIPC1-202ENST00000393028 WIZO95785 1651 aa51.09■■■■■ 5.77
GIPC1-202ENST00000393028 PEG3Q9GZU2 1588 aa51.02■■■■■ 5.76
GIPC1-202ENST00000393028 DNAJC5BQ9UF47 199 aa51.02■■■■■ 5.76
GIPC1-202ENST00000393028 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa51■■■■■ 5.75
GIPC1-202ENST00000393028 SMARCA2P51531 1590 aa50.98■■■■■ 5.75
GIPC1-202ENST00000393028 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP50.78■■■■■ 5.72
GIPC1-202ENST00000393028 NCAPD3P42695 1498 aa50.74■■■■■ 5.71
GIPC1-202ENST00000393028 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP50.68■■■■■ 5.7
GIPC1-202ENST00000393028 HMGXB3Q12766 1538 aa50.67■■■■■ 5.7
GIPC1-202ENST00000393028 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP50.52■■■■■ 5.68
GIPC1-202ENST00000393028 CCDC88BA6NC98 1476 aa49.89■■■■■ 5.58
GIPC1-202ENST00000393028 NESP48681 1621 aa49.39■■■■■ 5.5
GIPC1-202ENST00000393028 CADPSQ9ULU8 1353 aa49.33■■■■■ 5.49
GIPC1-202ENST00000393028 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa49.31■■■■■ 5.48
GIPC1-202ENST00000393028 CFTRP13569 1480 aa49.29■■■■■ 5.48
GIPC1-202ENST00000393028 PRDM2Q13029 1718 aa49.22■■■■■ 5.47
GIPC1-202ENST00000393028 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa48.92■■■■■ 5.42
GIPC1-202ENST00000393028 PDS5BQ9NTI5 1447 aa48.87■■■■■ 5.41
GIPC1-202ENST00000393028 FANCD2Q9BXW9 1451 aa48.85■■■■■ 5.41
GIPC1-202ENST00000393028 ERCC6Q03468 1493 aa48.73■■■■■ 5.39
GIPC1-202ENST00000393028 CEP164Q9UPV0 1460 aa48.7■■■■■ 5.39
GIPC1-202ENST00000393028 ABCC8Q09428 1581 aa48.51■■■■■ 5.36
GIPC1-202ENST00000393028 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP48.42■■■■■ 5.34
GIPC1-202ENST00000393028 MRC2Q9UBG0 1479 aa48.4■■■■■ 5.34
GIPC1-202ENST00000393028 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP48.34■■■■■ 5.33
GIPC1-202ENST00000393028 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP48.28■■■■■ 5.32
GIPC1-202ENST00000393028 CUX1P39880 1505 aa48.28■■■■■ 5.32
GIPC1-202ENST00000393028 DNMBPQ6XZF7 1577 aa48.25■■■■■ 5.31
GIPC1-202ENST00000393028 SYNJ1O43426 1573 aa48.23■■■■■ 5.31
GIPC1-202ENST00000393028 WDR62O43379 1518 aa48.22■■■■■ 5.31
GIPC1-202ENST00000393028 TOPBP1Q92547 1522 aa48.2■■■■■ 5.31
GIPC1-202ENST00000393028 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa48.13■■■■■ 5.3
GIPC1-202ENST00000393028 TOP2BQ02880 1626 aa48.11■■■■■ 5.29
GIPC1-202ENST00000393028 CHIC1Q5VXU3 224 aa47.95■■■■■ 5.27
GIPC1-202ENST00000393028 FGD5Q6ZNL6 1462 aa47.93■■■■■ 5.26
GIPC1-202ENST00000393028 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP47.87■■■■■ 5.25
GIPC1-202ENST00000393028 TRIM41Q8WV44 630 aa47.81■■■■■ 5.24
GIPC1-202ENST00000393028 CUX2O14529 1486 aa47.75■■■■■ 5.24
GIPC1-202ENST00000393028 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa47.68■■■■■ 5.22
GIPC1-202ENST00000393028 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP47.64■■■■■ 5.22
GIPC1-202ENST00000393028 SOGA1O94964 1423 aa47.62■■■■■ 5.21
GIPC1-202ENST00000393028 IFT140Q96RY7 1462 aa47.57■■■■■ 5.21
GIPC1-202ENST00000393028 WDR97A6NE52 1622 aa47.57■■■■■ 5.21
GIPC1-202ENST00000393028 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa47.45■■■■■ 5.19
GIPC1-202ENST00000393028 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP47.38■■■■■ 5.18
GIPC1-202ENST00000393028 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP47.29■■■■■ 5.16
GIPC1-202ENST00000393028 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP47.27■■■■■ 5.16
GIPC1-202ENST00000393028 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa47.27■■■■■ 5.16
GIPC1-202ENST00000393028 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP47.21■■■■■ 5.15
GIPC1-202ENST00000393028 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa47.19■■■■■ 5.14
GIPC1-202ENST00000393028 KIF27Q86VH2 1401 aa47.15■■■■■ 5.14
GIPC1-202ENST00000393028 GAPVD1Q14C86 1478 aa47.13■■■■■ 5.13
GIPC1-202ENST00000393028 PBRM1Q86U86 1689 aa47.12■■■■■ 5.13
GIPC1-202ENST00000393028 GRIN2BQ13224 1484 aa46.95■■■■■ 5.11
GIPC1-202ENST00000393028 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP46.94■■■■■ 5.1
GIPC1-202ENST00000393028 ERICH3Q5RHP9 1530 aa46.9■■■■■ 5.1
GIPC1-202ENST00000393028 EEA1Q15075 1411 aa46.89■■■■■ 5.1
GIPC1-202ENST00000393028 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa46.83■■■■■ 5.09
GIPC1-202ENST00000393028 IGF1RP08069 1367 aa46.81■■■■■ 5.08
GIPC1-202ENST00000393028 ADAMTS12P58397 1594 aa46.74■■■■■ 5.07
GIPC1-202ENST00000393028 CUL7Q14999 1698 aa46.74■■■■■ 5.07
GIPC1-202ENST00000393028 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP46.71■■■■■ 5.07
GIPC1-202ENST00000393028 CSRNP3Q8WYN3 585 aa46.69■■■■■ 5.06
GIPC1-202ENST00000393028 FHAD1B1AJZ9 1412 aa46.58■■■■■ 5.05
GIPC1-202ENST00000393028 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa46.57■■■■■ 5.05
GIPC1-202ENST00000393028 CHD1O14646 1710 aa46.56■■■■■ 5.04
GIPC1-202ENST00000393028 SYNJ2O15056 1496 aa46.54■■■■■ 5.04
GIPC1-202ENST00000393028 PRXQ9BXM0 1461 aa46.53■■■■■ 5.04
GIPC1-202ENST00000393028 KIF21BO75037 1637 aa46.47■■■■■ 5.03
GIPC1-202ENST00000393028 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa46.43■■■■■ 5.02
GIPC1-202ENST00000393028 FBLN2P98095 1184 aa46.42■■■■■ 5.02
GIPC1-202ENST00000393028 GRIN2AQ12879 1464 aa46.39■■■■■ 5.02
GIPC1-202ENST00000393028 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP46.38■■■■■ 5.02
GIPC1-202ENST00000393028 EHMT2Q96KQ7 1210 aa46.34■■■■■ 5.01
GIPC1-202ENST00000393028 GOLGA3Q08378 1498 aa46.24■■■■■ 4.99
GIPC1-202ENST00000393028 CEP170Q5SW79 1584 aa46.19■■■■■ 4.98
GIPC1-202ENST00000393028 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa46.12■■■■■ 4.97
GIPC1-202ENST00000393028 NUP160Q12769 1436 aa46.1■■■■■ 4.97
GIPC1-202ENST00000393028 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa46.05■■■■■ 4.96
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