RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558863.5

ZEB1-214, Transcript of zinc finger E-box binding homeobox 1, humanhuman

TSL 5

Gene ZEB1, Length 1,355 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZEB1-214ENST00000558863 NISCHQ9Y2I1 1504 aa58.25■■■■■ 6.92
ZEB1-214ENST00000558863 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa51.63■■■■■ 5.86
ZEB1-214ENST00000558863 ABCC9O60706 1549 aa49.89■■■■■ 5.58
ZEB1-214ENST00000558863 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP48.64■■■■■ 5.38
ZEB1-214ENST00000558863 NACADO15069 1562 aa48.42■■■■■ 5.34
ZEB1-214ENST00000558863 DCAF8L2P0C7V8 631 aa48.38■■■■■ 5.33
ZEB1-214ENST00000558863 MYO15BQ96JP2 1530 aa48.35■■■■■ 5.33
ZEB1-214ENST00000558863 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa48.33■■■■■ 5.33
ZEB1-214ENST00000558863 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa48.31■■■■■ 5.32
ZEB1-214ENST00000558863 UNC13AQ9UPW8 1703 aa47.13■■■■■ 5.14
ZEB1-214ENST00000558863 SCRIBQ14160 1630 aa47.04■■■■■ 5.12
ZEB1-214ENST00000558863 BICRAQ9NZM4 1560 aa46.76■■■■■ 5.08
ZEB1-214ENST00000558863 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP46.67■■■■■ 5.06
ZEB1-214ENST00000558863 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa46.5■■■■■ 5.03
ZEB1-214ENST00000558863 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP45.52■■■■■ 4.88
ZEB1-214ENST00000558863 DNAJC5BQ9UF47 199 aa45.24■■■■■ 4.83
ZEB1-214ENST00000558863 CECR2Q9BXF3 1484 aa45.24■■■■■ 4.83
ZEB1-214ENST00000558863 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa45.18■■■■■ 4.82
ZEB1-214ENST00000558863 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP45.15■■■■■ 4.82
ZEB1-214ENST00000558863 SMARCA4P51532 1647 aa45.09■■■■■ 4.81
ZEB1-214ENST00000558863 MROH2BQ7Z745 1585 aa44.84■■■■■ 4.77
ZEB1-214ENST00000558863 SMARCA2P51531 1590 aa44.75■■■■■ 4.75
ZEB1-214ENST00000558863 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa44.7■■■■■ 4.75
ZEB1-214ENST00000558863 PEG3Q9GZU2 1588 aa44.69■■■■■ 4.75
ZEB1-214ENST00000558863 NCAPD3P42695 1498 aa44.65■■■■■ 4.74
ZEB1-214ENST00000558863 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP44.55■■■■■ 4.72
ZEB1-214ENST00000558863 HMGXB3Q12766 1538 aa44.49■■■■■ 4.71
ZEB1-214ENST00000558863 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP44.39■■■■■ 4.7
ZEB1-214ENST00000558863 WIZO95785 1651 aa44.38■■■■■ 4.7
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ZEB1-214ENST00000558863 CCDC88BA6NC98 1476 aa43.46■■■■■ 4.55
ZEB1-214ENST00000558863 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa43.41■■■■■ 4.54
ZEB1-214ENST00000558863 CADPSQ9ULU8 1353 aa43.36■■■■■ 4.53
ZEB1-214ENST00000558863 NESP48681 1621 aa43.29■■■■■ 4.52
ZEB1-214ENST00000558863 CFTRP13569 1480 aa43.21■■■■■ 4.51
ZEB1-214ENST00000558863 PDS5BQ9NTI5 1447 aa43.11■■■■■ 4.49
ZEB1-214ENST00000558863 ERCC6Q03468 1493 aa43.03■■■■■ 4.48
ZEB1-214ENST00000558863 PRDM2Q13029 1718 aa42.95■■■■■ 4.47
ZEB1-214ENST00000558863 FANCD2Q9BXW9 1451 aa42.84■■■■■ 4.45
ZEB1-214ENST00000558863 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa42.84■■■■■ 4.45
ZEB1-214ENST00000558863 CEP164Q9UPV0 1460 aa42.77■■■■■ 4.44
ZEB1-214ENST00000558863 MRC2Q9UBG0 1479 aa42.59■■■■■ 4.41
ZEB1-214ENST00000558863 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP42.59■■■■■ 4.41
ZEB1-214ENST00000558863 CUX2O14529 1486 aa42.44■■■■■ 4.38
ZEB1-214ENST00000558863 WDR62O43379 1518 aa42.43■■■■■ 4.38
ZEB1-214ENST00000558863 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP42.34■■■■■ 4.37
ZEB1-214ENST00000558863 ABCC8Q09428 1581 aa42.34■■■■■ 4.37
ZEB1-214ENST00000558863 DNMBPQ6XZF7 1577 aa42.24■■■■■ 4.35
ZEB1-214ENST00000558863 TOPBP1Q92547 1522 aa42.21■■■■■ 4.35
ZEB1-214ENST00000558863 CUX1P39880 1505 aa42.06■■■■■ 4.32
ZEB1-214ENST00000558863 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP42.03■■■■■ 4.32
ZEB1-214ENST00000558863 TOP2BQ02880 1626 aa41.89■■■■■ 4.3
ZEB1-214ENST00000558863 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP41.88■■■■■ 4.29
ZEB1-214ENST00000558863 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa41.87■■■■■ 4.29
ZEB1-214ENST00000558863 IFT140Q96RY7 1462 aa41.86■■■■■ 4.29
ZEB1-214ENST00000558863 FGD5Q6ZNL6 1462 aa41.85■■■■■ 4.29
ZEB1-214ENST00000558863 SYNJ1O43426 1573 aa41.83■■■■■ 4.29
ZEB1-214ENST00000558863 SOGA1O94964 1423 aa41.74■■■■■ 4.27
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ZEB1-214ENST00000558863 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa41.64■■■■■ 4.26
ZEB1-214ENST00000558863 WDR97A6NE52 1622 aa41.54■■■■■ 4.24
ZEB1-214ENST00000558863 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa41.52■■■■■ 4.24
ZEB1-214ENST00000558863 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP41.52■■■■■ 4.24
ZEB1-214ENST00000558863 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP41.44■■■■■ 4.22
ZEB1-214ENST00000558863 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP41.38■■■■■ 4.22
ZEB1-214ENST00000558863 TRIM41Q8WV44 630 aa41.37■■■■■ 4.21
ZEB1-214ENST00000558863 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP41.37■■■■■ 4.21
ZEB1-214ENST00000558863 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa41.28■■■■■ 4.2
ZEB1-214ENST00000558863 GAPVD1Q14C86 1478 aa41.27■■■■■ 4.2
ZEB1-214ENST00000558863 GRIN2BQ13224 1484 aa41.22■■■■■ 4.19
ZEB1-214ENST00000558863 CHIC1Q5VXU3 224 aa41.16■■■■■ 4.18
ZEB1-214ENST00000558863 KIF27Q86VH2 1401 aa41.14■■■■■ 4.18
ZEB1-214ENST00000558863 PBRM1Q86U86 1689 aa41.13■■■■■ 4.17
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ZEB1-214ENST00000558863 ERICH3Q5RHP9 1530 aa41.05■■■■■ 4.16
ZEB1-214ENST00000558863 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa41.04■■■■■ 4.16
ZEB1-214ENST00000558863 SYNJ2O15056 1496 aa40.89■■■■■ 4.14
ZEB1-214ENST00000558863 IGF1RP08069 1367 aa40.85■■■■■ 4.13
ZEB1-214ENST00000558863 FHAD1B1AJZ9 1412 aa40.84■■■■■ 4.13
ZEB1-214ENST00000558863 ADAMTS12P58397 1594 aa40.84■■■■■ 4.13
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ZEB1-214ENST00000558863 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa40.77■■■■■ 4.12
ZEB1-214ENST00000558863 EEA1Q15075 1411 aa40.76■■■■■ 4.12
ZEB1-214ENST00000558863 OSCARQ8IYS5 282 aa40.74■■■■■ 4.11
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ZEB1-214ENST00000558863 NUP160Q12769 1436 aa40.47■■■■■ 4.07
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ZEB1-214ENST00000558863 PRXQ9BXM0 1461 aa40.45■■■■■ 4.07
ZEB1-214ENST00000558863 CEP170Q5SW79 1584 aa40.4■■■■■ 4.06
ZEB1-214ENST00000558863 CLASP1Q7Z460 1538 aa40.4■■■■■ 4.06
ZEB1-214ENST00000558863 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP40.39■■■■■ 4.06
ZEB1-214ENST00000558863 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa40.24■■■■■ 4.03
ZEB1-214ENST00000558863 KIF21BO75037 1637 aa40.23■■■■■ 4.03
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