RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000586027.5

GIPC1-205, Transcript of GIPC PDZ domain containing family member 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene GIPC1, Length 1,386 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC1-205ENST00000586027 NISCHQ9Y2I1 1504 aa75.24■■■■■ 9.64
GIPC1-205ENST00000586027 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa66.51■■■■■ 8.24
GIPC1-205ENST00000586027 ABCC9O60706 1549 aa64.58■■■■■ 7.93
GIPC1-205ENST00000586027 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP62.83■■■■■ 7.65
GIPC1-205ENST00000586027 DCAF8L2P0C7V8 631 aa62.6■■■■■ 7.61
GIPC1-205ENST00000586027 NACADO15069 1562 aa62.39■■■■■ 7.58
GIPC1-205ENST00000586027 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa62.3■■■■■ 7.56
GIPC1-205ENST00000586027 MYO15BQ96JP2 1530 aa62.22■■■■■ 7.55
GIPC1-205ENST00000586027 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa62.22■■■■■ 7.55
GIPC1-205ENST00000586027 UNC13AQ9UPW8 1703 aa60.95■■■■■ 7.35
GIPC1-205ENST00000586027 SCRIBQ14160 1630 aa60.85■■■■■ 7.33
GIPC1-205ENST00000586027 BICRAQ9NZM4 1560 aa60.51■■■■■ 7.28
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GIPC1-205ENST00000586027 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa59.93■■■■■ 7.18
GIPC1-205ENST00000586027 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP58.81■■■■■ 7
GIPC1-205ENST00000586027 DNAJC5BQ9UF47 199 aa58.77■■■■■ 7
GIPC1-205ENST00000586027 CECR2Q9BXF3 1484 aa58.62■■■■■ 6.98
GIPC1-205ENST00000586027 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa58.41■■■■■ 6.94
GIPC1-205ENST00000586027 SMARCA4P51532 1647 aa58.23■■■■■ 6.91
GIPC1-205ENST00000586027 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP58.22■■■■■ 6.91
GIPC1-205ENST00000586027 MROH2BQ7Z745 1585 aa58.06■■■■■ 6.88
GIPC1-205ENST00000586027 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa57.78■■■■■ 6.84
GIPC1-205ENST00000586027 SMARCA2P51531 1590 aa57.66■■■■■ 6.82
GIPC1-205ENST00000586027 PEG3Q9GZU2 1588 aa57.63■■■■■ 6.82
GIPC1-205ENST00000586027 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP57.62■■■■■ 6.81
GIPC1-205ENST00000586027 NCAPD3P42695 1498 aa57.61■■■■■ 6.81
GIPC1-205ENST00000586027 WIZO95785 1651 aa57.44■■■■■ 6.79
GIPC1-205ENST00000586027 HMGXB3Q12766 1538 aa57.36■■■■■ 6.77
GIPC1-205ENST00000586027 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP57.3■■■■■ 6.76
GIPC1-205ENST00000586027 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP56.83■■■■■ 6.69
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GIPC1-205ENST00000586027 CCDC88BA6NC98 1476 aa56.2■■■■■ 6.59
GIPC1-205ENST00000586027 NESP48681 1621 aa56.12■■■■■ 6.57
GIPC1-205ENST00000586027 CADPSQ9ULU8 1353 aa55.98■■■■■ 6.55
GIPC1-205ENST00000586027 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa55.94■■■■■ 6.55
GIPC1-205ENST00000586027 CFTRP13569 1480 aa55.79■■■■■ 6.52
GIPC1-205ENST00000586027 PDS5BQ9NTI5 1447 aa55.55■■■■■ 6.48
GIPC1-205ENST00000586027 ERCC6Q03468 1493 aa55.53■■■■■ 6.48
GIPC1-205ENST00000586027 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa55.39■■■■■ 6.46
GIPC1-205ENST00000586027 FANCD2Q9BXW9 1451 aa55.34■■■■■ 6.45
GIPC1-205ENST00000586027 PRDM2Q13029 1718 aa55.32■■■■■ 6.45
GIPC1-205ENST00000586027 CEP164Q9UPV0 1460 aa55.18■■■■■ 6.42
GIPC1-205ENST00000586027 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP55.07■■■■■ 6.41
GIPC1-205ENST00000586027 MRC2Q9UBG0 1479 aa54.98■■■■■ 6.39
GIPC1-205ENST00000586027 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP54.8■■■■■ 6.36
GIPC1-205ENST00000586027 WDR62O43379 1518 aa54.78■■■■■ 6.36
GIPC1-205ENST00000586027 CUX2O14529 1486 aa54.68■■■■■ 6.34
GIPC1-205ENST00000586027 TOPBP1Q92547 1522 aa54.55■■■■■ 6.32
GIPC1-205ENST00000586027 DNMBPQ6XZF7 1577 aa54.5■■■■■ 6.32
GIPC1-205ENST00000586027 ABCC8Q09428 1581 aa54.45■■■■■ 6.31
GIPC1-205ENST00000586027 CUX1P39880 1505 aa54.42■■■■■ 6.3
GIPC1-205ENST00000586027 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP54.26■■■■■ 6.28
GIPC1-205ENST00000586027 SYNJ1O43426 1573 aa54.14■■■■■ 6.26
GIPC1-205ENST00000586027 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP54.14■■■■■ 6.26
GIPC1-205ENST00000586027 FGD5Q6ZNL6 1462 aa54.1■■■■■ 6.25
GIPC1-205ENST00000586027 TOP2BQ02880 1626 aa54.06■■■■■ 6.25
GIPC1-205ENST00000586027 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa54.04■■■■■ 6.24
GIPC1-205ENST00000586027 IFT140Q96RY7 1462 aa53.99■■■■■ 6.23
GIPC1-205ENST00000586027 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa53.94■■■■■ 6.22
GIPC1-205ENST00000586027 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP53.9■■■■■ 6.22
GIPC1-205ENST00000586027 SOGA1O94964 1423 aa53.9■■■■■ 6.22
GIPC1-205ENST00000586027 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP53.8■■■■■ 6.2
GIPC1-205ENST00000586027 WDR97A6NE52 1622 aa53.59■■■■■ 6.17
GIPC1-205ENST00000586027 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa53.59■■■■■ 6.17
GIPC1-205ENST00000586027 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP53.57■■■■■ 6.17
GIPC1-205ENST00000586027 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP53.56■■■■■ 6.16
GIPC1-205ENST00000586027 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP53.54■■■■■ 6.16
GIPC1-205ENST00000586027 TRIM41Q8WV44 630 aa53.42■■■■■ 6.14
GIPC1-205ENST00000586027 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa53.32■■■■■ 6.13
GIPC1-205ENST00000586027 CHIC1Q5VXU3 224 aa53.28■■■■■ 6.12
GIPC1-205ENST00000586027 GAPVD1Q14C86 1478 aa53.28■■■■■ 6.12
GIPC1-205ENST00000586027 GRIN2BQ13224 1484 aa53.17■■■■■ 6.1
GIPC1-205ENST00000586027 PBRM1Q86U86 1689 aa53.1■■■■■ 6.09
GIPC1-205ENST00000586027 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa53.05■■■■■ 6.08
GIPC1-205ENST00000586027 KIF27Q86VH2 1401 aa53.04■■■■■ 6.08
GIPC1-205ENST00000586027 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP52.94■■■■■ 6.07
GIPC1-205ENST00000586027 ERICH3Q5RHP9 1530 aa52.92■■■■■ 6.06
GIPC1-205ENST00000586027 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa52.91■■■■■ 6.06
GIPC1-205ENST00000586027 IGF1RP08069 1367 aa52.82■■■■■ 6.05
GIPC1-205ENST00000586027 ADAMTS12P58397 1594 aa52.77■■■■■ 6.04
GIPC1-205ENST00000586027 SYNJ2O15056 1496 aa52.75■■■■■ 6.03
GIPC1-205ENST00000586027 FBLN2P98095 1184 aa52.73■■■■■ 6.03
GIPC1-205ENST00000586027 CHD1O14646 1710 aa52.73■■■■■ 6.03
GIPC1-205ENST00000586027 FHAD1B1AJZ9 1412 aa52.68■■■■■ 6.02
GIPC1-205ENST00000586027 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP52.66■■■■■ 6.02
GIPC1-205ENST00000586027 OSCARQ8IYS5 282 aa52.55■■■■■ 6
GIPC1-205ENST00000586027 CUL7Q14999 1698 aa52.54■■■■■ 6
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GIPC1-205ENST00000586027 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa52.48■■■■■ 5.99
GIPC1-205ENST00000586027 EEA1Q15075 1411 aa52.43■■■■■ 5.98
GIPC1-205ENST00000586027 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP52.38■■■■■ 5.98
GIPC1-205ENST00000586027 CSRNP3Q8WYN3 585 aa52.34■■■■■ 5.97
GIPC1-205ENST00000586027 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa52.29■■■■■ 5.96
GIPC1-205ENST00000586027 NUP160Q12769 1436 aa52.26■■■■■ 5.96
GIPC1-205ENST00000586027 CEP170Q5SW79 1584 aa52.25■■■■■ 5.96
GIPC1-205ENST00000586027 PRXQ9BXM0 1461 aa52.25■■■■■ 5.96
GIPC1-205ENST00000586027 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa52.23■■■■■ 5.95
GIPC1-205ENST00000586027 CLASP1Q7Z460 1538 aa52.2■■■■■ 5.95
GIPC1-205ENST00000586027 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa51.9■■■■■ 5.9
GIPC1-205ENST00000586027 KIF21BO75037 1637 aa51.88■■■■■ 5.9
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