RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477440.6

ARHGEF3-208, Transcript of Rho guanine nucleotide exchange factor 3, humanhuman

TSL 3

Gene ARHGEF3, Length 587 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF3-208ENST00000477440 NISCHQ9Y2I1 1504 aa61.9■■■■■ 7.5
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ARHGEF3-208ENST00000477440 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa51.85■■■■■ 5.89
ARHGEF3-208ENST00000477440 NACADO15069 1562 aa51.76■■■■■ 5.88
ARHGEF3-208ENST00000477440 DCAF8L2P0C7V8 631 aa51.66■■■■■ 5.86
ARHGEF3-208ENST00000477440 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP51.59■■■■■ 5.85
ARHGEF3-208ENST00000477440 MYO15BQ96JP2 1530 aa51.41■■■■■ 5.82
ARHGEF3-208ENST00000477440 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa51.19■■■■■ 5.79
ARHGEF3-208ENST00000477440 UNC13AQ9UPW8 1703 aa50.84■■■■■ 5.73
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ARHGEF3-208ENST00000477440 SCRIBQ14160 1630 aa50.3■■■■■ 5.64
ARHGEF3-208ENST00000477440 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa49.7■■■■■ 5.55
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ARHGEF3-208ENST00000477440 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa48.82■■■■■ 5.41
ARHGEF3-208ENST00000477440 CECR2Q9BXF3 1484 aa48.43■■■■■ 5.34
ARHGEF3-208ENST00000477440 SMARCA4P51532 1647 aa48.1■■■■■ 5.29
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ARHGEF3-208ENST00000477440 MROH2BQ7Z745 1585 aa47.75■■■■■ 5.23
ARHGEF3-208ENST00000477440 NCAPD3P42695 1498 aa47.73■■■■■ 5.23
ARHGEF3-208ENST00000477440 SMARCA2P51531 1590 aa47.73■■■■■ 5.23
ARHGEF3-208ENST00000477440 PEG3Q9GZU2 1588 aa47.6■■■■■ 5.21
ARHGEF3-208ENST00000477440 HMGXB3Q12766 1538 aa47.56■■■■■ 5.2
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ARHGEF3-208ENST00000477440 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa46.53■■■■■ 5.04
ARHGEF3-208ENST00000477440 ERCC6Q03468 1493 aa46.45■■■■■ 5.03
ARHGEF3-208ENST00000477440 CADPSQ9ULU8 1353 aa46.33■■■■■ 5.01
ARHGEF3-208ENST00000477440 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa46.2■■■■■ 4.99
ARHGEF3-208ENST00000477440 PDS5BQ9NTI5 1447 aa46.15■■■■■ 4.98
ARHGEF3-208ENST00000477440 CCDC88BA6NC98 1476 aa46.14■■■■■ 4.98
ARHGEF3-208ENST00000477440 CFTRP13569 1480 aa46.07■■■■■ 4.97
ARHGEF3-208ENST00000477440 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP46.03■■■■■ 4.96
ARHGEF3-208ENST00000477440 CUX2O14529 1486 aa45.97■■■■■ 4.95
ARHGEF3-208ENST00000477440 PRDM2Q13029 1718 aa45.88■■■■■ 4.93
ARHGEF3-208ENST00000477440 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP45.87■■■■■ 4.93
ARHGEF3-208ENST00000477440 FANCD2Q9BXW9 1451 aa45.85■■■■■ 4.93
ARHGEF3-208ENST00000477440 CEP164Q9UPV0 1460 aa45.8■■■■■ 4.92
ARHGEF3-208ENST00000477440 MRC2Q9UBG0 1479 aa45.74■■■■■ 4.91
ARHGEF3-208ENST00000477440 WDR62O43379 1518 aa45.62■■■■■ 4.89
ARHGEF3-208ENST00000477440 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP45.42■■■■■ 4.86
ARHGEF3-208ENST00000477440 TOPBP1Q92547 1522 aa45.12■■■■■ 4.81
ARHGEF3-208ENST00000477440 DNMBPQ6XZF7 1577 aa45.08■■■■■ 4.81
ARHGEF3-208ENST00000477440 ABCC8Q09428 1581 aa45.04■■■■■ 4.8
ARHGEF3-208ENST00000477440 IFT140Q96RY7 1462 aa44.81■■■■■ 4.76
ARHGEF3-208ENST00000477440 CUX1P39880 1505 aa44.8■■■■■ 4.76
ARHGEF3-208ENST00000477440 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP44.74■■■■■ 4.75
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ARHGEF3-208ENST00000477440 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa44.55■■■■■ 4.72
ARHGEF3-208ENST00000477440 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa44.55■■■■■ 4.72
ARHGEF3-208ENST00000477440 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP44.54■■■■■ 4.72
ARHGEF3-208ENST00000477440 SOGA1O94964 1423 aa44.5■■■■■ 4.71
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ARHGEF3-208ENST00000477440 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa44.42■■■■■ 4.7
ARHGEF3-208ENST00000477440 SYNJ1O43426 1573 aa44.42■■■■■ 4.7
ARHGEF3-208ENST00000477440 TOP2BQ02880 1626 aa44.4■■■■■ 4.7
ARHGEF3-208ENST00000477440 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP44.38■■■■■ 4.69
ARHGEF3-208ENST00000477440 WDR97A6NE52 1622 aa44.35■■■■■ 4.69
ARHGEF3-208ENST00000477440 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP44.27■■■■■ 4.68
ARHGEF3-208ENST00000477440 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa44.18■■■■■ 4.66
ARHGEF3-208ENST00000477440 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa44.07■■■■■ 4.65
ARHGEF3-208ENST00000477440 PBRM1Q86U86 1689 aa44.05■■■■■ 4.64
ARHGEF3-208ENST00000477440 CHD1O14646 1710 aa44.03■■■■■ 4.64
ARHGEF3-208ENST00000477440 GAPVD1Q14C86 1478 aa44.02■■■■■ 4.64
ARHGEF3-208ENST00000477440 GRIN2BQ13224 1484 aa44.01■■■■■ 4.64
ARHGEF3-208ENST00000477440 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa44■■■■■ 4.63
ARHGEF3-208ENST00000477440 OSCARQ8IYS5 282 aa43.98■■■■■ 4.63
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ARHGEF3-208ENST00000477440 FBLN2P98095 1184 aa43.8■■■■■ 4.6
ARHGEF3-208ENST00000477440 SYNJ2O15056 1496 aa43.73■■■■■ 4.59
ARHGEF3-208ENST00000477440 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP43.65■■■■■ 4.58
ARHGEF3-208ENST00000477440 ADAMTS12P58397 1594 aa43.65■■■■■ 4.58
ARHGEF3-208ENST00000477440 ERICH3Q5RHP9 1530 aa43.64■■■■■ 4.58
ARHGEF3-208ENST00000477440 FHAD1B1AJZ9 1412 aa43.48■■■■■ 4.55
ARHGEF3-208ENST00000477440 KIF27Q86VH2 1401 aa43.48■■■■■ 4.55
ARHGEF3-208ENST00000477440 CLASP1Q7Z460 1538 aa43.48■■■■■ 4.55
ARHGEF3-208ENST00000477440 GRIN2AQ12879 1464 aa43.47■■■■■ 4.55
ARHGEF3-208ENST00000477440 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa43.44■■■■■ 4.55
ARHGEF3-208ENST00000477440 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa43.44■■■■■ 4.55
ARHGEF3-208ENST00000477440 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa43.44■■■■■ 4.55
ARHGEF3-208ENST00000477440 ARHGEF11O15085 1522 aa43.4■■■■■ 4.54
ARHGEF3-208ENST00000477440 CEP170Q5SW79 1584 aa43.31■■■■■ 4.52
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ARHGEF3-208ENST00000477440 TRIM41Q8WV44 630 aa43.29■■■■■ 4.52
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ARHGEF3-208ENST00000477440 NUP160Q12769 1436 aa43.26■■■■■ 4.52
ARHGEF3-208ENST00000477440 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa43.17■■■■■ 4.5
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ARHGEF3-208ENST00000477440 SHROOM2Q13796 1616 aa43■■■■■ 4.47
ARHGEF3-208ENST00000477440 ERCC6L2Q5T890 1561 aa42.91■■■■■ 4.46
ARHGEF3-208ENST00000477440 CYB5RLQ6IPT4 315 aa42.91■■■■■ 4.46
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