RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469763.5

PRKRIP1-204, Transcript of PRKR interacting protein 1, humanhuman

TSL 5

Gene PRKRIP1, Length 1,642 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKRIP1-204ENST00000469763 NISCHQ9Y2I1 1504 aa57.2■■■■■ 6.75
PRKRIP1-204ENST00000469763 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa50.62■■■■■ 5.69
PRKRIP1-204ENST00000469763 ABCC9O60706 1549 aa48.95■■■■■ 5.43
PRKRIP1-204ENST00000469763 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP47.75■■■■■ 5.23
PRKRIP1-204ENST00000469763 DCAF8L2P0C7V8 631 aa47.63■■■■■ 5.21
PRKRIP1-204ENST00000469763 NACADO15069 1562 aa47.44■■■■■ 5.18
PRKRIP1-204ENST00000469763 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa47.36■■■■■ 5.17
PRKRIP1-204ENST00000469763 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa47.34■■■■■ 5.17
PRKRIP1-204ENST00000469763 MYO15BQ96JP2 1530 aa47.32■■■■■ 5.17
PRKRIP1-204ENST00000469763 UNC13AQ9UPW8 1703 aa46.36■■■■■ 5.01
PRKRIP1-204ENST00000469763 SCRIBQ14160 1630 aa46.23■■■■■ 4.99
PRKRIP1-204ENST00000469763 BICRAQ9NZM4 1560 aa45.88■■■■■ 4.93
PRKRIP1-204ENST00000469763 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP45.85■■■■■ 4.932e-7■■■□□ 15.9
PRKRIP1-204ENST00000469763 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa45.56■■■■■ 4.88
PRKRIP1-204ENST00000469763 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP44.63■■■■■ 4.74
PRKRIP1-204ENST00000469763 CECR2Q9BXF3 1484 aa44.48■■■■■ 4.71
PRKRIP1-204ENST00000469763 DNAJC5BQ9UF47 199 aa44.39■■■■■ 4.7
PRKRIP1-204ENST00000469763 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa44.33■■■■■ 4.69
PRKRIP1-204ENST00000469763 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP44.3■■■■■ 4.68
PRKRIP1-204ENST00000469763 SMARCA4P51532 1647 aa44.27■■■■■ 4.68
PRKRIP1-204ENST00000469763 MROH2BQ7Z745 1585 aa44.09■■■■■ 4.65
PRKRIP1-204ENST00000469763 SMARCA2P51531 1590 aa43.86■■■■■ 4.61
PRKRIP1-204ENST00000469763 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa43.86■■■■■ 4.61
PRKRIP1-204ENST00000469763 PEG3Q9GZU2 1588 aa43.81■■■■■ 4.6
PRKRIP1-204ENST00000469763 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP43.79■■■■■ 4.6
PRKRIP1-204ENST00000469763 NCAPD3P42695 1498 aa43.75■■■■■ 4.59
PRKRIP1-204ENST00000469763 WIZO95785 1651 aa43.68■■■■■ 4.58
PRKRIP1-204ENST00000469763 HMGXB3Q12766 1538 aa43.59■■■■■ 4.57
PRKRIP1-204ENST00000469763 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP43.56■■■■■ 4.56
PRKRIP1-204ENST00000469763 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP43.21■■■■■ 4.51
PRKRIP1-204ENST00000469763 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP43.18■■■■■ 4.5
PRKRIP1-204ENST00000469763 CCDC88BA6NC98 1476 aa42.71■■■■■ 4.43
PRKRIP1-204ENST00000469763 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa42.53■■■■■ 4.4
PRKRIP1-204ENST00000469763 NESP48681 1621 aa42.53■■■■■ 4.4
PRKRIP1-204ENST00000469763 CADPSQ9ULU8 1353 aa42.52■■■■■ 4.4
PRKRIP1-204ENST00000469763 CFTRP13569 1480 aa42.38■■■■■ 4.37
PRKRIP1-204ENST00000469763 PDS5BQ9NTI5 1447 aa42.23■■■■■ 4.35
PRKRIP1-204ENST00000469763 PRDM2Q13029 1718 aa42.2■■■■■ 4.35
PRKRIP1-204ENST00000469763 ERCC6Q03468 1493 aa42.17■■■■■ 4.34
PRKRIP1-204ENST00000469763 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa42.09■■■■■ 4.33
PRKRIP1-204ENST00000469763 FANCD2Q9BXW9 1451 aa42.03■■■■■ 4.32
PRKRIP1-204ENST00000469763 CEP164Q9UPV0 1460 aa41.93■■■■■ 4.3
PRKRIP1-204ENST00000469763 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP41.76■■■■■ 4.27
PRKRIP1-204ENST00000469763 MRC2Q9UBG0 1479 aa41.73■■■■■ 4.27
PRKRIP1-204ENST00000469763 WDR62O43379 1518 aa41.57■■■■■ 4.25
PRKRIP1-204ENST00000469763 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP41.56■■■■■ 4.24
PRKRIP1-204ENST00000469763 CUX2O14529 1486 aa41.48■■■■■ 4.23
PRKRIP1-204ENST00000469763 ABCC8Q09428 1581 aa41.48■■■■■ 4.23
PRKRIP1-204ENST00000469763 DNMBPQ6XZF7 1577 aa41.43■■■■■ 4.22
PRKRIP1-204ENST00000469763 TOPBP1Q92547 1522 aa41.43■■■■■ 4.22
PRKRIP1-204ENST00000469763 CUX1P39880 1505 aa41.33■■■■■ 4.21
PRKRIP1-204ENST00000469763 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP41.29■■■■■ 4.2
PRKRIP1-204ENST00000469763 SYNJ1O43426 1573 aa41.15■■■■■ 4.18
PRKRIP1-204ENST00000469763 TOP2BQ02880 1626 aa41.15■■■■■ 4.18
PRKRIP1-204ENST00000469763 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa41.14■■■■■ 4.18
PRKRIP1-204ENST00000469763 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP41.11■■■■■ 4.17
PRKRIP1-204ENST00000469763 FGD5Q6ZNL6 1462 aa41.09■■■■■ 4.17
PRKRIP1-204ENST00000469763 IFT140Q96RY7 1462 aa41.01■■■■■ 4.16
PRKRIP1-204ENST00000469763 SOGA1O94964 1423 aa40.97■■■■■ 4.15
PRKRIP1-204ENST00000469763 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP40.94■■■■■ 4.14
PRKRIP1-204ENST00000469763 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa40.92■■■■■ 4.14
PRKRIP1-204ENST00000469763 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP40.78■■■■■ 4.12
PRKRIP1-204ENST00000469763 TRIM41Q8WV44 630 aa40.76■■■■■ 4.12
PRKRIP1-204ENST00000469763 WDR97A6NE52 1622 aa40.74■■■■■ 4.11
PRKRIP1-204ENST00000469763 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa40.73■■■■■ 4.11
PRKRIP1-204ENST00000469763 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP40.66■■■■■ 4.1
PRKRIP1-204ENST00000469763 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP40.66■■■■■ 4.1
PRKRIP1-204ENST00000469763 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP40.64■■■■■ 4.11e-7■■■■□ 20.9
PRKRIP1-204ENST00000469763 CHIC1Q5VXU3 224 aa40.61■■■■■ 4.09
PRKRIP1-204ENST00000469763 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa40.52■■■■■ 4.08
PRKRIP1-204ENST00000469763 GAPVD1Q14C86 1478 aa40.5■■■■■ 4.07
PRKRIP1-204ENST00000469763 PBRM1Q86U86 1689 aa40.42■■■■■ 4.06
PRKRIP1-204ENST00000469763 GRIN2BQ13224 1484 aa40.41■■■■■ 4.06
PRKRIP1-204ENST00000469763 KIF27Q86VH2 1401 aa40.39■■■■■ 4.06
PRKRIP1-204ENST00000469763 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa40.27■■■■■ 4.04
PRKRIP1-204ENST00000469763 ERICH3Q5RHP9 1530 aa40.26■■■■■ 4.04
PRKRIP1-204ENST00000469763 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP40.25■■■■■ 4.03
PRKRIP1-204ENST00000469763 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa40.19■■■■■ 4.02
PRKRIP1-204ENST00000469763 IGF1RP08069 1367 aa40.14■■■■■ 4.02
PRKRIP1-204ENST00000469763 CHD1O14646 1710 aa40.08■■■■■ 4.01
PRKRIP1-204ENST00000469763 ADAMTS12P58397 1594 aa40.08■■■■■ 4.01
PRKRIP1-204ENST00000469763 FBLN2P98095 1184 aa40.08■■■■■ 4.01
PRKRIP1-204ENST00000469763 SYNJ2O15056 1496 aa40.08■■■■■ 4.01
PRKRIP1-204ENST00000469763 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP40.05■■■■■ 4
PRKRIP1-204ENST00000469763 FHAD1B1AJZ9 1412 aa40.04■■■■■ 4
PRKRIP1-204ENST00000469763 CUL7Q14999 1698 aa40.04■■■■■ 4
PRKRIP1-204ENST00000469763 EEA1Q15075 1411 aa40■■■■□ 3.99
PRKRIP1-204ENST00000469763 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa39.93■■■■□ 3.98
PRKRIP1-204ENST00000469763 OSCARQ8IYS5 282 aa39.91■■■■□ 3.98
PRKRIP1-204ENST00000469763 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP39.89■■■■□ 3.98
PRKRIP1-204ENST00000469763 GRIN2AQ12879 1464 aa39.89■■■■□ 3.98
PRKRIP1-204ENST00000469763 CSRNP3Q8WYN3 585 aa39.88■■■■□ 3.97
PRKRIP1-204ENST00000469763 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa39.76■■■■□ 3.96
PRKRIP1-204ENST00000469763 PRXQ9BXM0 1461 aa39.74■■■■□ 3.95
PRKRIP1-204ENST00000469763 CEP170Q5SW79 1584 aa39.67■■■■□ 3.94
PRKRIP1-204ENST00000469763 NUP160Q12769 1436 aa39.66■■■■□ 3.94
PRKRIP1-204ENST00000469763 CLASP1Q7Z460 1538 aa39.59■■■■□ 3.93
PRKRIP1-204ENST00000469763 KIF21BO75037 1637 aa39.55■■■■□ 3.92
PRKRIP1-204ENST00000469763 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa39.54■■■■□ 3.92
PRKRIP1-204ENST00000469763 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa39.46■■■■□ 3.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.3 ms