RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477886.5

PRKRIP1-205, Transcript of PRKR interacting protein 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PRKRIP1, Length 986 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKRIP1-205ENST00000477886 NISCHQ9Y2I1 1504 aa59.19■■■■■ 7.07
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PRKRIP1-205ENST00000477886 ABCC9O60706 1549 aa53.07■■■■■ 6.09
PRKRIP1-205ENST00000477886 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa50.51■■■■■ 5.68
PRKRIP1-205ENST00000477886 DCAF8L2P0C7V8 631 aa50.17■■■■■ 5.62
PRKRIP1-205ENST00000477886 NACADO15069 1562 aa50.14■■■■■ 5.62
PRKRIP1-205ENST00000477886 DNAJC5BQ9UF47 199 aa49.57■■■■■ 5.53
PRKRIP1-205ENST00000477886 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP49.44■■■■■ 5.514e-7■■□□□ 14.5
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PRKRIP1-205ENST00000477886 MYO15BQ96JP2 1530 aa49.38■■■■■ 5.5
PRKRIP1-205ENST00000477886 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP49.06■■■■■ 5.44
PRKRIP1-205ENST00000477886 BICRAQ9NZM4 1560 aa48.96■■■■■ 5.43
PRKRIP1-205ENST00000477886 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa48.82■■■■■ 5.41
PRKRIP1-205ENST00000477886 SCRIBQ14160 1630 aa48.5■■■■■ 5.35
PRKRIP1-205ENST00000477886 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa48.26■■■■■ 5.32
PRKRIP1-205ENST00000477886 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa47.9■■■■■ 5.26
PRKRIP1-205ENST00000477886 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP47.8■■■■■ 5.24
PRKRIP1-205ENST00000477886 CECR2Q9BXF3 1484 aa47.75■■■■■ 5.23
PRKRIP1-205ENST00000477886 NCAPD3P42695 1498 aa46.24■■■■■ 4.99
PRKRIP1-205ENST00000477886 SMARCA4P51532 1647 aa46.19■■■■■ 4.98
PRKRIP1-205ENST00000477886 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa46.16■■■■■ 4.98
PRKRIP1-205ENST00000477886 SMARCA2P51531 1590 aa46.08■■■■■ 4.97
PRKRIP1-205ENST00000477886 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP45.97■■■■■ 4.95
PRKRIP1-205ENST00000477886 HMGXB3Q12766 1538 aa45.94■■■■■ 4.95
PRKRIP1-205ENST00000477886 ERCC6Q03468 1493 aa45.86■■■■■ 4.93
PRKRIP1-205ENST00000477886 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP45.8■■■■■ 4.92
PRKRIP1-205ENST00000477886 MROH2BQ7Z745 1585 aa45.64■■■■■ 4.9
PRKRIP1-205ENST00000477886 PEG3Q9GZU2 1588 aa45.64■■■■■ 4.9
PRKRIP1-205ENST00000477886 CUX2O14529 1486 aa45.6■■■■■ 4.89
PRKRIP1-205ENST00000477886 NESP48681 1621 aa45.59■■■■■ 4.89
PRKRIP1-205ENST00000477886 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa45.43■■■■■ 4.86
PRKRIP1-205ENST00000477886 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa45.26■■■■■ 4.84
PRKRIP1-205ENST00000477886 WIZO95785 1651 aa45.16■■■■■ 4.82
PRKRIP1-205ENST00000477886 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP45.06■■■■■ 4.8
PRKRIP1-205ENST00000477886 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa45.05■■■■■ 4.8
PRKRIP1-205ENST00000477886 PDS5BQ9NTI5 1447 aa45.01■■■■■ 4.8
PRKRIP1-205ENST00000477886 CADPSQ9ULU8 1353 aa44.89■■■■■ 4.78
PRKRIP1-205ENST00000477886 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP44.71■■■■■ 4.75
PRKRIP1-205ENST00000477886 MRC2Q9UBG0 1479 aa44.61■■■■■ 4.73
PRKRIP1-205ENST00000477886 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP44.55■■■■■ 4.72
PRKRIP1-205ENST00000477886 CEP164Q9UPV0 1460 aa44.49■■■■■ 4.71
PRKRIP1-205ENST00000477886 WDR62O43379 1518 aa44.45■■■■■ 4.71
PRKRIP1-205ENST00000477886 FANCD2Q9BXW9 1451 aa44.43■■■■■ 4.7
PRKRIP1-205ENST00000477886 CFTRP13569 1480 aa44.38■■■■■ 4.69
PRKRIP1-205ENST00000477886 PRDM2Q13029 1718 aa44.04■■■■■ 4.64
PRKRIP1-205ENST00000477886 CCDC88BA6NC98 1476 aa44.04■■■■■ 4.64
PRKRIP1-205ENST00000477886 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP44.04■■■■■ 4.64
PRKRIP1-205ENST00000477886 TRIM41Q8WV44 630 aa43.7■■■■■ 4.59
PRKRIP1-205ENST00000477886 OSCARQ8IYS5 282 aa43.6■■■■■ 4.57
PRKRIP1-205ENST00000477886 TOPBP1Q92547 1522 aa43.59■■■■■ 4.57
PRKRIP1-205ENST00000477886 IFT140Q96RY7 1462 aa43.56■■■■■ 4.56
PRKRIP1-205ENST00000477886 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP43.49■■■■■ 4.55
PRKRIP1-205ENST00000477886 ABCC8Q09428 1581 aa43.49■■■■■ 4.55
PRKRIP1-205ENST00000477886 DNMBPQ6XZF7 1577 aa43.45■■■■■ 4.55
PRKRIP1-205ENST00000477886 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP43.29■■■■■ 4.52
PRKRIP1-205ENST00000477886 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP43.17■■■■■ 4.5
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PRKRIP1-205ENST00000477886 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP43.13■■■■■ 4.52e-7■■■□□ 16.6
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PRKRIP1-205ENST00000477886 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa43.03■■■■■ 4.48
PRKRIP1-205ENST00000477886 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa43.03■■■■■ 4.48
PRKRIP1-205ENST00000477886 SOGA1O94964 1423 aa42.99■■■■■ 4.47
PRKRIP1-205ENST00000477886 CHD1O14646 1710 aa42.98■■■■■ 4.47
PRKRIP1-205ENST00000477886 FBLN2P98095 1184 aa42.97■■■■■ 4.47
PRKRIP1-205ENST00000477886 FGD5Q6ZNL6 1462 aa42.93■■■■■ 4.46
PRKRIP1-205ENST00000477886 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP42.9■■■■■ 4.46
PRKRIP1-205ENST00000477886 ARHGEF11O15085 1522 aa42.87■■■■■ 4.45
PRKRIP1-205ENST00000477886 CUX1P39880 1505 aa42.87■■■■■ 4.45
PRKRIP1-205ENST00000477886 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa42.71■■■■■ 4.43
PRKRIP1-205ENST00000477886 WDR97A6NE52 1622 aa42.71■■■■■ 4.43
PRKRIP1-205ENST00000477886 CYB5RLQ6IPT4 315 aa42.63■■■■■ 4.41
PRKRIP1-205ENST00000477886 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP42.6■■■■■ 4.41
PRKRIP1-205ENST00000477886 GRIN2BQ13224 1484 aa42.58■■■■■ 4.41
PRKRIP1-205ENST00000477886 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP42.55■■■■■ 4.4
PRKRIP1-205ENST00000477886 PBRM1Q86U86 1689 aa42.49■■■■■ 4.39
PRKRIP1-205ENST00000477886 GAPVD1Q14C86 1478 aa42.46■■■■■ 4.39
PRKRIP1-205ENST00000477886 SYNJ1O43426 1573 aa42.45■■■■■ 4.39
PRKRIP1-205ENST00000477886 ARAP1Q96P48 1450 aa42.44■■■■■ 4.38
PRKRIP1-205ENST00000477886 SYNJ2O15056 1496 aa42.42■■■■■ 4.38
PRKRIP1-205ENST00000477886 CLASP1Q7Z460 1538 aa42.38■■■■■ 4.37
PRKRIP1-205ENST00000477886 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa42.38■■■■■ 4.37
PRKRIP1-205ENST00000477886 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa42.33■■■■■ 4.37
PRKRIP1-205ENST00000477886 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP42.29■■■■■ 4.36
PRKRIP1-205ENST00000477886 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa42.23■■■■■ 4.35
PRKRIP1-205ENST00000477886 TOP2BQ02880 1626 aa42.22■■■■■ 4.35
PRKRIP1-205ENST00000477886 TRHP20396 242 aaPredicted RBP42.22■■■■■ 4.35
PRKRIP1-205ENST00000477886 ADAMTS12P58397 1594 aa42.03■■■■■ 4.32
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PRKRIP1-205ENST00000477886 FHAD1B1AJZ9 1412 aa41.9■■■■■ 4.3
PRKRIP1-205ENST00000477886 CEP170Q5SW79 1584 aa41.88■■■■■ 4.3
PRKRIP1-205ENST00000477886 ERICH3Q5RHP9 1530 aa41.87■■■■■ 4.29
PRKRIP1-205ENST00000477886 NUP160Q12769 1436 aa41.82■■■■■ 4.29
PRKRIP1-205ENST00000477886 ERCC6L2Q5T890 1561 aa41.79■■■■■ 4.28
PRKRIP1-205ENST00000477886 SHROOM2Q13796 1616 aa41.64■■■■■ 4.26
PRKRIP1-205ENST00000477886 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP41.51■■■■■ 4.24
PRKRIP1-205ENST00000477886 JPH4Q96JJ6 628 aa41.48■■■■■ 4.23
PRKRIP1-205ENST00000477886 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa41.44■■■■■ 4.22
PRKRIP1-205ENST00000477886 KIF27Q86VH2 1401 aa41.44■■■■■ 4.22
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