Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y287

ITM2B, Integral membrane protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITM2BQ9Y287 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ITM2BQ9Y287 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ITM2BQ9Y287 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ITM2BQ9Y287 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ITM2BQ9Y287 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ITM2BQ9Y287 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ITM2BQ9Y287 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ITM2BQ9Y287 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
ITM2BQ9Y287 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ITM2BQ9Y287 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ITM2BQ9Y287 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ITM2BQ9Y287 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ITM2BQ9Y287 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ITM2BQ9Y287 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ITM2BQ9Y287 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ITM2BQ9Y287 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ITM2BQ9Y287 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ITM2BQ9Y287 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ITM2BQ9Y287 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ITM2BQ9Y287 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ITM2BQ9Y287 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
ITM2BQ9Y287 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ITM2BQ9Y287 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ITM2BQ9Y287 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ITM2BQ9Y287 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ITM2BQ9Y287 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ITM2BQ9Y287 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ITM2BQ9Y287 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ITM2BQ9Y287 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ITM2BQ9Y287 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ITM2BQ9Y287 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ITM2BQ9Y287 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ITM2BQ9Y287 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ITM2BQ9Y287 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ITM2BQ9Y287 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ITM2BQ9Y287 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ITM2BQ9Y287 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ITM2BQ9Y287 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ITM2BQ9Y287 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ITM2BQ9Y287 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ITM2BQ9Y287 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ITM2BQ9Y287 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ITM2BQ9Y287 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ITM2BQ9Y287 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ITM2BQ9Y287 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ITM2BQ9Y287 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ITM2BQ9Y287 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
ITM2BQ9Y287 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ITM2BQ9Y287 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ITM2BQ9Y287 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ITM2BQ9Y287 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ITM2BQ9Y287 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ITM2BQ9Y287 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ITM2BQ9Y287 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ITM2BQ9Y287 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ITM2BQ9Y287 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
ITM2BQ9Y287 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ITM2BQ9Y287 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ITM2BQ9Y287 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ITM2BQ9Y287 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ITM2BQ9Y287 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
ITM2BQ9Y287 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ITM2BQ9Y287 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ITM2BQ9Y287 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ITM2BQ9Y287 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ITM2BQ9Y287 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ITM2BQ9Y287 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ITM2BQ9Y287 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ITM2BQ9Y287 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ITM2BQ9Y287 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ITM2BQ9Y287 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ITM2BQ9Y287 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
ITM2BQ9Y287 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ITM2BQ9Y287 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ITM2BQ9Y287 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ITM2BQ9Y287 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ITM2BQ9Y287 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ITM2BQ9Y287 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ITM2BQ9Y287 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ITM2BQ9Y287 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ITM2BQ9Y287 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ITM2BQ9Y287 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ITM2BQ9Y287 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ITM2BQ9Y287 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ITM2BQ9Y287 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ITM2BQ9Y287 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ITM2BQ9Y287 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ITM2BQ9Y287 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ITM2BQ9Y287 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ITM2BQ9Y287 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ITM2BQ9Y287 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ITM2BQ9Y287 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ITM2BQ9Y287 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ITM2BQ9Y287 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ITM2BQ9Y287 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ITM2BQ9Y287 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ITM2BQ9Y287 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ITM2BQ9Y287 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ITM2BQ9Y287 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ITM2BQ9Y287 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 146.1 ms