Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUL3

STAU2, Double-stranded RNA-binding protein Staufen homolog 2, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 570 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAU2Q9NUL3 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.221e-8■□□□□ 9
STAU2Q9NUL3 CTBP1-214ENST00000514495 564 ntTSL 227.89■■■□□ 2.061e-6■□□□□ 8.9
STAU2Q9NUL3 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.791e-6■□□□□ 8.9
STAU2Q9NUL3 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.411e-6■□□□□ 8.9
STAU2Q9NUL3 CTBP1-217ENST00000515399 985 ntTSL 320.08■□□□□ 0.811e-6■□□□□ 8.9
STAU2Q9NUL3 CTBP1-208ENST00000506180 843 ntTSL 518.37■□□□□ 0.531e-6■□□□□ 8.9
STAU2Q9NUL3 CTBP1-213ENST00000514210 856 ntTSL 215.42■□□□□ 0.061e-6■□□□□ 8.9
STAU2Q9NUL3 CTBP1-212ENST00000513420 704 ntTSL 314.76□□□□□ -0.051e-6■□□□□ 8.9
STAU2Q9NUL3 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.383e-8■□□□□ 8.9
STAU2Q9NUL3 SLC2A1-208ENST00000630287 2398 ntTSL 516.11■□□□□ 0.171e-24■□□□□ 8.9
STAU2Q9NUL3 SLC2A1-203ENST00000426263 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.371e-24■□□□□ 8.9
STAU2Q9NUL3 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.359e-7■□□□□ 8.8
STAU2Q9NUL3 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.249e-7■□□□□ 8.8
STAU2Q9NUL3 DOT1L-203ENST00000452696 624 ntTSL 315□□□□□ -0.019e-7■□□□□ 8.8
STAU2Q9NUL3 GJB1-201ENST00000361726 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.067e-13■□□□□ 8.8
STAU2Q9NUL3 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.077e-13■□□□□ 8.8
STAU2Q9NUL3 DOT1L-205ENST00000478937 638 ntTSL 313.53□□□□□ -0.249e-7■□□□□ 8.8
STAU2Q9NUL3 GJB1-202ENST00000374022 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.287e-13■□□□□ 8.8
STAU2Q9NUL3 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.883e-6■□□□□ 8.8
STAU2Q9NUL3 COL27A1-207ENST00000494090 5329 ntTSL 1 (best)19.91■□□□□ 0.783e-6■□□□□ 8.8
STAU2Q9NUL3 RBM14-RBM4-202ENST00000421355 2034 ntTSL 219.8■□□□□ 0.763e-6■□□□□ 8.8
STAU2Q9NUL3 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.683e-6■□□□□ 8.8
STAU2Q9NUL3 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.63e-6■□□□□ 8.8
STAU2Q9NUL3 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.573e-6■□□□□ 8.8
STAU2Q9NUL3 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.453e-6■□□□□ 8.8
STAU2Q9NUL3 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.413e-6■□□□□ 8.8
STAU2Q9NUL3 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.333e-6■□□□□ 8.8
STAU2Q9NUL3 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.273e-6■□□□□ 8.8
STAU2Q9NUL3 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.233e-6■□□□□ 8.8
STAU2Q9NUL3 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.143e-6■□□□□ 8.8
STAU2Q9NUL3 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.123e-6■□□□□ 8.8
STAU2Q9NUL3 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.093e-6■□□□□ 8.8
STAU2Q9NUL3 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.043e-6■□□□□ 8.8
STAU2Q9NUL3 RBM14-RBM4-204ENST00000511114 523 ntTSL 412.58□□□□□ -0.43e-6■□□□□ 8.8
STAU2Q9NUL3 CUX1-210ENST00000497815 947 ntTSL 212.3□□□□□ -0.443e-6■□□□□ 8.8
STAU2Q9NUL3 CUX1-202ENST00000292538 2930 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.483e-6■□□□□ 8.8
STAU2Q9NUL3 CUX1-212ENST00000547394 2878 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.543e-6■□□□□ 8.8
STAU2Q9NUL3 CUX1-204ENST00000393824 2331 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.623e-6■□□□□ 8.8
STAU2Q9NUL3 CUX1-221ENST00000622516 2990 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.623e-6■□□□□ 8.8
STAU2Q9NUL3 CUX1-205ENST00000425244 2776 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.633e-6■□□□□ 8.8
STAU2Q9NUL3 AL132780.3-201ENST00000555074 835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.713e-6■□□□□ 8.8
STAU2Q9NUL3 SMARCD1-205ENST00000548573 2095 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.773e-6■□□□□ 8.8
STAU2Q9NUL3 SMARCD1-206ENST00000549274 611 ntTSL 310.1□□□□□ -0.793e-6■□□□□ 8.8
STAU2Q9NUL3 CUX1-203ENST00000360264 13762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.813e-6■□□□□ 8.8
STAU2Q9NUL3 CUX1-216ENST00000558469 588 ntTSL 49.95□□□□□ -0.823e-6■□□□□ 8.8
STAU2Q9NUL3 CUX1-206ENST00000437600 3031 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.823e-6■□□□□ 8.8
STAU2Q9NUL3 AJUBA-203ENST00000397388 2648 ntTSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.873e-6■□□□□ 8.8
STAU2Q9NUL3 CUX1-201ENST00000292535 13747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.873e-6■□□□□ 8.8
STAU2Q9NUL3 SMARCD1-207ENST00000549526 401 ntTSL 58.05□□□□□ -1.123e-6■□□□□ 8.8
STAU2Q9NUL3 CUX1-220ENST00000607092 559 ntTSL 36.21□□□□□ -1.423e-6■□□□□ 8.8
STAU2Q9NUL3 SFT2D2-201ENST00000271375 11040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.513e-6■□□□□ 8.8
STAU2Q9NUL3 PLXNB1-209ENST00000466353 626 ntTSL 318.93■□□□□ 0.623e-9■□□□□ 8.8
STAU2Q9NUL3 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.153e-9■□□□□ 8.8
STAU2Q9NUL3 PLXNB1-201ENST00000296440 7143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.233e-9■□□□□ 8.8
STAU2Q9NUL3 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.994e-8■□□□□ 8.7
STAU2Q9NUL3 NEAT1-202ENST00000501122 22743 ntBASIC4.65□□□□□ -1.664e-61■□□□□ 8.7
STAU2Q9NUL3 SMG1P3-202ENST00000437413 589 ntTSL 422.51■■□□□ 1.194e-6■□□□□ 8.6
STAU2Q9NUL3 SMG1P3-201ENST00000435197 416 ntTSL 318.16■□□□□ 0.54e-6■□□□□ 8.6
STAU2Q9NUL3 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.324e-6■□□□□ 8.6
STAU2Q9NUL3 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.065e-11■□□□□ 8.6
STAU2Q9NUL3 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.741e-7■□□□□ 8.6
STAU2Q9NUL3 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.971e-7■□□□□ 8.6
STAU2Q9NUL3 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.821e-7■□□□□ 8.6
STAU2Q9NUL3 SAE1-207ENST00000596995 2106 ntTSL 219.96■□□□□ 0.791e-7■□□□□ 8.6
STAU2Q9NUL3 SAE1-204ENST00000414294 2211 ntTSL 219.81■□□□□ 0.761e-7■□□□□ 8.6
STAU2Q9NUL3 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.321e-7■□□□□ 8.6
STAU2Q9NUL3 APOBEC3C-202ENST00000428892 1056 ntTSL 310.97□□□□□ -0.652e-6■□□□□ 8.6
STAU2Q9NUL3 SLC5A9-202ENST00000425816 1950 ntTSL 1 (best)16.24■□□□□ 0.191e-6■□□□□ 8.5
STAU2Q9NUL3 SLC5A9-204ENST00000441260 1046 ntTSL 216.23■□□□□ 0.191e-6■□□□□ 8.5
STAU2Q9NUL3 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.111e-6■□□□□ 8.5
STAU2Q9NUL3 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.061e-6■□□□□ 8.5
STAU2Q9NUL3 NACC2-202ENST00000371753 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.081e-6■□□□□ 8.5
STAU2Q9NUL3 SLC5A9-210ENST00000533824 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.161e-6■□□□□ 8.5
STAU2Q9NUL3 SLC5A9-203ENST00000438567 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31e-6■□□□□ 8.5
STAU2Q9NUL3 ST6GAL1-215ENST00000457772 3947 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.321e-6■□□□□ 8.5
STAU2Q9NUL3 SLC5A9-206ENST00000493837 3769 ntTSL 210.74□□□□□ -0.691e-6■□□□□ 8.5
STAU2Q9NUL3 SLC5A9-201ENST00000236495 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.771e-6■□□□□ 8.5
STAU2Q9NUL3 ST6GAL1-220ENST00000470633 4893 ntTSL 27.43□□□□□ -1.221e-6■□□□□ 8.5
STAU2Q9NUL3 ST6GAL1-211ENST00000448044 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.261e-6■□□□□ 8.5
STAU2Q9NUL3 OAZ1-204ENST00000588673 780 ntTSL 320.85■□□□□ 0.939e-8■□□□□ 8.5
STAU2Q9NUL3 OAZ1-209ENST00000592787 857 ntTSL 216.61■□□□□ 0.259e-8■□□□□ 8.5
STAU2Q9NUL3 OAZ1-205ENST00000589361 679 ntTSL 1 (best)16.44■□□□□ 0.229e-8■□□□□ 8.5
STAU2Q9NUL3 SYVN1-212ENST00000530451 656 ntTSL 519.3■□□□□ 0.682e-8■□□□□ 8.5
STAU2Q9NUL3 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.542e-8■□□□□ 8.5
STAU2Q9NUL3 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.462e-8■□□□□ 8.5
STAU2Q9NUL3 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.352e-8■□□□□ 8.5
STAU2Q9NUL3 CTSB-203ENST00000420692 2230 ntTSL 216.92■□□□□ 0.32e-8■□□□□ 8.5
STAU2Q9NUL3 SYVN1-204ENST00000449943 4547 ntTSL 211.82□□□□□ -0.522e-8■□□□□ 8.5
STAU2Q9NUL3 SYVN1-206ENST00000526060 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.532e-8■□□□□ 8.5
STAU2Q9NUL3 JPT2-206ENST00000562684 3185 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.322e-6■□□□□ 8.4
STAU2Q9NUL3 JPT2-201ENST00000248098 3718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.382e-6■□□□□ 8.4
STAU2Q9NUL3 JPT2-205ENST00000562569 458 ntTSL 36.48□□□□□ -1.372e-6■□□□□ 8.4
STAU2Q9NUL3 EFHC1-204ENST00000491749 496 ntTSL 425.43■■□□□ 1.668e-6■□□□□ 8.4
STAU2Q9NUL3 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.718e-6■□□□□ 8.4
STAU2Q9NUL3 EFHC1-235ENST00000637849 2746 ntTSL 516.27■□□□□ 0.198e-6■□□□□ 8.4
STAU2Q9NUL3 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.198e-6■□□□□ 8.4
STAU2Q9NUL3 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.128e-6■□□□□ 8.4
STAU2Q9NUL3 SLC35D1-201ENST00000235345 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.098e-6■□□□□ 8.4
STAU2Q9NUL3 CAPRIN1-212ENST00000532820 3438 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.168e-6■□□□□ 8.4
STAU2Q9NUL3 PAQR8-203ENST00000512121 582 ntTSL 313.61□□□□□ -0.238e-6■□□□□ 8.4
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