Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUL3

STAU2, Double-stranded RNA-binding protein Staufen homolog 2, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 570 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAU2Q9NUL3 FP236383.1-201ENST00000623860 2498 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.318e-20■■■■■ 40.4
STAU2Q9NUL3 SNORD3B-1-201ENST00000577988 758 ntBASIC14.21□□□□□ -0.133e-11■■■■■ 35.5
STAU2Q9NUL3 SNORD3B-1-203ENST00000631292 217 nt11.53□□□□□ -0.563e-11■■■■■ 35.5
STAU2Q9NUL3 SNORD3B-1-202ENST00000617128 218 nt11.44□□□□□ -0.583e-11■■■■■ 35.5
STAU2Q9NUL3 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.063e-22■■■■■ 33.7
STAU2Q9NUL3 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.523e-22■■■■■ 33.7
STAU2Q9NUL3 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.353e-22■■■■■ 33.7
STAU2Q9NUL3 NUTF2-208ENST00000587481 2608 nt9.9□□□□□ -0.823e-22■■■■■ 33.7
STAU2Q9NUL3 COMMD4-213ENST00000565834 1671 ntTSL 519.52■□□□□ 0.713e-10■■■■■ 33.7
STAU2Q9NUL3 COMMD4-208ENST00000563220 1897 ntTSL 218.85■□□□□ 0.613e-10■■■■■ 33.7
STAU2Q9NUL3 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.233e-10■■■■■ 33.7
STAU2Q9NUL3 COMMD4-206ENST00000562610 850 ntTSL 316.46■□□□□ 0.233e-10■■■■■ 33.7
STAU2Q9NUL3 COMMD4-215ENST00000566843 2284 ntTSL 216.17■□□□□ 0.183e-10■■■■■ 33.7
STAU2Q9NUL3 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.153e-10■■■■■ 33.7
STAU2Q9NUL3 COMMD4-221ENST00000567935 502 ntTSL 315.2■□□□□ 0.023e-10■■■■■ 33.7
STAU2Q9NUL3 COMMD4-225ENST00000569245 867 ntTSL 214.68□□□□□ -0.063e-10■■■■■ 33.7
STAU2Q9NUL3 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.153e-10■■■■■ 33.7
STAU2Q9NUL3 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.153e-10■■■■■ 33.7
STAU2Q9NUL3 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.153e-10■■■■■ 33.7
STAU2Q9NUL3 COMMD4-209ENST00000564068 4204 nt13.12□□□□□ -0.313e-10■■■■■ 33.7
STAU2Q9NUL3 COMMD4-203ENST00000480484 3225 ntTSL 1 (best)10.29□□□□□ -0.763e-10■■■■■ 33.7
STAU2Q9NUL3 FP671120.1-201ENST00000623664 2498 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.318e-10■■■■■ 32.2
STAU2Q9NUL3 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.382e-6■■■■■ 31.2
STAU2Q9NUL3 MCRIP1-209ENST00000575090 752 ntTSL 322.84■■□□□ 1.252e-6■■■■■ 31.2
STAU2Q9NUL3 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.162e-6■■■■■ 31.2
STAU2Q9NUL3 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.142e-6■■■■■ 31.2
STAU2Q9NUL3 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.92e-6■■■■■ 31.2
STAU2Q9NUL3 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.812e-6■■■■■ 31.2
STAU2Q9NUL3 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.462e-6■■■■■ 31.2
STAU2Q9NUL3 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.442e-6■■■■■ 31.2
STAU2Q9NUL3 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.062e-6■■■■■ 31.2
STAU2Q9NUL3 MCRIP1-212ENST00000576730 2979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.222e-6■■■■■ 31.2
STAU2Q9NUL3 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.073e-9■■■■■ 30.8
STAU2Q9NUL3 H2AFX-201ENST00000375167 1373 ntTSL 216.64■□□□□ 0.263e-9■■■■■ 30.8
STAU2Q9NUL3 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.245e-9■■■■■ 29.4
STAU2Q9NUL3 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.95e-9■■■■■ 29.4
STAU2Q9NUL3 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.865e-9■■■■■ 29.4
STAU2Q9NUL3 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.855e-9■■■■■ 29.4
STAU2Q9NUL3 Z98883.1-201ENST00000409439 916 ntTSL 320.36■□□□□ 0.855e-9■■■■■ 29.4
STAU2Q9NUL3 PIGQ-202ENST00000293874 603 ntTSL 419.38■□□□□ 0.695e-9■■■■■ 29.4
STAU2Q9NUL3 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.615e-9■■■■■ 29.4
STAU2Q9NUL3 PIGQ-207ENST00000439574 586 ntTSL 318.51■□□□□ 0.555e-9■■■■■ 29.4
STAU2Q9NUL3 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.385e-9■■■■■ 29.4
STAU2Q9NUL3 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.375e-9■■■■■ 29.4
STAU2Q9NUL3 MINK1-209ENST00000574453 4941 ntTSL 1 (best)16.91■□□□□ 0.35e-9■■■■■ 29.4
STAU2Q9NUL3 PIGQ-221ENST00000636657 2841 ntTSL 516.74■□□□□ 0.275e-9■■■■■ 29.4
STAU2Q9NUL3 MINK1-207ENST00000572330 5299 ntTSL 516.46■□□□□ 0.235e-9■■■■■ 29.4
STAU2Q9NUL3 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.145e-9■■■■■ 29.4
STAU2Q9NUL3 MINK1-203ENST00000453408 3939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.325e-9■■■■■ 29.4
STAU2Q9NUL3 MINK1-213ENST00000577021 675 ntTSL 59.66□□□□□ -0.865e-9■■■■■ 29.4
STAU2Q9NUL3 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.171e-7■■■■■ 28.2
STAU2Q9NUL3 RHBG-208ENST00000620376 1984 ntTSL 222.86■■□□□ 1.251e-8■■■■■ 27.9
STAU2Q9NUL3 RHBG-201ENST00000451864 1927 ntTSL 222.31■■□□□ 1.161e-8■■■■■ 27.9
STAU2Q9NUL3 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.441e-8■■■■■ 27.9
STAU2Q9NUL3 RHBG-205ENST00000612897 1862 ntTSL 1 (best)17.63■□□□□ 0.411e-8■■■■■ 27.9
STAU2Q9NUL3 RHBG-206ENST00000613460 1912 ntTSL 1 (best)14.6□□□□□ -0.071e-8■■■■■ 27.9
STAU2Q9NUL3 RHBG-207ENST00000618120 2424 ntTSL 214.08□□□□□ -0.161e-8■■■■■ 27.9
STAU2Q9NUL3 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.653e-9■■■■■ 27.9
STAU2Q9NUL3 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.423e-9■■■■■ 27.9
STAU2Q9NUL3 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.383e-9■■■■■ 27.9
STAU2Q9NUL3 DNAJA3-212ENST00000576180 2288 ntTSL 213.74□□□□□ -0.213e-9■■■■■ 27.9
STAU2Q9NUL3 DNAJA3-209ENST00000574393 577 ntTSL 313.11□□□□□ -0.313e-9■■■■■ 27.9
STAU2Q9NUL3 FCF1-201ENST00000341162 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.231e-8■■■■■ 27.1
STAU2Q9NUL3 CAPN15-205ENST00000567216 3174 ntTSL 1 (best)20.78■□□□□ 0.921e-7■■■■■ 26.9
STAU2Q9NUL3 CNN2-209ENST00000568865 1332 ntTSL 519.52■□□□□ 0.725e-8■■■■□ 26.5
STAU2Q9NUL3 CNN2-212ENST00000607102 307 ntTSL 1 (best)16.76■□□□□ 0.275e-8■■■■□ 26.5
STAU2Q9NUL3 CNN2-210ENST00000569352 731 ntTSL 515.44■□□□□ 0.065e-8■■■■□ 26.5
STAU2Q9NUL3 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.015e-8■■■■□ 26.5
STAU2Q9NUL3 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.015e-8■■■■□ 26.5
STAU2Q9NUL3 CNN2-204ENST00000562075 623 ntTSL 1 (best)14.91□□□□□ -0.025e-8■■■■□ 26.5
STAU2Q9NUL3 CNN2-202ENST00000348419 2033 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.075e-8■■■■□ 26.5
STAU2Q9NUL3 CNN2-208ENST00000566695 828 ntTSL 212.49□□□□□ -0.415e-8■■■■□ 26.5
STAU2Q9NUL3 CNN2-207ENST00000565096 2109 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.415e-8■■■■□ 26.5
STAU2Q9NUL3 CNN2-211ENST00000606983 537 ntTSL 311.66□□□□□ -0.545e-8■■■■□ 26.5
STAU2Q9NUL3 CLASP1-201ENST00000263710 8092 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.72e-8■■■■□ 25.6
STAU2Q9NUL3 CLASP1-212ENST00000480007 569 ntTSL 49.45□□□□□ -0.92e-8■■■■□ 25.6
STAU2Q9NUL3 CLASP1-207ENST00000452274 3966 ntTSL 59.35□□□□□ -0.912e-8■■■■□ 25.6
STAU2Q9NUL3 CLASP1-203ENST00000409078 8002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.922e-8■■■■□ 25.6
STAU2Q9NUL3 CLASP1-215ENST00000541377 7909 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.922e-8■■■■□ 25.6
STAU2Q9NUL3 CLASP1-202ENST00000397587 7915 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.962e-8■■■■□ 25.6
STAU2Q9NUL3 CLASP1-208ENST00000455322 5660 ntTSL 5 BASIC8.81□□□□□ -12e-8■■■■□ 25.6
STAU2Q9NUL3 CLASP1-211ENST00000474065 516 ntTSL 37.86□□□□□ -1.152e-8■■■■□ 25.6
STAU2Q9NUL3 CLASP1-205ENST00000430234 582 ntTSL 47.19□□□□□ -1.262e-8■■■■□ 25.6
STAU2Q9NUL3 CLASP1-206ENST00000449975 555 ntTSL 45.38□□□□□ -1.552e-8■■■■□ 25.6
STAU2Q9NUL3 CLASP1-204ENST00000418989 663 ntTSL 45.26□□□□□ -1.572e-8■■■■□ 25.6
STAU2Q9NUL3 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.584e-10■■■■□ 25.4
STAU2Q9NUL3 CMIP-211ENST00000621537 4000 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.674e-10■■■■□ 25.4
STAU2Q9NUL3 MSI2-210ENST00000579505 577 ntTSL 318.4■□□□□ 0.541e-7■■■■□ 25.1
STAU2Q9NUL3 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.221e-7■■■■□ 25.1
STAU2Q9NUL3 MSI2-207ENST00000579205 500 ntTSL 415.42■□□□□ 0.061e-7■■■■□ 25.1
STAU2Q9NUL3 FZR1-207ENST00000591290 1331 ntTSL 520.17■□□□□ 0.823e-7■■■■□ 24.3
STAU2Q9NUL3 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.553e-7■■■■□ 24.3
STAU2Q9NUL3 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.533e-7■■■■□ 24.3
STAU2Q9NUL3 FZR1-208ENST00000592214 598 ntTSL 315.69■□□□□ 0.13e-7■■■■□ 24.3
STAU2Q9NUL3 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.013e-7■■■■□ 24.3
STAU2Q9NUL3 SH3BP4-204ENST00000416021 593 ntTSL 321.49■■□□□ 1.032e-6■■■■□ 24
STAU2Q9NUL3 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.482e-6■■■■□ 24
STAU2Q9NUL3 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.646e-7■■■■□ 23.9
STAU2Q9NUL3 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.286e-7■■■■□ 23.9
STAU2Q9NUL3 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.216e-7■■■■□ 23.9
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